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更新时间：2024-12-13 GMT+08:00

创建分子优化作业

功能介绍

创建分子优化作业。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/optimization

表1 路径参数
参数	是否必选	参数类型	描述
project_id	是	String	项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128
eihealth_project_id	是	String	平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128

请求参数

表2 请求Header参数
参数	是否必选	参数类型	描述
X-Auth-Token	是	String	用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。最小长度：1 最大长度：32768

表3 请求Body参数
参数	是否必选	参数类型	描述
basic_info	是	CreateDrugJobBasicInfo object	创建药物作业基本信息。
smiles	否	String	分子SMILES表达式。最小长度：1 最大长度：512
molecule_file	否	DrugFile object	分子文件。
binding_site	否	BindSiteDto object	受体。
binding_sites	否	Array of BindSiteDto objects	受体列表和受体是二选一的关系，受体列表优先级最高。数组长度：0 - 2
weak_constraints	否	Array of WeakConstraintDto objects	弱约束集合。数组长度：0 - 10
strong_constraints	否	Array of StrongConstraintDto objects	强约束集合。数组长度：0 - 5
sampler_mixin_weight	否	Float	初始化采样权重，参数范围(0.5, 1)，不包含0.5和1，默认为0.6。最小值：0.5 最大值：1 缺省值：0.6
base_model_id	否	String	基模型id。缺省值：pangu-drug-model 最小长度：0 最大长度：128
model_ids	否	Array of strings	模型id列表。最小长度：1 最大长度：128 数组长度：0 - 10
num_trials	否	Integer	生成分子数量。最小值：0 最大值：5000 缺省值：5000

表4 CreateDrugJobBasicInfo
参数	是否必选	参数类型	描述
name	是	String	作业的名称，取值范围：[5,64]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。最小长度：5 最大长度：64
labels	否	Array of strings	标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5
upstream_job_info	否	String	上游作业信息。最小长度：1 最大长度：10240

表5 DrugFile
参数	是否必选	参数类型	描述
source	是	String	受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW
url	否	String	文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000
format	否	String	文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6
data	否	String	文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000

表6 BindSiteDto
参数	是否必选	参数类型	描述
name	否	String	靶点名称，只能设置为target1或者target2。最小长度：1 最大长度：128
receptor	是	ReceptorDrugFile object	受体文件。
engine	否	String	对接引擎，支持DSDP、AUTODOCK_VINA。缺省值：AUTODOCK_VINA 最小长度：0 最大长度：15
docking_type	否	String	对接类型，支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。缺省值：POCKET_DOCKING 最小长度：0 最大长度：15
bounding_box	否	BoundingBoxDto object	结合口袋，包含口袋中心位置和尺寸大小。
remove_ion	否	Boolean	去除受体中的离子。缺省值：true
remove_water	否	Boolean	去除受体中的水分子。缺省值：true
remove_ligand	否	Boolean	去除受体中的配体分子。缺省值：true
add_hydrogen	否	Boolean	增加氢原子。缺省值：false

表7 ReceptorDrugFile
参数	是否必选	参数类型	描述
source	是	String	受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW
url	否	String	文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000
format	否	String	文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6
data	否	String	文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000

表8 BoundingBoxDto
参数	是否必选	参数类型	描述
center	是	Array of doubles	口袋中心坐标； x, y, z轴的坐标。最小值：-9999999 最大值：99999999 数组长度：3 - 3
size	是	Array of floats	口袋尺寸大小； x, y, z轴的大小。最小值：2 最大值：500 数组长度：3 - 3
padding	否	Float	填充。最小值：0 最大值：20

表9 WeakConstraintDto
参数	是否必选	参数类型	描述
id	否	String	自定义模型id，仅弱约束为模型时填写。最小长度：1 最大长度：128
name	否	String	属性名称。最小长度：1 最大长度：128
type	是	String	属性约束类型。枚举值： bool range struct minimize maximize interaction
bool	否	Boolean	属性约束类型bool的参数。
range	否	Array of floats	属性约束类型range的参数。最小值：-9999 最大值：9999 数组长度：2 - 2
struct	否	StructureConstraintParamsDto object	结构约束参数。
quantiles	否	Array of floats	属性约束类型minimize和maximize的参数。最小值：0.0 最大值：1.0 数组长度：2 - 2
interaction	否	InteractionConstraintDto object	相互作用力约束参数。

**表10** StrongConstraintDto
参数	是否必选	参数类型	描述
id	否	String	自定义模型id，仅强约束为模型时填写。最小长度：1 最大长度：128
name	否	String	属性名称。最小长度：1 最大长度：128
type	是	String	属性约束类型。枚举值： bool range struct interaction
bool	否	Boolean	属性约束类型bool的参数。
range	否	Array of floats	属性约束类型range的参数。最小值：-9999 最大值：9999 数组长度：2 - 2
struct	否	StructureConstraintParamsDto object	结构约束参数。
interaction	否	InteractionConstraintDto object	相互作用力约束参数。

**表11** StructureConstraintParamsDto
参数	是否必选	参数类型	描述
structs	是	Array of strings	子结构SMILES。最小长度：1 最大长度：120 数组长度：1 - 8
exclusive	是	Boolean	是否排除子结构。
operator	否	String	多个子结构之间的逻辑关系。枚举值： or and

**表12** InteractionConstraintDto
参数	是否必选	参数类型	描述
interactions	是	Array of Interaction objects	相互作用力列表。数组长度：1 - 8
exclusive	是	Boolean	是否排除指定的约束作用力。
operator	否	String	多个作用力之间的逻辑关系。枚举值： or and

**表13** Interaction
参数	是否必选	参数类型	描述
binding_site	是	String	靶点，只支持target1或target2。最小长度：1 最大长度：128
type	是	String	相互作用力类型：氢键、疏水作用、盐桥、π-π堆积、π-阳离子。枚举值： hydrogen_bond hydrophobic_action salt_bridge pi_stacking pi_cation
amino_acid	是	String	氨基酸。最小长度：4 最大长度：16

响应参数

状态码： 201

**表14** 响应Body参数
参数	参数类型	描述
id	String	作业id。
limit_concurrency	Integer	限制的并发量。

请求示例

创建分子优化作业，作业名称为demo-job，分子SMILES表达式为string，靶点设置的受体文件为project:/test.pdb，口袋中心位置为[0,0,0]，口袋尺寸大小为[500,500,500]，设置弱约束为eye_corrosion，类型为布尔值，值为true，设置强约束为sascore，类型为range，值为[0,1]。

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/optimization

{
  "basic_info" : {
    "name" : "demo-job",
    "labels" : [ "labelA" ]
  },
  "smiles" : "string",
  "num_trials" : 500,
  "binding_sites" : [{
    "name" : "target1",
    "receptor" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/test.pdb"
    },
    "engine" : "DSDP",
    "bounding_box" : {
      "center" : [ 0, 0, 0 ],
      "size" : [ 500, 500, 500 ]
    },
    "remove_ion" : false,
    "remove_water" : false,
    "remove_ligand" : false
  }],
  "weak_constraints" : [ {
    "name" : "eye_corrosion",
    "type" : "bool",
    "bool" : true
  } ],
  "strong_constraints" : [ {
    "name" : "sascore",
    "type" : "range",
    "range" : [ 0, 1 ]
  } ]
}

响应示例

状态码： 201

CREATED

创建分子优化作业成功。

{
  "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1"
}

创建分子优化作业成功，当前运行作业数已达配额限制，此作业会等待。
```
{
  "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
  "limit_concurrency" : 50
}
```

状态码

状态码	描述
201	CREATED

错误码

请参见错误码。

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