查询自由能微扰作业详情

功能介绍

查询自由能微扰作业详情。

URI

GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep/{job_id}

表1 路径参数
参数	是否必选	参数类型	描述
project_id	是	String	项目ID，您可以从获取项目ID中获取。最小长度：1 最大长度：128
eihealth_project_id	是	String	平台项目ID。最小长度：1 最大长度：128
job_id	是	String	作业id。最小长度：1 最大长度：128

请求参数

表2 请求Header参数
参数	是否必选	参数类型	描述
X-Auth-Token	是	String	用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。最小长度：1 最大长度：32768

响应参数

状态码： 200

表3 响应Body参数
参数	参数类型	描述
basic_info	DrugJobDto object	作业基本信息。
receptor	ReceptorDrugFile object	受体文件。
add_membrane	Boolean	是否加膜处理。缺省值：false
ligands	Array of LigandPreviewDto objects	配体列表。
graph	FepGraphDto object	路径图。
params	FepParamDto object	FEP设置参数。
job_result	JobResult object	作业结果信息。
part_failed_reason	Array of FailedReasonRecord objects	部分失败原因和数量。

表4 DrugJobDto
参数	参数类型	描述
id	String	作业id。
name	String	作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。
labels	Array of strings	作业标签。
status	String	作业状态。
type	String	作业类型。
create_time	String	作业创建时间。
finish_time	String	作业结束时间。
start_time	String	作业开始时间。
failed_message	String	失败提示，当作业执行失败时会返回。
user_name	String	创建任务的用户名称。
output_dir	String	作业结果输出目录。
expect_charge_num	Double	预估功能调用消耗次数。
real_charge_num	Double	实际功能调用消耗次数。
progress	Progress object	作业进度信息。
upstream_job_info	String	上游作业信息。

表5 Progress
参数	参数类型	描述
overall	Float	整体进度。
estimated_finish_time	Long	预计结束时间，毫秒。

表6 ReceptorDrugFile
参数	参数类型	描述
source	String	受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW
url	String	文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000
format	String	文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6
data	String	文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000

表7 LigandPreviewDto
参数	参数类型	描述
index	Integer	配体索引（从0起编号）。最小值：0 最大值：99
file	DrugFile object	配体文件
name	String	配体名称，若无名称则自动命名，格式为UNK+索引（从1起编号）。最小长度：1 最大长度：32
smiles	String	分子SMILES表达式。最小长度：1 最大长度：512

表8 DrugFile
参数	参数类型	描述
source	String	受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW
url	String	文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。最小长度：1 最大长度：2000
format	String	文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。最小长度：1 最大长度：6
data	String	文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。最小长度：0 最大长度：10000000

表9 FepGraphDto
参数	参数类型	描述
center_id	String	中心配体名称。最小长度：1 最大长度：32
pairs	Array of SimilarityDto objects	配体对列表。数组长度：1 - 100

**表10** SimilarityDto
参数	参数类型	描述
ligand_ids	Array of strings	配体对。最小长度：1 最大长度：32 数组长度：2 - 2

**表11** FepParamDto
参数	参数类型	描述
pre_equilibrium_time	Float	预平衡时长，单位ps，范围为0-200，不包含0，默认为100ps。最小值：0 最大值：200.0
equilibrium_time	Float	平衡时长，单位ns，范围为0-10，不包含0，默认为1ns。最小值：0 最大值：10.0
num_pre_equilibrium_steps	Integer	预平衡步数，默认为50000。最小值：1 最大值：200000
num_equilibrium_steps	Integer	平衡步数，默认为500000。最小值：1 最大值：10000000
timestep_size	Float	时间步长，单位ps，取值范围：大于0，小于等于0.005。最小值：0.001 最大值：0.005 缺省值：0.002
num_lambda	Integer	lambda个数。最小值：2 最大值：30 缺省值：20

**表12** JobResult
参数	参数类型	描述
total_count	Integer	输入总数。
failed_count	Integer	失败个数。
sub_tasks_duration	Array of floats	子任务运行时长（秒）。数组长度：1 - 30

**表13** FailedReasonRecord
参数	参数类型	描述
reason	String	失败原因。
count	Integer	失败数量。

请求示例

无

响应示例

状态码： 200

{
  "basic_info" : {
    "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
    "name" : "demo-job",
    "labels" : [ "labelA", "labelB" ],
    "status" : "FINISHED",
    "type" : "OPTIMIZATION",
    "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
    "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
    "failed_message" : "null",
    "user_name" : "demo-user-name",
    "output_dir" : "job-analysis/job-name",
    "expect_charge_num" : 1,
    "real_charge_num" : 1
  },
  "receptor" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/dir/file"
  },
  "ligands" : [ {
    "name" : "GLY:A:514",
    "smiles" : "C1CCCCC1",
    "index" : 0,
    "file" : {
      "source" : "RAW",
      "format" : "PDB",
      "data" : "MODEL1.xxxxxxx.END"
    }
  }, {
    "name" : "UNK1",
    "smiles" : "c1ccccc1",
    "index" : 0,
    "file" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/dir/file"
    }
  } ],
  "graph" : {
    "center_id" : "GLY:A:514",
    "pairs" : [ {
      "ligand_ids" : [ "GLY:A:514", "DrugBank:UNK1" ]
    } ]
  },
  "params" : {
    "num_pre_equilibrium_steps" : 50000,
    "num_equilibrium_steps" : 500000,
    "timestep_size" : 0.002,
    "num_lambda" : 20
  },
  "job_result" : {
    "total_count" : 10,
    "failed_count" : 1
  }
}