CPI预测

CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配，精确的预测化合物-蛋白相互作用。

1. 单击“CPI预测”功能卡片，进入配置页面。
2. 配置靶点文件。

   支持3种输入方式，分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID

   • 输入FASTA格式氨基酸序列，输入框最多支持输入100条氨基酸序列，每条氨基酸序列最多支持输入2048个字符。
     图1 靶点配置输入氨基酸序列
     
   • 选择文件，支持fasta格式和pdb文件。
     • fasta格式文件，最多上传1个文件，文件中最多支持100条氨基酸序列，每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。
     • pdb格式文件，最多上传100个靶点文件，如果上传多聚体靶点，仅解析第一条链，每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。
       图2 靶点配置选择文件
       
   • 输入PDB ID，最多输入100个PDB ID，用逗号或换行方式隔开；不区分大小写；如果输入多聚体靶点，仅解析第一条链；每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。
     图3 靶点配置输入PDB ID
     
3. 在配置页面输入分子信息，及配置相关参数。
   • 输入方式：支持绘制分子、选择文件、手动输入。
     • 绘制分子：只能绘制一个分子，能够输入分子的SMILES。
     • 选择文件：选择分子文件，最多支持100万个小分子，且分子文件大小不超过2GB。支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。文件来源包括数据中心和示例数据。
     • 手动输入：输入小分子SMILES表达式。最多支持输入1000行，每行最多输入1024个字符，SMILES不支持输入空格或者中文。
   • 作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字符，仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。
   • 标签：设置任务标签。
   • 功能调用消耗：100000个小分子记一次功能调用。
4. 配置完成后，单击“提交”。

   提交成功后，可以在“作业中心”查看执行结果。

5. 查看多对多运行结果。

   如果是多受体对多配体，打开作业结果页面可以看到结合能二维矩阵，支持分别按照靶点和小分子进行排序。

   图4 查看结果（1）
   
6. 查看一对多运行结果。

   单击受体结合能框，跳转到单受体对多配体的结果表页面，可以下载全量及单条CPI预测结果。

   如果需要下载多个结果，可以选择结果后，单击左上角的“下载”。如果需要下载单条数据，单击数据操作列的“下载”即可。

   

   下载操作将会产生流量费用，具体可参考计费说明。

   单个受体对多个配体的结果页面有列表视图、卡片视图，支持搜索、高级筛选，排序等功能。每个小分子支持“查看详情”可以进入小分子的属性详情页；支持“下游分析”，可以进行分子属性预测、分子搜索、分子优化、合成路径规划分析。支持收藏功能，单击按钮，即可收藏CPI预测结果，收藏后可直接在收藏夹页查看。

   图5 查看结果（2）
   
   图6 查看结果（3）
   
7. 查看作业信息页面。

   从作业结果页面单击“作业信息”查看作业信息界面。

   图7 查看作业信息