医疗智能体 EIHealth
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产品介绍
图解医疗智能体
AI药物研究
AI基因组研究
什么是医疗智能体
盘古辅助制药平台
应用场景
基本概念
EIHealth平台
应用场景
基本概念
计费说明
与其他云服务的关系
约束与限制
配额说明
快速入门
登录平台
购买计算资源(主账号操作)
计算资源说明
资源看板
计算资源
存储资源
性能加速(可选)
数据库(可选)
创建项目
上传小于1GB数据
上传大于1GB数据
下载数据
运行作业
方式1:使用预置的NGS流程
方式2:使用预置应用搭建NGS流程
方式3:自定义镜像运行FastQC流程
运行大规模虚拟药筛任务
药物数据输入格式说明
订阅Docking Summary流程
新建研究
查看药筛结果
查看药筛作业和结果下载
配置命令行工具
步骤1:获取认证信息
步骤2:获取命令行工具
步骤3:初始化配置
入门实践
用户指南
用户指南(盘古辅助制药)
欢迎使用盘古辅助制药平台
关键概念
准备工作
购买服务
购买资源
购买CSS资源
配额管理
系统设置
用户管理
创建子用户
导入用户
管理用户
用户权限介绍
资源中心
标签管理
个人设置
项目管理
项目简介
创建项目
项目成员和权限
功能模块
靶点发现
靶点口袋发现
靶点优化
苗头化合物发现
分子对接
分子属性预测
分子搜索
CPI预测
分子生成
先导化合物优化
分子优化
靶点口袋分子设计
自由能微扰
合成路径规划
通用工具
MOL 3D Viewer
MOL Editor
聚类分析
AI模型
自定义数据库
数据管理
数据管理简介
添加数据
数据管理常用操作
作业管理
作业管理简介
创建作业
管理作业
查看执行结果
收藏夹
相关参数
用户指南(基因平台)
欢迎使用医疗智能体服务
关键概念
准备工作
购买服务
购买存储套餐包
购买系统资源
获取认证信息
用户管理
用户管理介绍
创建子用户
导入用户
登录平台方式
管理用户
配额管理
系统设置
安全设置
商标设置
作业消息设置
消息中心
邮箱设置
系统标签管理
个人资源配额
数据归档配置
项目管理
项目简介
创建项目
项目成员和权限
项目管理常用操作
数据管理
数据管理简介
添加数据
发布数据
数据管理常用操作
归档数据
数据控制与数据审计
命令行工具概述
数据库管理
数据库简介
创建数据库模板
导入数据库模板
创建数据库
引用数据库
管理数据库
镜像管理
镜像管理简介
导入或上传镜像
安装容器引擎
获取镜像
制作Docker镜像
上传镜像到SWR镜像仓库
发布镜像
工具管理
工具管理简介
新建应用
导入应用
上传应用
发布应用
编辑应用
创建FastQC应用样例
新建流程
流程设计器
导入流程
上传流程
发布流程
添加分类标签
下载应用或流程
作业管理
分析作业管理简介
创建分析作业
创建自动作业
查看执行结果
作业执行失败排查思路
Nextflow
简介
安装/卸载Nextflow
新建流程
管理流程
新建作业
管理作业
约束限制
作业执行失败排查思路
资产市场
资产市场简介
使用Variant Calling Based On NGS流程
使用Docking Summary流程
使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程
使用AutoGenome镜像
genomeagent镜像
使用genomeagent镜像
genomeagent镜像功能点介绍
开发环境(Notebook)
Notebook简介
创建Notebook
Notebook常用操作
数据的上传和下载
自定义镜像创建Notebook样例
JupyterLab简介及常用操作
url获取方法
Notebook安装Conda指导
大规模药物虚拟筛选
“神农项目”简介
药物虚拟筛选
API参考
使用前必读
概述
调用说明
终端节点
约束与限制
基本概念
API概览
如何调用API
开通服务
构造请求
认证鉴权
返回结果
API(医疗智能体平台)
项目管理
收藏管理
获取收藏夹列表
添加收藏
取消收藏
镜像管理
发布镜像
导入镜像
