查询靶点口袋发现作业详情
功能介绍
查询靶点口袋发现作业详情。
URI
GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection/{job_id}
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
project_id |
是 |
String |
项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 |
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eihealth_project_id |
是 |
String |
平台项目ID。 最小长度：1 最大长度：128 |
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job_id |
是 |
String |
作业id。 最小长度：1 最大长度：128 |
请求参数
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参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
|
X-Auth-Token |
是 |
String |
用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 |
响应参数
状态码： 200
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参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
basic_info |
DrugJobDto object |
作业基本信息。 |
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receptor |
ReceptorDrugFile object |
受体文件。 |
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ligand |
ProbeDrugFile object |
探针文件。 |
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params |
PocketDetectionParamDto object |
靶点口袋发现设置参数。 |
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参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
id |
String |
作业id。 |
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name |
String |
作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 |
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labels |
Array of strings |
作业标签。 |
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status |
String |
作业状态。 |
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type |
String |
作业类型。 |
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create_time |
String |
作业创建时间。 |
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finish_time |
String |
作业结束时间。 |
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start_time |
String |
作业开始时间。 |
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failed_message |
String |
失败提示，当作业执行失败时会返回。 |
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user_name |
String |
创建任务的用户名称。 |
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output_dir |
String |
作业结果输出目录。 |
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expect_charge_num |
Double |
预估功能调用消耗次数。 |
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real_charge_num |
Double |
实际功能调用消耗次数。 |
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progress |
Progress object |
作业进度信息。 |
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upstream_job_info |
String |
上游作业信息。 |
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参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
source |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
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|
url |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
|
format |
String |
文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
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data |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
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参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
source |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
|
|
url |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
|
format |
String |
文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
|
data |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
|
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
|
timestep_size |
Double |
时间步长，单位ps。 最小值：0.001 最大值：0.002 缺省值：0.002 |
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num_minimization_steps |
Integer |
最小化步数。 最小值：5000 最大值：50000 缺省值：20000 |
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pre_equilibrium_time |
Integer |
预平衡时长，单位ps。 最小值：20 最大值：200 缺省值：100 |
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pocket_detection_time |
Integer |
口袋发现时长，单位ns。 最小值：20 最大值：50 缺省值：50 |
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num_surface_points |
Integer |
表面原子离散点数量。 最小值：10 最大值：50 缺省值：20 |
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probe_radius |
Double |
探针半径，单位A 最小值：1.4 最大值：5 缺省值：1.4 |
请求示例
无
响应示例
状态码： 200
OK
{
"basic_info" : {
"id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
"name" : "demo-job",
"labels" : [ "labelA", "labelB" ],
"status" : "FINISHED",
"type" : "POCKETDETECTION",
"start_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
"create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
"finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
"failed_message" : "null",
"user_name" : "demo-user-name",
"output_dir" : "job-analysis/job-name",
"expect_charge_num" : 1,
"real_charge_num" : 1
},
"params" : {
"timestep_size" : 0.001,
"num_minimization_steps" : 20000,
"pre_equilibrium_time" : 100,
"pocket_detection_time" : 50,
"num_surface_points" : 30,
"probe_radius" : 1.4
},
"receptor" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"ligand" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
}
}
状态码
|
状态码 |
描述 |
|---|---|
|
200 |
OK |
错误码
请参见错误码。
