更新时间:2024-08-08 GMT+08:00
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数据库简介

EIHealth平台提供了数据库的创建、查询和管理能力。您可以将表型、基因型或其他数据导入EIHealth平台并生成数据库。同时,除了自定义数据库外,支持将作业运行中产生的数据文件创建为数据库。

创建数据库时,数据库模板为您提供了一个数据表的搭建框架,可通过数据库模板灵活的定义数据结构,描述数据及其关系。数据库以项目为粒度进行资源的隔离和访问控制,不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限

预置数据库和模板

平台内置“神农项目”药物虚拟筛选数据库和药物配体注释信息数据库,并提供对应的数据库模板。您可以在“数据库”页签单击“shennongProject-database”“ligandAnnotation-database”数据库查看数据库详情,在“模板”页签单击“shennongProject”“ligandAnnotation”查看模板详情。

  • “神农项目”药物虚拟筛选数据库

    数据库呈现了新冠病毒靶点蛋白和药物的结合能信息。“神农项目”是抗疫期间医疗智能体团队联合多家科研单位,从新冠病毒蛋白序列开始,针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化,获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,获取的结合能信息均公开在“神农项目”中。

    图1 “神农项目”药物虚拟筛选数据库
    图2 数据库模板
  • 药物配体注释信息数据库

    数据库呈现了“神农项目”中8500多种药物的注释信息。包含了药物在DrugBank数据库中的ID、药物通用名称、分类、化学式、SMILES结构式、标签和成药性相关的信息。

    图3 药物配体注释信息数据库
    图4 数据库模板

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