分子属性预测

基于盘古药物分子大模型，预测化合物ADMET相关的80多种成药属性，有些属性的预测值会给出置信区间，更好地辅助分子设计。

1. 单击“分子属性预测”功能卡片，进入配置页面。
   图1 小分子配置页面
   
2. 在配置页面输入分子信息，及配置相关参数。
   • 输入方式：支持绘制分子、选择文件、手动输入。
     • 绘制分子：只能绘制一个分子，能够输入分子的SMILES。
     • 选择文件：选择分子文件，最多支持100万个小分子，且分子文件大小不超过2GB。支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。文件来源包括数据中心和示例数据。
     • 手动输入：输入小分子SMILES表达式。最多支持输入1000行，每行最多输入512个字符，SMILES不支持输入空格或者中文。
   • 选择基模型：选择基模型，此参数只有专业版支持。基模型列表见AI建模。
   • 选择属性模型：选择AI模型。如果需要创建模型，可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。属性模型的基模型必须与上一步所选择的基模型一致。
   • 输出小分子表征：是否输出小分子表征文件，小分子表征文件可以用作训练模型使用，默认是不输出。
   • 作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字符，仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。
   • 标签：设置任务标签。
   • 功能调用消耗：20000个小分子记一次功能调用。
   

   引用外部桶时，需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。

3. 配置完成后，单击“提交”。

   提交成功后，可以在“作业中心”查看执行结果。

4. 查看运行结果。

   可以单击“下载”，下载分子属性预测结果信息。单击“操作”列的“查看”，查看分子信息。分子属性预测对应的下游分析为分子优化和合成路径，通过单击“下游分析”可以进行创建。

   单击，可以收藏该分子属性预测结果，收藏后的结果可在收藏夹页直接查看。

   

   下载操作将会产生流量费用，具体可参考计费说明。

   图2 查看结果（1）
   
5. 分子属性预测结果支持以卡片视图的形式进行查看，参考图3，在卡片视图中：
   • 单击右上方的选择下拉框，可以选择分子的排序方式，将分子按照所选的排序方式进行展示。
     图3 查看运行结果（2）
     
     图4 排序方式
     
   • 单击每个分子卡片右上方的，可以收藏该分子属性预测结果，收藏后的结果可在收藏夹页直接查看。
   • 单击每个分子卡片右上方的，可以选择“查看详情”、“下游分析””。
     • 查看详情：单击查看详情，跳转至分子列表页进行查看。
     • 下游分析：分子优化对应的下游分析为分子优化、分子搜索和合成路径规划，单击“确定”即可创建。
   • 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数QED、SaScore
     • QED：代表分子的成药性。
     • SaScore：代表合成可及性分数，旨在评估分子的合成难易程度。