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更新时间：2024-05-09 GMT+08:00
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受体口袋检测

功能介绍

检测受体口袋，检测类型基于配体，基于氨基酸残基，自动检测，自定义和全局对接。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/pocket

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

是

String

项目ID，您可以从获取项目ID中获取。

最小长度：1

最大长度：128

eihealth_project_id

是

String

平台项目ID。

最小长度：1

最大长度：128

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

是

String

用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

最小长度：1

最大长度：32768
表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

mode

是

String

口袋识别的模式：自动、全局、配体、残基。

枚举值：

  • AUTO
  • GLOBAL
  • LIGAND
  • RESIDUES

receptor_file

是

ReceptorDrugFileReq object

受体文件。

ligand_file

否

DrugFile object

配体文件。

residues

否

Array of strings

残基列表，当识别模式为残基时提供。

最小长度：4

最大长度：16

数组长度：1 - 32
表4 ReceptorDrugFileReq

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。

枚举值：

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

否

String

文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度：1

最大长度：2000

format

否

String

文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：1

最大长度：6

data

否

String

文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：0

最大长度：10000000

add_hydrogen

否

Boolean

增加氢原子。

缺省值：true
表5 DrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。

枚举值：

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

否

String

文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度：1

最大长度：2000

format

否

String

文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：1

最大长度：6

data

否

String

文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：0

最大长度：10000000

响应参数

状态码： 200

表6 响应Body参数

参数

参数类型

描述

mode

String

口袋识别的模式：自动、全局、配体、残基。

枚举值：

  • AUTO
  • GLOBAL
  • LIGAND
  • RESIDUES

pockets

Array of DrugBoundingBoxDto objects

口袋列表。

数组长度：1 - 10
表7 DrugBoundingBoxDto

参数

参数类型

描述

center

Array of floats

口袋中心坐标；x, y, z轴的坐标。

最小值：-9999999

最大值：99999999

数组长度：3 - 3

size

Array of floats

口袋尺寸大小；x, y, z轴的大小。

最小值：2

最大值：500

数组长度：3 - 3

请求示例

{
  "mode" : "AUTO",
  "receptor_file" : {
    "source" : "EXTRANET",
    "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb"
  }
}

响应示例

状态码： 200

受体口袋检测成功响应。

{
  "mode" : "AUTO",
  "pockets" : [ {
    "center" : [ 39.067, 26.472, 51.635 ],
    "size" : [ 6.668, 8.465, 6.582 ]
  }, {
    "center" : [ 29.013, 37.992, 54.6 ],
    "size" : [ 3.468, 2.754, 5.233 ]
  }, {
    "center" : [ 34.946, 18.73, 45.517 ],
    "size" : [ 5.178, 6.133, 5.156 ]
  }, {
    "center" : [ 32.901, 33.444, 61.459 ],
    "size" : [ 3.664, 4.93, 3.59 ]
  }, {
    "center" : [ 53.883, 17.701, 48.675 ],
    "size" : [ 3.281, 2, 10.053 ]
  }, {
    "center" : [ 47.861, 17.39, 37.703 ],
    "size" : [ 5.231, 2, 3.53 ]
  } ]
}

状态码

状态码

描述

200

受体口袋检测成功响应。

错误码

请参见错误码。

父主题： 药物通用接口

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