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更新时间：2024-12-13 GMT+08:00
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创建靶点口袋发现作业

功能介绍

创建靶点口袋发现作业。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

是

String

项目ID，您可以从获取项目ID中获取。

最小长度：1

最大长度：128

eihealth_project_id

是

String

平台项目ID。

最小长度：1

最大长度：128

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

是

String

用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

最小长度：1

最大长度：32768

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

basic_info

是

CreateDrugJobBasicInfo object

作业基本信息。

receptor

是

ReceptorDrugFile object

受体文件。

ligand

是

ProbeDrugFile object

探针文件。

params

否

PocketDetectionParamDto object

靶点口袋发现设置参数。

表4 CreateDrugJobBasicInfo

参数

是否必选

参数类型

描述

name

是

String

作业的名称，取值范围：[5,64]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。

最小长度：5

最大长度：64

labels

否

Array of strings

标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。

最小长度：1

最大长度：32

数组长度：0 - 5

upstream_job_info

否

String

上游作业信息。

最小长度：1

最大长度：10240

表5 ReceptorDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。

枚举值：

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

否

String

文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度：1

最大长度：2000

format

否

String

文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：1

最大长度：6

data

否

String

文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：0

最大长度：10000000

表6 ProbeDrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。

枚举值：

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

否

String

文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度：1

最大长度：2000

format

否

String

文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：1

最大长度：6

data

否

String

文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：0

最大长度：10000000

表7 PocketDetectionParamDto

参数

是否必选

参数类型

描述

timestep_size

否

Double

时间步长，单位ps。

最小值：0.001

最大值：0.002

缺省值：0.002

num_minimization_steps

否

Integer

最小化步数。

最小值：5000

最大值：50000

缺省值：20000

pre_equilibrium_time

否

Integer

预平衡时长，单位ps。

最小值：20

最大值：200

缺省值：100

pocket_detection_time

否

Integer

口袋发现时长，单位ns。

最小值：20

最大值：50

缺省值：50

num_surface_points

否

Integer

表面原子离散点数量。

最小值：10

最大值：50

缺省值：20

probe_radius

否

Double

探针半径，单位A。

最小值：1.4

最大值：5

缺省值：1.4

响应参数

状态码： 201

表8 响应Body参数

参数

参数类型

描述

id

String

作业id。

limit_concurrency

Integer

限制的并发量。

请求示例

创建靶点口袋发现作业，作业名称为demo-job， 受体文件为project:/dir/file，时间步长为0.001ps，最小化步数为20000，预平衡时间为100ps，口袋发现时长为50ns，表面原子离散点数量为30，探针半径1.4A。

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection

{
  "basic_info" : {
    "name" : "demo-job",
    "labels" : [ "labelA" ]
  },
  "receptor" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/dir/file"
  },
  "ligand" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/dir/file"
  },
  "params" : {
    "timestep_size" : 0.001,
    "num_minimization_steps" : 20000,
    "pre_equilibrium_time" : 100,
    "pocket_detection_time" : 50,
    "num_surface_points" : 30,
    "probe_radius" : 1.4
  }
}

响应示例

状态码： 201

CREATED

  • 创建靶点口袋发现作业成功。 
    {
  "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1"
}
  • 创建靶点口袋发现作业成功，当前运行作业数已达配额限制，此作业会等待。 
    {
  "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
  "limit_concurrency" : 50
}

状态码

状态码

描述

201

CREATED

错误码

请参见错误码。

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