基因容器 GCS
基因容器 GCS
- 最新动态
- 产品介绍
- 快速入门
- 用户指南
- Cromwell引擎使用指南
- 最佳实践
- 流程语法参考
- Python SDK参考
- API参考
-
CLI参考
- 命令总览
- 安装命令行工具
- 示例:使用命令行执行简单脚本
-
gcs 命令详情
- gcs version
- gcs config add
- gcs config list
- gcs get kubectl
- gcs get enviroment
- gcs set env
- gcs get sfs
- gcs set sfs
- gcs get obscli
- gcs obs upload
- gcs get workflow
- gcs create workflow
- gcs del workflow
- gcs update workflow
- gcs sub workflow
- gcs get execution
- gcs create execution
- gcs del execution
- gcs set execution
- gcs sub job
- gcs sub repjob
- gcs get tool
- gcs sub wdl
- gcs get wdl
- gcs set wdl
- get get fr
- config.ini配置说明
- 常见问题
- 视频帮助
- 文档下载
- 通用参考
本文导读
展开导读
链接复制成功!
API概览
GCS提供包括环境管理、流程创建、执行结果、工具相关的API,具体API如下所示。
- Environment:运行基因计算所需要的设施环境,例如K8S集群;
- Workflow:基因计算流程的定义;
- Execution:某个基因计算流程的一次执行过程的结果;
- Tool:基因计算所依赖的软件工具。
API |
说明 |
---|---|
部署基因计算所需的环境 |
|
清理删除基因测序的环境 |
|
查询环境列表信息 |
|
查询环境的详细信息 |
|
创建测序流程 |
|
删除测序流程 |
|
更新测序流程 |
|
下载测序流程 |
|
查询测序流程详细信息 |
|
查询测序流程输入 |
|
查询测序流程的工具 |
|
查询测序流程列表 |
|
校验流程合法性 |
|
开始执行测序流程 |
|
批量执行测序流程 |
|
删除执行结果 |
|
查询执行结果详细信息 |
|
查询执行结果列表 |
|
查询执行结果的输入 |
|
查询执行结果的输出 |
|
查询指定执行结果的事件 |
|
启动/停止/更新执行任务 |
|
创建工具 |
|
删除工具 |
|
更新工具 |
|
查询工具详细信息 |
|
查询工具列表 |