医疗智能体 EIHealth
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新建流程
- 选择“工具>Nextflow”,单击“新建流程”。
- 填写流程基本信息。
- 名称:设置流程名称。名称长度为1-56,只允许出现中划线、下划线、字母和数字。
- 标签:选择流程标签,最多可添加5个。
- 描述:设置流程相关描述。
- 单击“下一步”,添加流程文件。
如果流程文件上传的是zip包,则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf,为压缩文件夹中的文件完整路径。例如:main.nf。若不填写,默认为main.nf。
说明:
- 支持上传的文件格式为nf、 zip,大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个,单个文件解压后限制,不超过10M。
- 如果上传的流程中包含镜像,单击镜像管理跳转至本项目的镜像管理列表,进行镜像上传,具体可参考导入或上传镜像。
图1 添加流程文件 - 添加完成后,单击“下一步”,配置流程参数。
添加参数方式支持两种,一种为单击
进行添加,一种为单击
进行添加。如果参数比较多,建议使用“上传参数”方式。
- 上传参数方式:支持json或yaml格式,文件大小不能超过10M。模板可以通过单击
进行下载。如果上传参数有重名的参数,则只取最后一个参数的值。
- 添加参数方式:需手动配置相关参数的取值。
- 参数名称:设置参数名称,此参数为必填项。参数名不能相同。
- 类型:参数类型,此参数为必填项。取值范围:Other、 File、Directory。如果类型选择Other时,可以单击值旁边的
按钮进行输入。如果选择File或者Directory类型,可以单击值旁边的
按钮,选择文件或者文件夹。
- 值:根据参数类型,填写或者选择相关取值。
- 必传:参数是否必传,此参数为非必填项。如果开启“必传”,则“值”为必填项。
- 描述:参数描述,此参数为非必填项。
- 操作:可以单击操作列“删除”,删除对应的参数。
图2 配置流程参数 - 上传参数方式:支持json或yaml格式,文件大小不能超过10M。模板可以通过单击
- 参数配置完成后,单击“保存”。
流程创建成功后,单击“保存并启动作业”,或者在流程管理页面,单击流程列表操作列的“启动作业”进入作业设置页面,配置作业的相关信息,具体可参考新建作业。
父主题: Nextflow