订阅镜像
更新镜像描述信息或者类型
删除镜像仓库
批量删除镜像tag
删除指定镜像tag
获取镜像列表
创建镜像
获取docker login指令
获取指定镜像的tag列表
标签页面管理
获取标签页面列表
创建标签页面
删除标签页面
项目审计管理
创建项目
获取项目列表
更新项目
删除项目
获取项目详情
更新或者添加项目成员角色
移除项目成员
转移项目
批量删除项目成员
获取项目审计日志追踪器
更新项目审计日志追踪器配置
获取项目审计日志
获取指定审计日志
下载近一万条审计日志
虚拟药物筛选
创建study
删除study
列举study所有作业
创建study作业
列举study
获取study作业的最值信息
获取生成study作业3D结构的内容
系统管理
计算资源扩缩容
创建扩容策略
查询扩容策略列表
获取扩容策略详情
修改扩容策略
删除扩容策略
获取策略关联计算资源列表
获取策略伸缩历史
获取策略事件
启动自动扩容策略
停用自动扩容策略
修改缩容策略
查询缩容策略
计算资源管理
购买计算资源
查询计算资源
删除计算资源
获取节点剩余配额
查询计算资源规格
关闭计算资源
重启计算资源
启动计算资源
修改计算资源调度信息
查询计算资源调度信息
查询bms计算资源显卡id列表
获取EVS配额及使用情况
数据库资源管理
获取数据库资源规格列表
删除数据库资源
购买数据库资源
查询数据库资源
用户管理
查询IAM用户列表
查询IAM用户组列表
查询IAM用户组的用户列表
导入用户
获取用户列表
创建用户
校验token
获取指定用户详情
修改用户基本信息
删除用户
预验证
获取可用的认证方法
修改密码
新用户重置密码
更新用户角色
最终租户修改子用户
发送验证码
更新用户设置
查询用户设置
作业清理配置
获取作业配置
设置作业配置
标签管理
获取标签列表
创建标签
删除标签
批量删除标签
消息中心管理
获取消息列表
统计消息信息
获取用户邮件配置
设置用户邮件配置
邮箱连通性测试
获取消息邮件配置
设置消息邮件配置
删除消息邮件配置
获取消息清理规则
设置消息清理规则
获取通知消息列表
批量删除通知消息
批量更新消息
节点标签管理
设置节点标签
获取节点标签集
获取节点标签集
获取预置标签列表
医疗平台信息获取
获取医疗平台信息
性能加速资源管理
购买性能加速资源
查询性能加速资源
删除性能加速资源
更新性能加速资源配置
资源监控数据获取
获取资源监控数据
批量获取资源统计数据
存储资源查询
查询存储资源
系统配置和供应商配置
查询系统配置列表
获取供应商配置
设置供应商配置
获取跨域归档配置
修改跨域归档设置
系统配额及资源使用情况获取
获取当前系统配额及资源使用情况
数据管理
数据归档
删除归档
获取指定归档的全数据清单
恢复归档
查询归档列表
归档数据
数据管理
创建文件夹
查询数据列表
获取桶存量信息
复制项目数据
导入项目数据
导入网上数据
引用项目数据
订阅资产市场数据
上传数据文件
批量删除项目数据
获取桶列表
查询项目级数据权限控制策略
设置项目级权限控制策略
获取数据详情
设置数据对象策略
发布数据资产
数据作业管理
获取数据作业列表
获取数据作业详细信息
删除数据作业
取消数据作业
重试数据作业
获取数据作业执行日志
下载数据作业执行日志
OBS桶管理
获取用户OBS桶列表
获取用户OBS桶内对象
文件下载
数据库管理
数据库管理
引用数据库实例
获取实例列表
创建数据库实例
查询实例详情
删除实例
查询数据
导入数据
插入单条数据
删除数据
更新数据
模板管理
从其他项目导入模板
上传模板
查询模板列表
创建模板
查询模板详情
删除模板
应用管理
应用管理
发布应用
导入应用
订阅应用
获取应用列表
创建应用
获取应用详情
更新应用
删除应用
作业管理
获取作业列表
启动作业
获取作业详情
删除作业
更新作业
获取作业事件
获取作业日志
获取子任务启动事件
获取子任务实例信息
获取子任务中实例的事件
获取子任务中实例的pod信息
获取子任务中实例的资源监控数据
重试作业
取消或强制停止作业调度
批量取消作业
批量重试作业
批量删除作业
自动作业管理
获取自动作业模板列表
