方案概述

应用场景

该解决方案基于开源软件Slurm构建，快速帮助用户在华为云弹性云服务器上完成基因测序HPC环境的部署。Slurm是一个开源、容错和高度可扩展的集群管理和作业调度系统，适用于大型和小型Linux 集群。

方案架构

该解决方案部署架构如下图所示：

图1 方案架构图

该解决方案将会部署如下资源：

• 创建三台弹性云服务器，自动部署HPC开源调度软件Slurm，提供基因测序HPC环境。
• 创建弹性服务共享文件，为基因测序HPC环境提供共享文件存储服务。
• 安全组可以保护弹性云服务器的网络安全，通过配置安全组规则，限定云服务器的访问端口。
• 弹性云服务器管理节点绑定弹性公网IP，用于用户访问基因测序HPC环境。
• 在调度节点安装Gearbox程序、配置java环境。
• 使用云监控服务，Gearbox程序监测集群作业状态，计算自定义指标workload值，上报指标到云监控服务。

方案优势

• 高性能

  提供C6（通用计算增强型）、M6（内存优化型）等计算密集型ECS实例，搭载第二代英特尔® 至强® 可扩展处理器 ，计算性能强劲稳定，配套华为自研智能高速网卡，提供超高带宽和超低时延的网络体验。

• 降本增效

  多种规格的计算资源和存储资源按需使用，精准匹配不同流程的IT资源需求，相同流程的成本最高可节省30%。

• 一键部署

  一键轻松部署，即可完成资源的快速发放以及基因测序HPC环境的部署。

约束与限制

• 部署该解决方案之前，您需注册华为云账户，完成实名认证，且帐号不能处于欠费或冻结状态，请根据资源和成本规划中预估价格，确保余额充足。
• 请确保在部署解决方案前，使用的华为云帐号有IAM的足够权限，具体请参考3.1-创建rf_admin_trust委托。
• 确认租户配额充足：在“资源 > 我的配额”中查看以下配额是否充足，如配额不够，请提前提工单申请增加配额：
  • 计算：弹性云服务器实例数、CPU核心数、RAM容量；
  • 存储：云硬盘、弹性文件服务；
  • 网络：虚拟私有云、子网、弹性公网IP、安全组等。