更新时间:2024-02-07 GMT+08:00
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配体格式转换为SMILES

功能介绍

配体格式转换为SMILES,若配体文件中存在多个分子,则只取第一个返回

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

String

项目ID,您可以从获取项目ID中获取。

最小长度:1

最大长度:128

eihealth_project_id

String

平台项目ID。

最小长度:1

最大长度:128

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

String

用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

最小长度:1

最大长度:32768

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)

枚举值:

  • EXTRANET

  • PRIVATE

  • PUBLIC

  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI、CIF,仅数据源为RAW时提供

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供

最小长度:0

最大长度:10000000

响应参数

状态码: 200

表4 响应Body参数

参数

参数类型

描述

smiles

String

分子SMILES表达式

最小长度:1

最大长度:512

请求示例

配体格式转换为SMILES,若配体文件中存在多个分子,则只取第一个返回

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles

{
  "source" : "RAW",
  "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb",
  "format" : "PDB",
  "data" : "MODEL1.xxxxxxx.END"
}

响应示例

状态码: 200

配体格式转换为SMILES成功响应

{
  "smiles" : "[H]OC(=O)c1c(C=O)cc(CC(C(=O)N([H])C2CCCCN(Cc3ccc(-c4ccccc4)cc3)C2=O)N([H])C(C)=O)cc1"
}

状态码

状态码

描述

200

配体格式转换为SMILES成功响应

错误码

请参见错误码

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