查询靶点优化作业详情
功能介绍
查询靶点优化作业详情。
URI
GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/target-optimization/{job_id}
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
project_id |
是 |
String |
项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 |
eihealth_project_id |
是 |
String |
平台项目ID。 最小长度：1 最大长度：128 |
job_id |
是 |
String |
作业id。 最小长度：1 最大长度：128 |
请求参数
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token |
是 |
String |
用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 |
响应参数
状态码： 200
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
basic_info |
DrugJobDto object |
作业基本信息。 |
receptor |
TargetOptReceptor object |
受体文件。 |
ligand |
TargetOptLigand object |
配体文件。 |
md_params |
MdParam object |
MD参数配置。 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
id |
String |
作业id。 |
name |
String |
作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。 |
labels |
Array of strings |
作业标签。 |
status |
String |
作业状态。 |
type |
String |
作业类型。 |
create_time |
String |
作业创建时间。 |
finish_time |
String |
作业结束时间。 |
start_time |
String |
作业开始时间。 |
failed_message |
String |
失败提示，当作业执行失败时会返回。 |
user_name |
String |
创建任务的用户名称。 |
output_dir |
String |
作业结果输出目录。 |
expect_charge_num |
Double |
预估功能调用消耗次数。 |
real_charge_num |
Double |
实际功能调用消耗次数。 |
progress |
Progress object |
作业进度信息。 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
file |
ReceptorDrugFileobject |
受体文件。 |
balanced_charge |
Boolean |
是否平衡电荷。 缺省值：true |
water_model |
String |
水模型, 支持选择spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p。 缺省值：tip3p |
force_field |
String |
蛋白立场，支持选择amber03, amber94, amber96, amber99, amber99sb, amber99sb-ildn, amberGS, charmm27, oplsaa, gromos43a1, gromos43a2, gromos45a3, gromos53a5, gromos53a6, gromos54a7。 缺省值：amber99sb |
ion_type |
String |
离子种类，支持选择NaCl、MgCl2、None，若设置了平衡电荷不支持选择None。 缺省值：NaCl |
ion_concentration |
Float |
离子浓度，单位mol/L，若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。 最小值：0 最大值：5.0 缺省值：0.15 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
source |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
|
url |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
format |
String |
文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
data |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
file |
ProbeDrugFile object |
配体文件。 |
force_field |
String |
配体力场, 支持选择gaff, gaff2。 缺省值：gaff |
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
source |
String |
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值：
|
url |
String |
文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 |
format |
String |
文件格式，支持PDB、SDF、MOL2，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 |
data |
String |
文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
|---|---|---|
timestep_size |
Float |
MD模拟的时间步长，单位fs，取值范围：大于0，小于等于5。 最小值：0 最大值：5.0 缺省值：2 |
temperature |
Float |
MD模拟的温度，单位K。 最小值：0 最大值：1000.0 缺省值：300 |
step_params |
MdStepParam object |
计算步骤参数 |
请求示例
无
响应示例
状态码： 200
OK
{
"basic_info" : {
"id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
"name" : "demo-job",
"labels" : [ "labelA", "labelB" ],
"status" : "FINISHED",
"type" : "OPTIMIZATION",
"create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
"finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
"failed_message" : "null",
"user_name" : "demo-user-name",
"output_dir" : "job-analysis/job-name",
"expect_charge_num" : 1,
"real_charge_num" : 1
},
"receptor" : {
"file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"balanced_charge" : true,
"water_model" : "tip3p",
"force_field" : "amber99sb",
"ion_type" : "NaCl",
"ion_concentration" : 0.15
},
"ligand" : {
"file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/dir/file"
},
"force_field" : "gaff"
},
"md_params" : {
"timestep_size" : 2,
"temperature" : 300,
"step_params" : {
"energy_minimization_steps" : 10000,
"nvt" : 200,
"npt" : 500,
"simulation_time" : 50
}
}
}
状态码
状态码 |
描述 |
|---|---|
200 |
OK |
错误码
请参见错误码。
