受体口袋检测
功能介绍
检测受体口袋，检测类型基于配体，基于氨基酸残基，自动检测，自定义和全局对接。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/pocket
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
project_id |
是 |
String |
项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 |
eihealth_project_id |
是 |
String |
平台项目ID。 最小长度：1 最大长度：128 |
请求参数
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token |
是 |
String |
用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
mode |
是 |
String |
口袋识别的模式：自动、全局、配体、残基。 枚举值：
|
receptor_file |
是 |
ReceptorDrugFileReq object |
受体文件。 |
ligand_file |
否 |
DrugFile object |
配体文件。 |
residues |
否 |
Array of strings |
残基列表，当识别模式为残基时提供。 最小长度：4 最大长度：16 数组长度：1 - 32 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
source |
是 |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
|
url |
否 |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
format |
否 |
String |
文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
data |
否 |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
add_hydrogen |
否 |
Boolean |
增加氢原子。 缺省值：true |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
source |
是 |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
|
url |
否 |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
format |
否 |
String |
文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
data |
否 |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
响应参数
状态码： 200
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
mode |
String |
口袋识别的模式：自动、全局、配体、残基。 枚举值：
|
pockets |
Array of DrugBoundingBoxDto objects |
口袋列表。 数组长度：1 - 10 |
请求示例
{
"mode" : "AUTO",
"receptor_file" : {
"source" : "EXTRANET",
"url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb"
}
}
响应示例
状态码： 200
受体口袋检测成功响应。
{
"mode" : "AUTO",
"pockets" : [ {
"center" : [ 39.067, 26.472, 51.635 ],
"size" : [ 6.668, 8.465, 6.582 ]
}, {
"center" : [ 29.013, 37.992, 54.6 ],
"size" : [ 3.468, 2.754, 5.233 ]
}, {
"center" : [ 34.946, 18.73, 45.517 ],
"size" : [ 5.178, 6.133, 5.156 ]
}, {
"center" : [ 32.901, 33.444, 61.459 ],
"size" : [ 3.664, 4.93, 3.59 ]
}, {
"center" : [ 53.883, 17.701, 48.675 ],
"size" : [ 3.281, 2, 10.053 ]
}, {
"center" : [ 47.861, 17.39, 37.703 ],
"size" : [ 5.231, 2, 3.53 ]
} ]
}
状态码
状态码 |
描述 |
|---|---|
200 |
受体口袋检测成功响应。 |
错误码
请参见错误码。