创建自动作业模板
删除自动作业模板
更新自动作业模板
查询自动作业模板
启动自动作业
停止自动作业
流程管理
发布流程
导入流程
订阅流程
获取流程列表
创建流程
获取流程详情
更新流程
删除流程
流程统计管理
获取性能加速资源上统计信息
统计应用、流程、作业数目
统计全局流程、作业信息
资产市场
资产管理
获取资产列表
获取属性值列表
查询资产详情
查询资产版本详情
更新资产指定版本的信息
删除资产指定版本
操作资产发布状态
资产收藏管理
获取收藏资产列表
收藏资产
取消收藏
供应商管理
获取供应商列表
notebook开发环境
notebook开发环境
获取notebook列表
创建notebook
获取notebook详情
更新notebook
删除notebook
启停notebook
获取notebook鉴权信息
获取notebook工作环境
Nextflow接口
Nextflow引擎生命周期管理
安装Nextflow
查询Nextflow配置详情
卸载Nextflow
清理Nextflow缓存
查询Nextflow版本列表
Nextflow作业管理
创建nextflow作业
查询nextflow作业列表
获取Nextflow作业详情
删除Nextflow作业
重试Nextflow作业
获取Nextflow作业日志
停止Nextflow作业
获取Nextflow作业报告
Nextflow任务管理
获取task列表
获取task详情
获取Nextflow任务日志
Nextflow流程管理
创建流程
获取流程列表
获取流程详情
更新流程
删除流程
API(盘古辅助制药平台)
CSS集群管理
绑定CSS集群
获取CSS集群列表
获取最终租户CSS集群列表
测试CSS集群连接
CSS集群解绑
药物通用接口
生成分子SVG图
生成分子SDF三维结构
受体预处理
受体信息解析
受体口袋检测
配体格式转换为SMILES
生成相互作用2D图
计算配体间的3D结构差异
创建配体文件预览任务
查询配体文件预览任务
删除配体文件预览任务
创建配体相似性图计算任务
查询配体相似性图计算任务
删除配体相似性图计算任务
根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容
根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容
将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构
单分子文件格式转换
创建分子或分子复合物批量下载任务
查询分子或分子复合物批量下载任务详情
受体预处理(Fasta格式)
单分子预对接
药物数据库管理
创建数据库
获取数据库列表
删除数据库
更新药物数据库
数据库追加文件
药物作业管理
获取药物作业列表
取消药物作业
删除药物作业
更新药物作业
创建分子聚类作业
自由能微扰作业管理
创建自由能微扰作业
查询自由能微扰作业详情
分子对接作业管理
创建分子对接作业
查询分子对接作业详情
分子合成路径规划作业管理
创建分子合成路径规划作业
查询分子合成路径规划作业详情
分子优化作业管理
创建分子优化作业
查询分子优化作业详情
靶点口袋发现作业管理
创建靶点口袋发现作业
查询靶点口袋发现作业详情
靶点口袋分子设计作业管理
创建靶点口袋分子设计作业
查询靶点口袋分子设计作业详情
分子属性预测作业管理
创建分子属性预测作业
查询分子属性预测作业详情
分子搜索作业管理
创建分子搜索作业
查询分子搜索作业详情
分子生成作业管理
创建分子生成作业
查询分子生成作业详情
CPI作业管理
创建CPI作业
查询CPI作业详情
靶点优化作业管理
创建靶点优化作业
查询靶点优化作业详情
聚类分析作业管理
创建聚类分析作业
查询聚类分析作业详情
药物模型管理
获取基模型列表
创建模型
获取模型列表
更新药物模型
删除模型
API(AI辅助药物设计)
分子生成(MG)
新建分子生成任务接口
查询分子生成任务
分子优化(MO)
新建分子优化任务接口
查询分子优化任务
靶点化合物结合预测(CPI)
新建CPI任务接口
查询CPI任务
分子属性预测(MPP)
