作业执行失败排查思路

启动作业后作业一直处于已提交的状态

问题现象

作业投递后一直处于已提交的状态。

问题排查和解决方案

1. 查看execution log， 若execution log为空，请提交工单或联系服务技术支持。
2. execution log 提示K8S pod can‘t be scheduled，请根据日志信息扩容计算资源。
3. execution log提示can't lock file，重试或者克隆作业即可。
4. execution log提示java.text.ParseException: Unparseable date，请提交工单或联系服务技术支持。
5. execution log提示其它因脚本语法的问题，请根据报错信息进行修改，若无法解决请提交工单或联系服务技术支持。

作业状态已为完成态，task仍在运行中

问题现象

作业的状态已为完成态（失败、成功、取消），但是仍有部分task处于运行中。

解决方案

无需特殊处理，以作业状态为准，查看异常的task日志。

重试作业或者删除作业出现内部异常

问题现象

启动作业立即取消作业，进行重试或者删除作业出现内部异常。

问题原因

投递作业属于异步动作，立即取消可能存在作业未完成投递，Nextflow对于不存在的作业做了静默处理。

解决方案

1. 避免启动作业后立即取消。
2. 克隆作业即可。

process使用errorStrategy 'ignore'时整个作业不会结束

问题现象

process中使用了errorStrategy 'ignore'，当该process因为某种原因失败后，整个作业的状态一直处于运行中。

问题原因

失败的task被忽略，但是后续依赖该process的task会被挂起。

解决方案

不建议使用errorStrategy 'ignore'。