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API概览

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更新时间: 2019/07/31 GMT+08:00

GCS提供包括环境管理、流程创建、执行结果、工具相关的API,具体API如下所示。

  • Environment:运行基因计算所需要的设施环境,例如K8S集群;
  • Workflow:基因计算流程的定义;
  • Execution:某个基因计算流程的一次执行过程的结果;
  • Tool:基因计算所依赖的软件工具。
表1 GCS API

API

说明

部署environment

部署基因计算所需的环境

删除environment

清理删除基因测序的环境

查询environment列表

查询环境列表信息

查询environment

查询环境的详细信息

创建workflow

创建测序流程

删除workflow

删除测序流程

更新workflow

更新测序流程

下载workflow

下载测序流程

查询workflow

查询测序流程详细信息

查询workflow输入

查询测序流程输入

查询workflow工具

查询测序流程的工具

查询workflow列表

查询测序流程列表

校验流程

校验流程合法性

创建execution

开始执行测序流程

删除execution

删除执行结果

查询execution

查询执行结果详细信息

查询execution列表

查询执行结果列表

查询execution输入

查询执行结果的输入

查询execution输出

查询执行结果的输出

查询execution事件

查询指定执行结果的事件

操作execution

启动/停止/更新执行任务

创建tool

创建工具

删除tool

删除工具

更新tool

更新工具

查询tool

查询工具详细信息

查询tool列表

查询工具列表

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