查询靶点口袋发现作业详情

功能介绍

查询靶点口袋发现作业详情。

URI

GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection/{job_id}

表1 路径参数
参数	是否必选	参数类型	描述
project_id	是	String	项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128
eihealth_project_id	是	String	平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128
job_id	是	String	作业id。最小长度：1 最大长度：128

请求参数

表2 请求Header参数
参数	是否必选	参数类型	描述
X-Auth-Token	是	String	用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。最小长度：1 最大长度：32768

响应参数

状态码： 200

表3 响应Body参数
参数	参数类型	描述
basic_info	DrugJobDto object	作业基本信息。
receptor	ReceptorDrugFile object	受体文件。
ligand	ProbeDrugFile object	探针文件。
params	PocketDetectionParamDto object	靶点口袋发现设置参数。

表4 DrugJobDto
参数	参数类型	描述
id	String	作业id。
name	String	作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。
labels	Array of strings	作业标签。
status	String	作业状态。
type	String	作业类型。
create_time	String	作业创建时间。
finish_time	String	作业结束时间。
start_time	String	作业开始时间。
failed_message	String	失败提示，当作业执行失败时会返回。
user_name	String	创建任务的用户名称。
output_dir	String	作业结果输出目录。
expect_charge_num	Double	预估功能调用消耗次数。
real_charge_num	Double	实际功能调用消耗次数。
progress	Progress object	作业进度信息。
upstream_job_info	String	上游作业信息。

表5 Progress
参数	参数类型	描述
overall	Float	整体进度。
estimated_finish_time	Long	预计结束时间，毫秒。

表6 ReceptorDrugFile
参数	参数类型	描述
source	String	受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW
url	String	文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000
format	String	文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6
data	String	文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000

表7 ProbeDrugFile
参数	参数类型	描述
source	String	受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW
url	String	文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000
format	String	文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6
data	String	文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000

表8 PocketDetectionParamDto
参数	参数类型	描述
timestep_size	Double	时间步长，单位ps。最小值：0.001 最大值：0.002 缺省值：0.002
num_minimization_steps	Integer	最小化步数。最小值：5000 最大值：50000 缺省值：20000
pre_equilibrium_time	Integer	预平衡时长，单位ps。最小值：20 最大值：200 缺省值：100
pocket_detection_time	Integer	口袋发现时长，单位ns。最小值：20 最大值：50 缺省值：50
num_surface_points	Integer	表面原子离散点数量。最小值：10 最大值：50 缺省值：20
probe_radius	Double	探针半径，单位A 最小值：1.4 最大值：5 缺省值：1.4

请求示例

无

响应示例

状态码： 200

{
  "basic_info" : {
    "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
    "name" : "demo-job",
    "labels" : [ "labelA", "labelB" ],
    "status" : "FINISHED",
    "type" : "POCKETDETECTION",
    "start_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
    "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
    "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
    "failed_message" : "null",
    "user_name" : "demo-user-name",
    "output_dir" : "job-analysis/job-name",
    "expect_charge_num" : 1,
    "real_charge_num" : 1
  },
  "params" : {
    "timestep_size" : 0.001,
    "num_minimization_steps" : 20000,
    "pre_equilibrium_time" : 100,
    "pocket_detection_time" : 50,
    "num_surface_points" : 30,
    "probe_radius" : 1.4
  },
  "receptor" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/dir/file"
  },
  "ligand" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/dir/file"
  }
}