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更新时间:2024/12/16 GMT+08:00
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本文介绍了医疗智能体 EIHealth各特性版本的功能发布和对应的文档动态,欢迎体验。

2024年12月

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1

收藏夹功能

作业结果的列表、卡片、3D页面支持进行分子收藏。

商用

收藏夹

2

genomeagent镜像

智能体AI Agent,被设计为具有独立思考和行动能力的AI程序,只需提供一个研究目标和数据路径,即可自适应生成一个任务序列执行分析任务。生信智能体AI Agent可以应对激增的多组学数据分析需求、高成本的生物信息学培训和满足不同应用场景的个性化需求,为多领域生命科学研究提供高效、定制化的数据分析支持。

商用

使用genomeagent镜像

3

靶点口袋分子设计

设计方式支持片段生长,页面进行了排版优化。

商用

靶点口袋分子设计

4

聚类作业

通用工具中增加聚类功能。

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聚类分析

5

分子生成

对接引擎支持DSDP;DSDP支持全局对接。

商用

分子生成

6

下载弹窗页面

下载的小分子支持sdf格式。

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功能模块

7

分子对接

对接引擎支持Similar Docking,DSDP支持全局对接。

商用

分子对接

8

分子优化

对接引擎支持DSDP;DSDP支持全局对接。

商用

分子优化

9

自由能微扰

支持膜蛋白,计费规则变更。

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自由能微扰

2024年08月

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1

自由能微扰

自由能微扰支持膜蛋白。

商用

自由能微扰

2

靶点口袋分子设计

靶点口袋分子设计结果支持按照相互作用力进行筛选。

商用

靶点口袋分子设计

3

分子对接

分子对接支持DSDP对接引擎;分子对接结果支持按照相互作用力进行筛选。

商用

分子对接

4

分子优化

分子优化用户可以添加Interaction相互作用力,并且支持按照相互作用力进行筛选。

商用

分子优化

5

CPI

CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配,精确的预测化合物-蛋白相互作用。

商用

CPI预测

6

分子生成

分子生成基于盘古药物分子大模型,对初始数据集进行采样,多目标、多方向的快速生成新颖且与靶点蛋白亲和力高的化合物。

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分子生成

7

靶点优化

靶点优化基于GROMACS分子动力学模拟和结构聚类,实现靶点结构优化。

商用

靶点优化

2024年03月

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1

盘古辅助制药平台新增自定义数据库

盘古辅助制药平台新增自定义数据库功能,客户可以上传自己的数据库,在平台上进行管理,还可追加数据库。每个数据库可以保存小分子结构还可以保存数据库中小分子的其他信息。

商用

用户指南

2

盘古辅助制药平台新增分子搜索

盘古辅助制药平台新增分子搜索功能, 可以根据相似度或者骨架搜索官方数据库和自定义数据库来筛选苗头化合物。官方数据库包含DrugBank、陶术、ZINC、DrugSpaceX数据库。

