基因容器（GeneContainer Service）提供云端基因测序解决方案，支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。基于轻量级容器技术，结合大数据、深度学习算法，优化官方标准算法，提供灵活可定制的测序流程、秒极可伸缩的高可靠资源 产品介绍 图说E CS 立即使用 立即使用

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Service，GCS）提供云端基因解决方案，支持DNA、RNA等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大数据、深度学习算法，优化官方标准算法，为您提供灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源。 基因容器作为基因测序端到端完整解决方案，为您提供数据管理、测序工具平台、流程定义能力、运

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Based On NGS 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序、表观遗传学等领域。 该流程以

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基因容器（GeneContainer Service，GCS）提供云端基因测序解决方案，支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大数据、深度学习算法，优化官方标准算法，为您提供灵活可定制的测序流程、秒极可伸缩的高可靠资源。 基因容器提供了REST（Representational

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和存储资源付费，不需要支付资源之外的附加费用。通过WDL格式的模板创建WDL作业。广泛应用于基因测序、药物检测等领域。 GCS作业 通过GCS格式的模板创建GCS作业。广泛应用于DNA、RNA、液态活检等主流生物基因分析、药物检测等领域。 父主题： 作业管理

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高性能计算 生物医药（基因测序） 场景概述 生物医药包含基因测序，DNA变异检测等技术，随着人们对于健康关注度不断提高，基因测序等现代健康检测和预测手段正快速推广普及。基因测序是通过测序仪将不可视的生物信息转换为可视的文本信息，并依托计算、存储和大数据等资源，结合生物信息算法对文本信息进行分析和研究。

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Service，简称GCS）提供云端基因测序解决方案，支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。 基因容器服务对GATK 4.0官方所推荐的最佳实践流程进行封装，让您能快速基于GATK最佳实践流程完成原数据分析。该流程为Broad Institute官方推荐流程，用于全基因组测序比对、去重、碱基

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S的API执行测序，待测序完成后获取测序结果并返回给用户。 GCS服务：提供底层测序API共测序平台调用。 从上面的描述可以看出，测序平台相当于用户与GCS之间的一个代理，将用户的测序请求转发给GCS处理，然后获取测序结果返回给用户。当然测序平台处理转发测序请求外，还可以做很多其

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GAUSS-04376: "explain_dna_file should be .csv file." SQLSTATE: XX000 错误原因：设置的文件名称不是.csv格式的。 解决办法：设置成.csv格式的文件名即可。 GAUSS-04377: "explain_dna_file should

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使用命令行工具执行测序 本示例通过指导您创建CCI命名空间、绑定文件存储卷，使用命令行工具查询和设置环境、查询和设置SFS存储卷、创建execution执行测序及查看计算结果，帮助您学习如何使用命令行工具在云容器实例环境中执行测序。 操作步骤 使用命令行工具执行测序的操作步骤如下：

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查询workflow 查询测序流程详细信息 查询workflow输入 查询测序流程输入 查询workflow工具 查询测序流程的工具 查询workflow列表 查询测序流程列表 校验流程 校验流程合法性 创建execution 开始执行测序流程 批量创建execution 批量执行测序流程 删除execution

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桶添加成功后，第三方即可通过OBS Broswer上传和下载数据，基因测序厂商可获取到第三方上传的原始数据进行测序计算，输出分析结果。 注意事项 OBS桶的拥有者始终为基因测序厂商。测序服务完成后，基因测序厂商可根据需要删除桶或修改桶策略，收回共享权限。 基因测序厂商创建的桶必须配置2条高级桶策略，1条是桶级别策略，1条是对象级别策略。

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基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析

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流程（Workflow） 基因测序流程包含测序过程所需工具的执行先后信息以及数据输入输出等定义。流程由至少一个工具组成。流程中的各个工具由其前后顺序关系形成数据流，前序工具为后序工具提供输入。基因容器为您提供了多套典型的测序流程，基于此流程，您可以快速完成测序任务。 工具（Tool）

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NGS流程简介 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅地提高了测序速度，有力推动了相关研究。目前，NGS已广泛应用于全基因组测序、外显子测序、表观遗传学修饰等重要的生物学问题。

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整理好需要上传的基因测序文件。 登录高性能弹性文件服务控制台，创建一个文件系统用于存放基因测序文件。 登录作为头节点和计算节点的 云服务器 ，挂载文件系统。 通过头节点将需要上传的基因测序文件上传到挂载的文件系统。 登录计算节点，直接对挂载的文件系统中的基因测序文件进行编辑。 前提条件

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配置流程 整理好需要上传的基因测序文件。 登录弹性文件服务控制台，创建一个文件系统用于存放基因测序文件。 登录作为头节点和计算节点的云 服务器 ，挂载文件系统。 通过头节点将需要上传的基因测序文件上传到挂载的文件系统。 登录计算节点，直接对挂载的文件系统中的基因测序文件进行编辑。 前提条件

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Based On NGS流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以N

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on STAR流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以N

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创建三台云服务器，自动部署HPC开源调度软件Slurm，提供基因测序HPC环境。 创建弹性服务共享文件，为基因测序HPC环境提供共享文件存储服务。 安全组可以保护云服务器的网络安全，通过配置安全组规则，限定云服务器的访问端口。 云服务器管理节点绑定弹性公网IP，用于用户访问基因测序HPC环境。 在调度节点安装Gearbox程序、配置java环境。

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生物基因企业利用基因容器完成大规模基因组测序分析。 优势 极大提升计算速度，降低运算成本。 流程设计门槛低、方式多样，可以通过设计器、模板甚至可以直接从其他格式模板直接转换 不单独维护小资源池，可直接使用整个 华为云计算 资源作为基础。保证资源充足，无需排队 为生物测序行业量身定做的业务流程，更贴近用户场景。

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