虚拟药物筛选简介

虚拟药物筛选功能

医疗智能体平台支持根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构，计算蛋白与药物之间的结合能量，进而预测小分子是否有成为候选药物的可能性。

虚拟药物筛选可实现如下功能。

• 整合分子对接结果，生成结合能矩阵。
• 整合受体与分子对接产生的配体构象，用于可视化展示。
• 对配体分子进行注释，包括DrugBank编号、分类、化学式、XLOGP3、TPSA、靶点、Csp3比例、分子量、可旋转键数目。

功能演示请参见视频帮助。

新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选

新型冠状病毒（COVID-19）的出现在全球范围影响了人类健康，寻找有效治愈新冠肺炎的治疗方式是临床医生和药物研发人员最紧迫的工作。

为了全面、系统地评估药物对新冠病毒所有靶点蛋白的结合情况，华为云EI医疗智能体团队与华中科技大学同济医学院基础医学院、华中科技大学同济医学院附属武汉儿童医院、西安交通大学第一附属医院、中科院北京基因组研究所迅速成立联合团队，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取靶点蛋白的3D结构，对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估，让研究人员可以同时从21个蛋白的角度，综合、无偏地评估药物效果，从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。

本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果（https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821），并搭建虚拟药物筛选数据库。

同时，所有筛选结果均已在“神农项目”平台（https://shennongproject.ai/）公开，药物研发人员可在多种终端浏览器查看靶蛋白和药物的3D结合结构以及计算评分，无需安装任何专业的结构生物学软件。