商用

用户指南

3

盘古辅助制药平台新增分子优化支持双靶点

分子优化支持双靶点,可以通过设置双靶点,设计双靶点分子。

商用

用户指南

4

盘古辅助制药平台新增分子详情页

盘古辅助制药平台新增分子详情页,在分子优化、分子搜索、分子对接增加分子详情页,可以很直观的看到分子的属性信息。

商用

用户指南

5

盘古辅助制药平台优化靶点口袋分子设计

口袋分子设计的结果增加一列综合打分score,并且结果根据score来进行降序。该分数是vina score、qed、sascore的加权综合评分。

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6

盘古辅助制药平台优化靶点口袋发现

盘古辅助制药平台优化靶点口袋发现功能,靶点口袋发现生成的口袋可以查看2D相互作用图。

商用

用户指南

7

盘古辅助制药平台优化自由能微扰

盘古辅助制药平台优化自由能微扰功能增加新增路径布局算法。

商用

用户指南

8

盘古辅助制药平台优化分子对接

分子对接结果列表中的配体对比支持上传原始配体文件,来进行对比查看。

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2024年01月

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1

盘古辅助制药平台优化自由能微扰

  • 将原来的预平衡、平衡步数转换成时长,扩大平衡时长的规格最多支持10ns。

  • 开放λ可配置,范围为2-30个。

商用

用户指南

2

盘古辅助制药平台靶点口袋分子设计新增骨架跃迁功能

在靶点口袋分子设计模块中新增骨架跃迁功能,利用骨架跃迁设计新的小分子。

商用

用户指南

3

盘古辅助制药平台新增计费功能

  • 平台新增包月计费模式。

  • 靶点口袋分子设计开始收费,提交一次任务并且运行成功,则按照一次调用收费。

商用

用户指南

4

盘古辅助制药平台新增小分子聚类

  • 在分子优化、靶点口袋分子生成、分子对接、ADMET结果页面可以直接点击聚类分析。

  • 聚类分析的方法是scaffold。

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5

盘古辅助制药平台优化靶点口袋分子设计

支持对小分子进行编辑和标记侧链生长位点来设计小分子。

商用

用户指南

6

盘古辅助制药平台优化分子优化

在配置时,可以查看约束条件的最佳范围,以及约束条件的描述。

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用户指南

7

盘古辅助制药平台优化作业结果

  • 添加小分子卡片视图,可以查看分子大图。涉及分子对接、分子优化、分子属性预测、靶点口袋分子设计。

  • 不同视图的下载操作统一化,可选列表还是3D构象,也支持下载全量内容还是选中内容。

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用户指南

8

盘古辅助制药平台优化分子对接

  • 计费调整成:2w对算一次调用。调用次数 = 提交对数 / 2w, 保留5位小数。

  • 支持对受体蛋白进行按照Vina Score排序。

  • 提交作业前可以对蛋白质进行加氢处理。

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9

盘古辅助制药平台优化自定义模型(专业版)

输出训练集的Loss曲线和模型在验证集上的评估指标结果,回归型的模型会给出:RMSE、MAE、MSE、R²、PCC;二分型会给出AUC和ACC。

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用户指南

10

盘古辅助制药平台优化ADMET属性预测

  • 计费调整成:2w个算一次调用。调用次数 = 提交个数 / 2w, 保留5位小数。

  • 支持一百万小分子的分子属性预测。

  • 新增四种属性预测:CYP2C19 inhibitor、CYP2C19 substrate、CYP2D6inhibitor、CYP2D6 substrate。

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2023年11月

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1

盘古辅助制药平台支持靶点口袋发现功能模块

靶点口袋发现实现全新元动力学算法,高效遍历柔性蛋白表面,找到潜在口袋位置。

商用

用户指南

2

盘古辅助制药平台支持靶点口袋分子设计

基于盘古药物分子大模型,靶点口袋分子设计功能主要是能够根据给定的口袋和小分子利用AI的预测出更优小分子。

商用

用户指南

3

盘古辅助制药平台支持AI模型

盘古辅助制药平台专业版本支持用户创建AI模型。创建成功的AI模型可以在分子优化功能模块,靶点口袋分子设计功能模块,分子属性预测功能模块使用。

    商用

    用户指南

    2023年08月

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    1

    医疗智能体支持盘古辅助制药平台

    盘古辅助制药平台是以盘古药物大模型为基础打造的一站式药研平台,助力药物研发效率提升60%+。平台提供靶点发现,苗头化合物发现,先导化合物优化全流程药研所需功能。同时基于云原生的软硬件一体化加速,大大提升虚拟筛选和分子动力学模拟计算效率。全平台无需软硬件安装调试成本,开箱即用,随时可用。全平台包括盘古辅助制药赋能药物研发的全链条任务,将新药研发从“马拉松”迈向“加速跑”。