ADMET属性预测接口
ADMET属性预测接口(默认+自定义属性)
分子搜索(MS)
新建分子搜索任务接口
查询分子搜索任务
分子合成路径规划任务(MSP)
新建分子合成路径规划任务接口
查询分子合成路径规划任务
自定义属性任务(MCP)
新建自定义属性任务接口
查询自定义属性任务
附录
状态码
错误码(医疗智能体与盘古辅助制药平台)
错误码(AI辅助药物设计)
获取项目ID
配置OBS访问权限
CLI命令速查
什么是医疗智能体eihealth-toolkit
获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
步骤1:获取认证信息
步骤2:下载并安装命令行工具eihealth-toolkit
步骤3:初始化配置
步骤4:查看与执行操作命令
系统设置命令
获取系统标签
添加系统标签
删除系统标签
获取系统资源
购买计算资源
删除计算资源节点
修改计算资源
修改性能加速资源
查询消息及已完成作业保留设置
修改消息及已完成作业保留配置
获取供应商logo和名称设置
修改供应商logo和名称配置
获取系统配额信息
获取消息中心消息列表
项目管理命令
获取项目
切换项目
创建项目
更新项目
删除项目
转移项目
添加项目成员角色
修改项目成员角色
移除项目成员的角色
数据管理命令
列举对象
显示当前目录
切换路径
文件拷贝
创建子目录
上传数据
清理本地记录的上传文件
下载数据
删除数据
数据导入
创建归档
获取归档数据
删除归档
恢复归档
获取数据归档列表
修改归档区域
获取数据作业
删除数据作业
重试数据作业
取消数据作业
移动对象
增量同步
删除分段上传任务
修改权限
查看对象属性
数据库管理命令
创建数据库模板
获取数据库模板
删除数据库模板
导入数据库模板
创建数据库实例
获取数据库实例
删除数据库实例
引用数据库或者导入数据到指定数据库
修改数据库实例
镜像管理命令
标记镜像
上传镜像
下载镜像
查询镜像
导入镜像
更新镜像
删除镜像标签
应用管理命令
应用配置文件说明
创建应用
修改应用
查询应用
删除应用
导入应用
EIHealth流程管理命令
流程配置文件说明
创建流程
修改流程
查询流程
删除流程
导入流程
EIHealth作业管理命令
作业配置文件说明
启动作业
查询作业详情
删除指定作业
重试作业
取消作业
导出作业
获取任务实例
Nexflow流程管理命令
创建流程
修改流程
查询流程详情
删除流程
Nextflow作业管理命令
启动作业
查询作业
删除指定作业
重试作业
停止作业
获取任务信息
notebook命令
创建notebook
获取notebook信息
删除notebook
编辑notebook
启动notebook
停止notebook
最佳实践
基于二代测序的基因组突变检测
NGS流程简介
配置命令行工具
上传数据
制作并上传镜像
创建应用
搭建NGS流程
执行分析作业
批量执行NGS分析
新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
虚拟药物筛选简介
获取示例数据
创建虚拟药物筛选任务
常见问题
数据管理
AK/SK是什么?如何获取AK/SK?
几种不同类型的归档,区别是什么?
镜像
如何搭建Docker环境?
如何将生物信息学软件封装为镜像并上传?
Notebook
如何使用Notebook的Terminal功能?
如何将Notebook中的数据下载至本地?
如何在Notebook中安装外部库?
流程、作业
应用的参数和镜像启动命令如何设置?
直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
Nextflow
在使用Nextflow时,作业运行失败的可能原因
计费
平台计费方式
保留期与欠费
话单延迟导致欠费
不同类型的归档,费用分别是多少?
账号
如何进行实名认证
认证信息
获取项目ID、项目、账号信息
盘古辅助药物
为什么下载的部分靶点文件,显示不完整
自定义数据库常见问题
视频帮助
文档下载
通用参考
产品术语
云服务等级协议(SLA)
白皮书资源
支持区域
系统权限