更新时间:2024-08-08 GMT+08:00
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分子搜索

可自定义数据库,以用户输入的参考化合物结构为起点,可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。

  1. 单击“分子搜索”功能卡片,进入分子搜索页面。
  2. 在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。
    图1 分子搜索页面
    • 输入小分子:可以通过输入SMILES、上传文件或者直接绘制输入小分子。最终以SMILES为准。
    • 选择算法:可以选择ECFP4 Tanimoto相似度或者骨架搜索。ECFP4 Tanimoto相似度是通过ECFP4指纹计算Tanimoto相似度来搜索相似度比较高的小分子。骨架搜索是通过设置分子骨架搜索具有相同骨架的分子。
    • 选择数据库:最多可选择10个数据库。
    • 选择属性模型:选择AI模型。如果需要创建模型,可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。
    • 输出个数:输出个数越多,任务时间越长。
    • 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。
    • 标签:设置任务标签。
  3. 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。

    运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果。

    图2 作业中心
    图3 输出结果(1)
    图4 输出结果(2)
    图5 查看分子详情
    图6 分子下游分析
    图7 作业信息页面

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