医疗智能体 EIHealth
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分子搜索
可自定义数据库,以用户输入的参考化合物结构为起点,可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。
- 单击“分子搜索”功能卡片,进入分子搜索页面。
- 在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。
图1 分子搜索页面
- 输入小分子:可以通过输入SMILES、上传文件或者直接绘制输入小分子。最终以SMILES为准。
- 选择算法:可以选择ECFP4 Tanimoto相似度或者骨架搜索。ECFP4 Tanimoto相似度是通过ECFP4指纹计算Tanimoto相似度来搜索相似度比较高的小分子。骨架搜索是通过设置分子骨架搜索具有相同骨架的分子。
- 选择数据库:最多可选择10个数据库。
- 选择属性模型:选择AI模型。如果需要创建模型,可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。
- 输出个数:输出个数越多,任务时间越长。
- 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。
- 标签:设置任务标签。
- 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。
单击
按钮,可以收藏分子搜索结果,收藏后的结果可直接在收藏夹页查看。
图2 作业中心图3 输出结果(1)图4 输出结果(2)图5 查看分子详情图6 分子下游分析图7 作业信息页面
父主题: 苗头化合物发现