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基本概念

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更新时间: 2019/07/31 11:38

流程(Workflow)

基因测序流程包含测序过程所需工具的执行先后信息以及数据输入输出等定义。流程由至少一个工具组成。流程中的各个工具由其前后顺序关系形成数据流,前序工具为后序工具提供输入。基因容器为您提供了多套典型的测序流程,基于此流程,您可以快速完成测序任务。

工具(Tool)

工具是生物信息软件的镜像封装,工具既可以编排入流程串联使用,也可以独立使用,基因容器提供了大量的公共工具,同时用户可以制作自定义工具,这些工具都存放在测序仓库中。

执行结果(Execution)

基因计算流程的某次执行过程。

容器镜像

容器镜像是一个应用的快照。例如,一个容器镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。容器镜像用于创建Docker容器。Docker本身提供了一个简单的机制来创建新的镜像或者更新已有镜像,您也可以下载其他人已经创建好的镜像来使用。

桶(Bucket)

桶(Bucket)是对象存储(简称OBS)中存储对象的单位。对象存储提供了基于桶和对象的扁平化存储方式,桶中的所有对象都处于同一逻辑层级,去除了文件系统中的多层级树形目录结构。

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