更新时间:2024-05-20 GMT+08:00
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自定义数据库

盘古辅助制药平台支持用户自定义数据库,可以上传自己的数据构建自己的数据库,进行后续的分子搜索。构建自定义数据库需要先购买CSS资源和绑定CSS资源,详情见资源中心

自定义数据库

返回主页,单击“自定义数据库”进入界面,单击页面左上角的“创建数据库”,并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。

图1 创建数据库

  • 名称:数据库名称。长度为5-32个字符,首位需小写英文字母开头,仅可以使用小写字母、数字、下划线“_”和中划线“-”。最终租户下的所有用户数据库名称不能重名,可以和官方数据库名称重名,不区分大小写。目前支持的官方数据库有DrugBank、ZINC、TopSciense、DrugSpaceX。
  • 描述:输入数据库描述,支持中英文,上限为1024个字符。
  • CSS集群名称:选择已经绑定好的CSS集群,将会在这个集群上构建数据库。
  • 数据文件:输入数据库文件,仅支持CSV格式,文件不大于1G,数据条数支持最多5,000,000条,超过5,000,000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”,不区分大小写。文件不允许有中文,数据库小分子会自动去重。
  • 数据文件列名:选择数据库列名,仅解析前100个列名,支持选择12个列名保存到数据库。
  • 组织共享:

    如果关闭,则该数据库只能自己使用。

    如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。

    默认为关闭。

数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库,可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下:

  • 可用:数据库正常,可以进行分子搜索使用。
  • 等待中:数据库创建任务正在等待。
  • 创建失败:数据库创建失败。
  • 创建中:数据库正在创建。
  • 追加中:数据库正在追加,此时数据库可以正常使用,搜索的数据库是正在追加过程的数据库。
  • 异常:数据库异常,可能是由于CSS到期、CSS密码改变、CSS资源解绑等问题导致数据库异常。
图2 删除数据库和追加数据

可以通过“追加数据”到数据库来增加数据条数。每次追加最多追加500万条数据。

图3 追加数据

CSS相关常见问题请参考常见问题文档中的CSS章节。

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