新建流程

流程说明

分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。

• EIHealth中的流程由应用搭建形成，应用包含了数据的输入、输出等参数定义。

  

• 应用呈现的信息在创建应用过程中定义，包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。

  

• 单击参数名称，可查看参数的详细信息。

  

• 单击输入参数图标，可指定输入数据路径。输出数据路径在新建流程和运行分析作业时可指定。

新建流程

1. 单击“新建流程”，进入流程设计器页面。

   流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具，详细介绍请参见流程设计器。新建流程时，自动保存默认打开。

   图1 新建流程
   
2. 填写流程参数信息，填写完成后单击“确定”。
   1. 填写流程基本参数，包括“流程名称”、“版本”、“标签”、“短描述”和“描述”。
      “流程名称”和“版本”为必填项，其他参数可选填。

      图2 流程参数
      
   2. 填写“超时时间”、“输出路径”。
      为可选参数，基于流程创建分析作业时，该参数可重新定义。

      • “超时时间”指作业运行时间超过设置时间时，认为超时，默认1440分钟，最大可设置为144000分钟，即作业运行至多100天。
      • “输出路径”指运行分析作业时的输出结果存放路径。

        例如，gene-assets项目中的output文件夹，输出路径格式为/gene-assets/output。

      图3 流程参数
      
3. 将左侧应用列表中的应用，拖拽至画布中。对于由多个应用构成的流程，通过连接线指定输入、输出关系进行链接。
   鼠标移动至应用中，会出现一个“空心圆”，拖动“空心圆”，将连接线挪动到目标应用上。

   图4 搭建流程
   

   

   只有当应用的输入、输出参数类型相同时，才可以进行连接。例如，将app1和app2链接起来，app1的输出，app2的输入均为file类型。

4. 单击应用图标，弹出编辑、删除、复制图标，可对应用执行相应操作。
   图5 编辑应用
   
5. 单击按钮，进入参数设置页面，可查看修改参数。
   • 名称：应用的原始名称。
   • 版本：应用版本。
   • 显示名称：应用在流程中的显示名称，可修改。
   • 镜像启动命令：镜像启动的命令。可在右上角放大查看，在右下角下拉查看。
   • 源项目：显示应用隶属的项目。
   • 输入参数：由用户在创建应用时定义。
   • 输出路径：输出数据的存放路径，可修改。
   • 高级参数：CPU需求、Memory需求、GPU类型、GPU需求，请按照使用需求进行设置；CPU架构、计算节点标签，不可修改。GPU包含NAIDIA架构GPU和自研的D310+ARM。选择GPU资源时，需要您在购买平台时包含了GPU资源，并且需要应用支持GPU运行。选择D310+ARM时，需要应用支持ARM环境运行，并在创建应用时，镜像系统为ARM类系统。
   

   运行分析作业时，流程中的每一个应用称之为一个任务（Task），在编排流程时，如果“输出路径”修改为空，实际作业输出结果依然默认存在该路径。最终输出结果路径按照“流程输出路径/作业名称-UUID/Task输出路径/应用输出路径”规则生成。

6. 单击界面上方按钮，保存流程。并提示“流程保存成功”。

   创建好的流程，将显示在流程列表中。