更新时间:2026-07-22 GMT+08:00
高性能计算
场景介绍
高性能计算(HPC)通常指使用多处理器计算机系统或计算机集群,执行大数据量与高复杂度的运算任务,解决计算密集型、海量数据处理等业务需求。
根据业务特性,HPC对共享文件系统有如下要求:
- 工业设计CAE/CAD:如汽车制造中的CAE/CAD仿真软件,计算节点间需紧密通信,要求文件系统高带宽、低时延。
- 生物科学:要求参与大数据计算的文件系统高带宽、高存储且易于扩展。
- 对生物基因数据进行测序、拼接、比对等处理,提供基因组信息以及相关数据系统的生物信息学领域。
- 进行大规模分子动力学模拟来分析和验证蛋白质在分子和原子水平上的变化的分子动力学模拟领域。
- 快速地完成高通量药物虚拟筛选从而大量缩短研发周期和减少投入资金的新药研发等领域。
- 能源勘探:对地质资料进行处理和解释,以及进行油藏和气藏的识别,要求文件系统容量大、高带宽。
- 图片渲染:图像处理和三维渲染,频繁处理小文件,要求文件系统数据读写性能强、容量大、高带宽。
- 异构计算:由不同类型的指令集和体系架构的计算单元组成的系统,要求文件系统高带宽、低时延。
SFS Turbo是基于文件系统的共享存储服务,具有高速数据共享、按需平滑扩展、支持在线扩容等特点,能充分满足高性能计算中用户对存储容量、吞吐量、IOPS(Input/Output Operations Per Second,每秒输入/输出操作数)和各种工作负荷下低时延的需求。
以基因测序场景为例:某生物平台需要处理大量基因测序任务,传统自建集群部署慢、效率低。采用高性能计算业务流程管理软件后,依托云平台的计算和存储资源,结合高性能计算特点,可降低初始投资和运维成本,缩短业务上线时间。
前提条件
- 已完成VPC创建。
- 已完成作为头节点和计算节点的云服务器创建,并将其归属在已创建的VPC下。如需将云下基因测序文件上传至SFS Turbo文件系统中,请参考通过云专线迁移本地数据至云上SFS Turbo。
- 已开通高性能弹性文件服务。
配置流程
- 整理好需要上传的基因测序文件。
- 登录SFS Turbo控制台,创建一个文件系统,用于存放基因测序文件。
- 登录作为头节点和计算节点的云服务器,挂载文件系统。
- 通过头节点将基因测序文件上传到挂载的文件系统。
- 启动基因测序任务,计算节点从挂载的文件系统中获取基因测序文件进行计算。
配置参考
- 登录SFS Turbo控制台。
- 在页面右上角单击“创建文件系统”。
- 在创建文件系统页面,根据界面提示配置参数。建议选择125MB/s/TiB及以上类型,以满足基因测序对高带宽和低时延的要求。
- 配置完成后,单击“立即创建”,完成文件系统创建。
- 登录头节点,将基因测序文件上传到挂载的文件系统。可使用以下命令上传文件:
cp -r /本地路径/基因测序文件 /挂载路径/
- 登录各计算节点,确认挂载路径下可以访问到基因测序文件。
ls /挂载路径/
- 在计算节点上启动基因测序任务,指定输入文件路径为SFS Turbo挂载路径,让计算节点从SFS Turbo文件系统中读取基因测序文件进行计算。
