查询分子优化任务

功能介绍

通过分子优化任务ID查询分子优化任务状态及结果。

URI

GET /v1/{project_id}/task/optimization/{task_id}

表1 路径参数
参数	是否必选	参数类型	描述
project_id	是	String	华为云项目id
task_id	是	String	分子优化任务ID

请求参数

表2 请求Header参数
参数	是否必选	参数类型	描述
X-Auth-Token	是	String	用户 token

响应参数

状态码： 200

表3 响应Body参数
参数	参数类型	描述
status	String	异步任务的状态：等待中、运行中、已完成、失败枚举值： waiting running finished failed
task_data	OptimizationTaskData object	分子优化任务的请求体
result	OptimizationResult object	分子优化任务的返回结果

表4 OptimizationTaskData
参数	参数类型	描述
smiles	String	分子SMILES表达式
num_trials	Integer	生成分子数量
strong_constraints	Array of MoleculeConstraint objects	强约束集合
weak_constraints	Array of MoleculeConstraint objects	弱约束集合
num_expected	Integer	期望最大返回条目数（排序后取Top）
binding_site	BindingSite object	结合位点
custom_props	Array of CustomProp objects	用户已开启的自定义属性集合

表5 OptimizationResult
参数	参数类型	描述
name	String	任务名最小长度：1 最大长度：128
smiles	String	分子SMILES表达式
num_rounds	Integer	总生成轮数
num_trials_per_round	Integer	每轮生成数量
num_expected	Integer	期望条目数
num_strong_constraints	Integer	强约束数量
num_weak_constraints	Integer	弱约束数量
prop_names	Array of strings	分子ADMET属性名列表
original	PlainMoleculeItem object	先导小分子的ADMET属性
result	Array of OptimizationResultItem objects	分子优化结果条目
strong_constraints	Array of MoleculeConstraint objects	强约束集合
weak_constraints	Array of MoleculeConstraint objects	弱约束集合
binding_site	BindingSite object	结合位点
custom_props	Array of CustomProp objects	用户已开启的自定义属性集合

表6 PlainMoleculeItem
参数	参数类型	描述
smiles	String	分子SMILES表达式
props	Array of objects	分子ADMET属性值列表

表7 OptimizationResultItem
参数	参数类型	描述
smiles	String	分子SMILES表达式
props	Array of objects	分子ADMET属性值列表
similarity	Number	分子与初始分子的相似度
num_fulfilled_weak_constraints	Integer	分子所满足的弱约束数量
score	Number	分子的打分

表8 MoleculeConstraint
参数	参数类型	描述
name	String	属性名称
type	String	属性约束类型枚举值： bool range struct minimize maximize
bool	Boolean	属性约束类型bool的参数
range	Array of numbers	属性约束类型range的参数
struct	StructureConstraintParams object	结构约束参数
quantiles	Array of numbers	属性约束类型minimize和maximize的参数最小值：0.0 最大值：1.0

表9 StructureConstraintParams
参数	参数类型	描述
structs	Array of strings	子结构SMILES
exclusive	Boolean	是否排除子结构
operator	String	多个子结构之间的逻辑关系缺省值：or 枚举值： or and

**表10** BindingSite
参数	参数类型	描述
protein	String	蛋白质3D结构，使用gzip压缩然后转base64格式最小长度：1 最大长度：10000000
bounding_box	BoundingBox object	结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小

**表11** BoundingBox
参数	参数类型	描述
center	Array of numbers	口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标
size	Array of numbers	口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小最小值：1.7 最大值：500

**表12** CustomProp
参数	参数类型	描述
id	String	自定义属性的ID（API侧）最小长度：1 最大长度：64
prop_definition	PropDefinition object	属性定义的元信息

**表13** PropDefinition
参数	参数类型	描述
id	String	属性业务侧ID 最小长度：1 最大长度：128
name	String	属性名称最小长度：1 最大长度：32
type	String	属性类型枚举值： binary numerical
description	String	属性具体描述信息最小长度：0 最大长度：256
value_range	ValueRange object	属性有效值域区间
optimal_range	ValueRange object	属性最优值域区间
warning_range	ValueRange object	属性欠佳值域区间
style	String	模型参数呈现类型枚举值： number probability
confidential_interval	Boolean	模型推理是否呈现置信区间

**表14** ValueRange
参数	参数类型	描述
lower	Number	值域下限
lower_inclusive	Boolean	是否包含值域下限
upper	Number	值域上限
upper_inclusive	Boolean	是否包含值域上限

请求示例

无

响应示例

状态码： 200

分子优化任务查询成功响应

{
  "status" : "finished",
  "result" : {
    "name" : "87ba6b54-2288-4a5d-90a2-3db01c22a9d2",
    "num_rounds" : 10,
    "num_expected" : 1000,
    "num_strong_constraints" : 0,
    "num_weak_constraints" : 5,
    "custom_props" : [ {
      "id" : "3b2dce64-c244-11ed-acf5-0255ac100017",
      "prop_definition" : {
        "id" : "c4c07032d1934671a0dfe3bd10416eea",
        "name" : "custom_prop_name",
        "type" : "numerical",
        "description" : "custom_prop_description"
      }
    } ],
    "prop_names" : [ "formula", "ab", "acute_toxicity_rule", "bace", "3b2dce64-c244-11ed-acf5-0255ac100017", "3b2dce64-c244-11ed-acf5-0255ac100017_std" ],
    "original" : {
      "smiles" : "c1ccccc1",
      "props" : [ "C6H6", "base", 0, 0.128335, 0.43, 0.28 ]
    },
    "result" : [ {
      "smiles" : "c1ccccc1",
      "num_fulfilled_weak_constraints" : 3,
      "similarity" : 0.8,
      "score" : 0.388029,
      "props" : [ "C6H6", "base", 0, 0.128335, 0.43, 0.28 ]
    }, {
      "smiles" : "C1CCCCC1",
      "num_fulfilled_weak_constraints" : 2,
      "similarity" : 0.6,
      "score" : 0.304194,
      "props" : [ "C6H12", "base", 0, 0.163034, 0.43, 0.28 ]
    } ],
    "weak_constraints" : [ {
      "name" : "mw",
      "type" : "range",
      "range" : [ 100, 600 ]
    }, {
      "name" : "nhet",
      "type" : "range",
      "range" : [ 0, 15 ]
    }, {
      "name" : "fsp3",
      "type" : "range",
      "range" : [ 0.07317073170731707, null ]
    }, {
      "name" : "qedmean",
      "type" : "maximize"
    }, {
      "name" : "sascore",
      "type" : "minimize",
      "quantiles" : [ 0.1, 0.9 ]
    } ],
    "strong_constraints" : [ {
      "name" : "mw",
      "type" : "range",
      "range" : [ 100, 600 ]
    } ],
    "binding_site" : {
      "protein" : "H4sIAK8LamMC/3MM8fdVAANDBQU/IOUY7KfgqKBgYgEVNdAzMDACMfRMTAwUFIyN9EwsDUFcAyDPQA+mDgz8AHV0WkpOAAAA",
      "bounding_box" : {
        "center" : [ 1.3, 23.4, -14.5 ],
        "size" : [ 10.0, 10.0, 10.0 ]
      }
    }
  }
}