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    2023年04月

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    1

    医疗智能体基因平台支持计算资源节点自动扩缩容

    医疗智能体(EIHealth)平台支持用户设置节点自动扩缩容策略,以便满足客户业务对节点的需求。

    商用

    用户指南

    2

    医疗智能体基因平台支持Nextflow功能

    Nextflow是专门针对生物信息流程搭建而开发的一种框架语言,它能够很好的管理生信流程,并且将其与Conda、Docker、Singularity结合起来使用,可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移,并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型,因此不用自己去写复杂的并行化的程序,只需要关注“数据流”即可。流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样本数目,大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。

    医疗智能体(EIHealth)平台集成了Nextflow框架,支持用户直接在医疗智能体(EIHealth)平台安装Nextflow。

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    用户指南

    2023年01月

    序号

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    1

    华为云AI辅助药物设计服务支持上传受体进行对接打分优化

    将对接打分作为一个约束条件进行分子优化和分子生成,使得分子优化和分子生成不仅只考虑物化性质,还考虑了与受体的结合活性。当靶点已知的场景下,可以使用该特性,且可以大大的提升客户对分子优化和分子生成结果的后续筛选效率。

    商用

    药物设计API介绍

    2

    华为云AI辅助药物设计服务中分子搜索支持ZINC数据库

    分子搜索新增ZINC数据库。该新增数据库可以方便客户查询输入小分子在ZINC数据库中的相似分子。

    商用

    分子搜索API介绍

    3

    华为云AI辅助药物设计服务支持多个子结构强约束

    在一个子结构约束条件中添加多个子结构,子结构之间的关系为“or”,两个子结构约束条件之间的关系为“and”,通过这种方式可以进行子结构约束条件之间的多种方式组合。

    商用

    药物设计API介绍

    2022年10月

    序号

    功能名称

    功能描述

    阶段

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    1

    华为云AI辅助药物设计服务中分子生成支持初始小分子库

    分子生成支持上传活性小分子库,从而对小分子库进行药物化学空间采样生成具有相同活性的分子。该特性可以扩大应用场景,可以使客户根据自己的活性小分子数据库生成具有相似活性且新颖的小分子库。

    商用

    分子生成API介绍

    2

    医疗智能体支持用户发布镜像,数据,应用和流程到资产市场

    用户可以发布镜像,数据,应用和流程到资产市场,方便进行订阅。

    商用

    用户指南

    3

    医疗智能体支持用户对某个数据设置禁止/允许删除数据内容

    您可以对某个数据设置禁止删除。设置禁止删除后,该目录只能添加数据,不支持删除数据。也可以通过“允许删除”取消禁止删除设置。

    商用

    用户指南

    4

    医疗智能体支持用户设置项目最大存储容量

    医疗智能体支持项目管理员以上角色,配置项目的最大存储量。

    商用

    用户指南

    5

    医疗智能体支持统计出对应节点的CPU、内存、磁盘等使用量

    计算资源支持选择一部分节点,统计出对应节点的资源使用量。如CPU、内存、磁盘、入网带宽等相关使用情况。

    商用

    用户指南

    2022年09月

    序号

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    阶段

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    1

    华为云AI辅助药物设计服务中分子属性预测ADMET模型升级

    对25个ADMET预测模型进行升级提高预测精度,对分子设计的结果也会有一定提升。

    商用

    分子属性预测API

    2

    华为云AI辅助药物设计服务防止滥用保护

    该特性限制了对敌敌畏和海洛因等毒性分子进行优化,并且分子设计不能进行以高毒性为目标。

    商用

    药物设计API介绍

    3

    华为云AI辅助药物设计服务支持受限子结构约束

    分子生成、分子优化支持受限子结构约束,允许子结构约束限制修改位置。该特性可以扩大客户的应用场景,对子结构进行限制,可以约束分子生长的方向,从而可以更有方向的进行分子生成和分子优化。

