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更新时间:2020/08/18 GMT+08:00

基因容器(GeneContainer Service,GCS)提供云端基因解决方案,支持DNA、RNA等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术,结合大数据、深度学习算法,优化官方标准算法,为您提供灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源。

基因容器作为基因测序端到端完整解决方案,为您提供数据管理、测序工具平台、流程定义能力、运行流程以及查看流程执行结果的能力,同时以上能力均支持以CLI命令行方式执行。

基因容器的使用方式包括可视化界面、REST API、SDK、命令行,您可以选择任意一种或是搭配使用。

图1 基因容器的使用方式

PB级数据管理

提供PB级存储单元,除了支持您对数据的增删改查等基本操作之外,还支持数据快递、冷备、复制、分享、加密等操作。

灵活的流程定制能力

内置多套已验证的业界主流流程,同时提供图形化流程设计器及手动模板编写两种方式供您选择,创建您的自定义测序流程。

快速迁移已有流程

基因容器支持多种流程描述语言,可以将您在第三方系统中的流程(如SGE、SJM、WDL、Snakemake、Batch等)快速迁移至基因容器上。

可视化交互式体验

您可以随时通过图形化界面查看流程执行的进度、状态、日志、中间文件以及测序结果。

丰富的计算资源

基因容器以华为云丰富计算资源为基础,支持包年包月及按需计费两种计费模式,依靠基因容器强大的调度能力,能实现秒级弹性伸缩,轻松应对海量测序任务。

友好的命令行工具

基因容器提供免安装命令行工具,你可以快速提交、管理任务,方便对接您的自动化系统。

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