创建靶点口袋发现作业
功能介绍
创建靶点口袋发现作业。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
project_id |
是 |
String |
项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 |
eihealth_project_id |
是 |
String |
平台项目ID。 最小长度：1 最大长度：128 |
请求参数
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token |
是 |
String |
用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
basic_info |
是 |
CreateDrugJobBasicInfo object |
作业基本信息。 |
receptor |
是 |
ReceptorDrugFile object |
受体文件。 |
ligand |
是 |
ProbeDrugFile object |
探针文件。 |
params |
否 |
PocketDetectionParamDto object |
靶点口袋发现设置参数。 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
name |
是 |
String |
作业的名称，取值范围：[5,64]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度：5 最大长度：64 |
labels |
否 |
Array of strings |
标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
source |
是 |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
|
url |
否 |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
format |
否 |
String |
文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
data |
否 |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
source |
是 |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
|
url |
否 |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
format |
否 |
String |
文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
data |
否 |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
timestep_size |
否 |
Double |
时间步长，单位ps。 最小值：0.001 最大值：0.002 缺省值：0.002 |
num_minimization_steps |
否 |
Integer |
最小化步数。 最小值：5000 最大值：50000 缺省值：20000 |
pre_equilibrium_time |
否 |
Integer |
预平衡时长，单位ps。 最小值：20 最大值：200 缺省值：100 |
pocket_detection_time |
否 |
Integer |
口袋发现时长，单位ns。 最小值：20 最大值：50 缺省值：50 |
num_surface_points |
否 |
Integer |
表面原子离散点数量。 最小值：10 最大值：50 缺省值：20 |
probe_radius |
否 |
Double |
探针半径，单位A。 最小值：1.4 最大值：5 缺省值：1.4 |
响应参数
状态码： 201
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
id |
String |
作业id。 |
limit_concurrency |
Integer |
限制的并发量。 |
请求示例
创建靶点口袋发现作业，作业名称为demo-job， 受体文件为project:/dir/file，时间步长为0.001ps，最小化步数为20000，预平衡时间为100ps，口袋发现时长为50ns，表面原子离散点数量为30，探针半径1.4A。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-detection
{
"basic_info" : {
"name" : "demo-job",
"labels" : [ "labelA" ]
},
"receptor" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"ligand" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"params" : {
"timestep_size" : 0.001,
"num_minimization_steps" : 20000,
"pre_equilibrium_time" : 100,
"pocket_detection_time" : 50,
"num_surface_points" : 30,
"probe_radius" : 1.4
}
}
响应示例
状态码： 201
CREATED
- 创建靶点口袋发现作业成功。
{ "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } - 创建靶点口袋发现作业成功，当前运行作业数已达配额限制，此作业会等待。
{ "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "limit_concurrency" : 50 }
状态码
状态码 |
描述 |
|---|---|
201 |
CREATED |
错误码
请参见错误码。
