更新时间:2024-05-09 GMT+08:00
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受体预处理

功能介绍

受体预处理,用于前端显示预处理后的受体。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/preprocess

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

String

项目ID,您可以从获取项目ID中获取。

最小长度:1

最大长度:128

eihealth_project_id

String

平台项目ID。

最小长度:1

最大长度:128

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

String

用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

最小长度:1

最大长度:32768

表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

file

ReceptorDrugFileReq object

受体文件。

remove_water

Boolean

去除水分子。

缺省值:false

remove_ion

Boolean

去除离子。

缺省值:false

remove_ligand

Boolean

去除配体分子。

缺省值:false

add_hydrogen

Boolean

增加氢原子。

缺省值:false

表4 ReceptorDrugFileReq

参数

是否必选

参数类型

描述

source

String

受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。

枚举值:

  • EXTRANET
  • PRIVATE
  • PUBLIC
  • RAW

url

String

文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。

最小长度:1

最大长度:2000

format

String

文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:1

最大长度:6

data

String

文件原始数据,仅数据源为RAW时提供。

最小长度:0

最大长度:10000000

add_hydrogen

Boolean

增加氢原子。

缺省值:true

响应参数

请求示例

{
  "file" : {
    "source" : "EXTRANET",
    "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb"
  }
}

响应示例

状态码: 200

预处理成功响应。

CRYST1   48.140   48.140  135.230  90.00  90.00  90.00 P 43 2 2      1
ATOM      1  N   ALA A   1      35.884  42.999  47.573  1.00 25.71           N
ATOM      2  CA  ALA A   1      36.605  42.605  46.370  1.00 25.42           C
ATOM      3  C   ALA A   1      36.452  41.114  46.099  1.00 28.64           C
ATOM      4  O   ALA A   1      36.341  40.696  44.945  1.00 29.91           O
ATOM      5  CB  ALA A   1      38.067  42.957  46.503  1.00 25.88           C
ATOM      6  N   PHE A   2      36.444  40.321  47.165  1.00 22.84           N
ATOM      7  CA  PHE A   2      36.284  38.877  47.030  1.00 24.16           C
ATOM      8  C   PHE A   2      34.841  38.439  46.851  1.00 31.28           C
ATOM      9  O   PHE A   2      34.564  37.311  46.446  1.00 33.32           O
ATOM     10  CB  PHE A   2      36.891  38.155  48.230  1.00 25.68           C
ATOM     11  CG  PHE A   2      38.356  38.400  48.371  1.00 27.21           C
...
ATOM    978  CG1 VAL A 125      28.999  36.704  35.986  1.00 42.41           C
ATOM    979  CG2 VAL A 125      28.985  36.848  38.447  1.00 40.25           C
ATOM    980  OXT VAL A 125      30.927  33.454  36.764  1.00 62.81           O1-
TER

状态码

状态码

描述

200

预处理成功响应。

错误码

请参见错误码

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