更新时间:2024-07-24 GMT+08:00
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方案概述

应用场景

该解决方案基于开源软件Slurm构建,快速帮助用户在华为云云服务器上完成基因测序HPC环境的部署。Slurm是一个开源、容错和高度可扩展的集群管理和作业调度系统,适用于大型和小型Linux 集群。

方案架构

该解决方案部署架构如下图所示:

图1 方案架构图

该解决方案将会部署如下资源:

  • 创建三台云服务器,自动部署HPC开源调度软件Slurm,提供基因测序HPC环境。
  • 创建弹性服务共享文件,为基因测序HPC环境提供共享文件存储服务。
  • 安全组可以保护云服务器的网络安全,通过配置安全组规则,限定云服务器的访问端口。
  • 云服务器管理节点绑定弹性公网IP,用于用户访问基因测序HPC环境。
  • 在调度节点安装Gearbox程序、配置java环境。
  • 使用云监控服务,Gearbox程序监测集群作业状态,计算自定义指标workload值,上报指标到云监控服务。

方案优势

  • 高性能

    提供C6(通用计算增强型)、M6(内存优化型)等计算密集型ECS实例,搭载第二代英特尔® 至强® 可扩展处理器 ,计算性能强劲稳定,配套华为自研智能高速网卡,提供超高带宽和超低时延的网络体验。

  • 降本增效

    多种规格的计算资源和存储资源按需使用,精准匹配不同流程的IT资源需求,相同流程的成本最高可节省30%。

  • 一键部署

    一键轻松部署,即可完成资源的快速发放以及基因测序HPC环境的部署。

约束与限制

  • 部署该解决方案之前,需注册华为账号并开通华为云,完成实名认证,且账号不能处于欠费或冻结状态。如果计费模式选择“包年包月”,请确保账户余额充足以便一键部署资源的时候可以自动支付;或者在一键部署的过程进入费用中心,找到“待支付订单”并手动完成支付。
  • 请确保在部署解决方案前,使用的华为账号有IAM的足够权限,具体请参考3.1-创建rf_admin_trust委托
  • 确认租户配额充足:在“资源 > 我的配额”中查看以下配额是否充足,如配额不够,请提前提工单申请增加配额:
    • 计算:云服务器实例数、CPU核心数、RAM容量;
    • 存储:云硬盘、弹性文件服务;
    • 网络:虚拟私有云、子网、弹性公网IP、安全组等。
  • 目前仅华北-北京四区域支持华为云Flexus 云服务器X实例一键部署。

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