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更新时间：2024-12-13 GMT+08:00
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查询自由能微扰作业详情

功能介绍

查询自由能微扰作业详情。

URI

GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/fep/{job_id}

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

是

String

项目ID，您可以从获取项目ID中获取。

最小长度：1

最大长度：128

eihealth_project_id

是

String

平台项目ID。

最小长度：1

最大长度：128

job_id

是

String

作业id。

最小长度：1

最大长度：128

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

是

String

用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

最小长度：1

最大长度：32768

响应参数

状态码： 200

表3 响应Body参数

参数

参数类型

描述

basic_info

DrugJobDto object

作业基本信息。

receptor

ReceptorDrugFile object

受体文件。

add_membrane

Boolean

是否加膜处理。

缺省值：false

ligands

Array of LigandPreviewDto objects

配体列表。

graph

FepGraphDto object

路径图。

params

FepParamDto object

FEP设置参数。

job_result

JobResult object

作业结果信息。

part_failed_reason

Array of FailedReasonRecord objects

部分失败原因和数量。
表4 DrugJobDto

参数

参数类型

描述

id

String

作业id。

name

String

作业的名称，取值范围：[1,63]，允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)。

labels

Array of strings

作业标签。

status

String

作业状态。

type

String

作业类型。

create_time

String

作业创建时间。

finish_time

String

作业结束时间。

start_time

String

作业开始时间。

failed_message

String

失败提示，当作业执行失败时会返回。

user_name

String

创建任务的用户名称。

output_dir

String

作业结果输出目录。

expect_charge_num

Double

预估功能调用消耗次数。

real_charge_num

Double

实际功能调用消耗次数。

progress

Progress object

作业进度信息。

upstream_job_info

String

上游作业信息。
表5 Progress

参数

参数类型

描述

overall

Float

整体进度。

estimated_finish_time

Long

预计结束时间，毫秒。
表6 ReceptorDrugFile

参数

参数类型

描述

source

String

受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。

枚举值：

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度：1

最大长度：2000

format

String

文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：1

最大长度：6

data

String

文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：0

最大长度：10000000
表7 LigandPreviewDto

参数

参数类型

描述

index

Integer

配体索引（从0起编号）。

最小值：0

最大值：99

file

DrugFile object

配体文件

name

String

配体名称，若无名称则自动命名，格式为UNK+索引（从1起编号）。

最小长度：1

最大长度：32

smiles

String

分子SMILES表达式。

最小长度：1

最大长度：512
表8 DrugFile

参数

参数类型

描述

source

String

受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。

枚举值：

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度：1

最大长度：2000

format

String

文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：1

最大长度：6

data

String

文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。

最小长度：0

最大长度：10000000
表9 FepGraphDto

参数

参数类型

描述

center_id

String

中心配体名称。

最小长度：1

最大长度：32

pairs

Array of SimilarityDto objects

配体对列表。

数组长度：1 - 100
表10 SimilarityDto

参数

参数类型

描述

ligand_ids

Array of strings

配体对。

最小长度：1

最大长度：32

数组长度：2 - 2
表11 FepParamDto

参数

参数类型

描述

pre_equilibrium_time

Float

预平衡时长，单位ps，范围为0-200，不包含0，默认为100ps。

最小值：0

最大值：200.0

equilibrium_time

Float

平衡时长，单位ns，范围为0-10，不包含0，默认为1ns。

最小值：0

最大值：10.0

num_pre_equilibrium_steps

Integer

预平衡步数，默认为50000。

最小值：1

最大值：200000

num_equilibrium_steps

Integer

平衡步数，默认为500000。

最小值：1

最大值：10000000

timestep_size

Float

时间步长，单位ps，取值范围：大于0，小于等于0.005。

最小值：0.001

最大值：0.005

缺省值：0.002

num_lambda

Integer

lambda个数。

最小值：2

最大值：30

缺省值：20
表12 JobResult

参数

参数类型

描述

total_count

Integer

输入总数。

failed_count

Integer

失败个数。

sub_tasks_duration

Array of floats

子任务运行时长（秒）。

数组长度：1 - 30
表13 FailedReasonRecord

参数

参数类型

描述

reason

String

失败原因。

count

Integer

失败数量。

请求示例

无

响应示例

状态码： 200

OK

{
  "basic_info" : {
    "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1",
    "name" : "demo-job",
    "labels" : [ "labelA", "labelB" ],
    "status" : "FINISHED",
    "type" : "OPTIMIZATION",
    "create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z",
    "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z",
    "failed_message" : "null",
    "user_name" : "demo-user-name",
    "output_dir" : "job-analysis/job-name",
    "expect_charge_num" : 1,
    "real_charge_num" : 1
  },
  "receptor" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/dir/file"
  },
  "ligands" : [ {
    "name" : "GLY:A:514",
    "smiles" : "C1CCCCC1",
    "index" : 0,
    "file" : {
      "source" : "RAW",
      "format" : "PDB",
      "data" : "MODEL1.xxxxxxx.END"
    }
  }, {
    "name" : "UNK1",
    "smiles" : "c1ccccc1",
    "index" : 0,
    "file" : {
      "source" : "PRIVATE",
      "url" : "project:/dir/file"
    }
  } ],
  "graph" : {
    "center_id" : "GLY:A:514",
    "pairs" : [ {
      "ligand_ids" : [ "GLY:A:514", "DrugBank:UNK1" ]
    } ]
  },
  "params" : {
    "num_pre_equilibrium_steps" : 50000,
    "num_equilibrium_steps" : 500000,
    "timestep_size" : 0.002,
    "num_lambda" : 20
  },
  "job_result" : {
    "total_count" : 10,
    "failed_count" : 1
  }
}

状态码

状态码

描述

200

OK

错误码

请参见错误码。

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