    商用

    药物设计API介绍

    2022年06月

    序号

    功能名称

    功能描述

    阶段

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    1

    华为云AI辅助药物设计API更新分子生成/分子优化模型

    华为云AI辅助药物设计API,更新了分子生成的采样器,使生成的分子在满足所设置的约束基础上成药性更好;更新了分子优化的采样器,使优化后的分子在保持与参考分子的相似度基础上具有较好的新颖性;更新了分子生成/分子优化中的弱约束初始化权重;提高了分子生成/分子优化的计算量和迭代次数。

    公测

    开通药物设计API

    药物设计API介绍

    2

    华为云AI辅助药物设计API更新分子属性预测模型

    华为云AI辅助药物设计API,对分子属性预测中人体口服生物利用度F20、F30预测模型进行了更新。并修复了分子属性预测中HIA、F20、F30颜色标注的问题。

    公测

    开通药物设计API

    药物设计API介绍

    2022年04月

    序号

    功能名称

    功能描述

    阶段

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    1

    上线药物、临床API,支持靶点化合物结合预测、诊断建议生成等功能。

    医疗智能体EIHealth,上线药物、临床API。

    药物模块:支持分子生成、分子优化、靶点化合物结合预测、分子属性预测功能。

    临床模块:支持诊断建议生成、鉴别与检验,治疗建议生成功能。

    公测

    开通药物、临床API

    2022年03月

    序号

    功能名称

    功能描述

    阶段

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    1

    通过计算节点标签调度作业任务

    支持计算节点添加标签,在创建和编辑应用时可选择计算节点标签,运行作业时会将该应用调度到对应的计算节点上。

    商用

    用户指南

    2

    IO加速节点调度优化

    在IO加速场景下,支持用户选择自动调度模式。增加IO加速节点容量控制,超出容量阈值之后,作业将不会投递至该节点。

    商用

    用户指南

    3

    数据引用功能增强,并支持跨区归档

    支持从根目录引用其他项目或者OBS桶中的数据,增大单次可引用目录至50个。支持数据的跨区域归档功能。

    商用

    用户指南

    4

    优化数据审计功能,支持记录读日志以及审计日志记录存储时长

    增加数据审计配置,支持记录读日志以及审计日志记录存储时长。

    商用

    用户指南

    2022年01月

    序号

    功能名称

    功能描述

    阶段

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    1

    基因平台、药物平台支持按需计费,提供多种算力存储选择

    医疗智能体平台支持按需计费,提供多种算力、存储、数据库规格。满足基因组数据管理分析、虚拟药物筛选等需求。

    商用

    产品介绍

    2021年08月

    序号

    功能名称

    功能描述

    阶段

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    1

    医疗智能体EIHealth平台迭代更新

    资产市场,提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。 提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。

    商用

    用户指南

    命令行工具

    API参考

    2021年03月

    序号

    功能名称

    功能描述

    阶段

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    1

    医疗智能体EIHealth平台迭代更新

    支持消息、邮件、安全、商标设置。 支持通过命令行工具对平台进行管理和使用,支持Windows、Linux系统。 开放API 优化 优化流程的搭建和运行过程。

    商用

    用户指南

    命令行工具

    API参考

    2020年11月

    序号

    功能名称

    功能描述

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    1

    平台界面风格更新,新增项目管理,预置流程,项目间资产共享,开发环境升级,应用、流程支持X86、ARM运行,新增消息中心

    项目管理:以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 预置流程:预置流程包括NGS、GATK、Cell Ranger和Druglikeness。 项目间资产共享:实现跨项目数据、应用、流程的使用。 开发环境:预置基因组自动建模工具AutoGenome,提供多种AI引擎切换。 应用、流程支持X86、ARM运行。 消息中心:支持异步任务提示。

    商用

    项目管理

    数据管理

    工具管理

    分析作业管理

    开发环境

    2020年08月

    序号

    功能名称

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    1

    医疗智能体EIHealth平台上线

    基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源,是一站式的医疗研发平台。

    商用

    产品介绍

    用户指南

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