二代测序 更多内容
  • 基本概念

    流程(Workflow) 基因测序流程包含测序过程所需工具的执行先后信息以及数据输入输出等定义。流程由至少一个工具组成。流程中的各个工具由其前后顺序关系形成数据流,前序工具为后序工具提供输入。基因容器为您提供了多套典型的测序流程,基于此流程,您可以快速完成测序任务。 工具(Tool)

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  • 基因容器(GeneContainer Service)

    基因容器(GeneContainer Service)提供云端基因测序解决方案,支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。基于轻量级容器技术,结合大数据、深度学习算法,优化官方标准算法,提供灵活可定制的测序流程、秒极可伸缩的高可靠资源 产品介绍 图说E CS 立即使用 立即使用

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  • 高性能计算

    整理好需要上传的基因测序文件。 登录高性能弹性文件服务控制台,创建一个文件系统用于存放基因测序文件。 登录作为头节点和计算节点的 云服务器 ,挂载文件系统。 通过头节点将需要上传的基因测序文件上传到挂载的文件系统。 登录计算节点,直接对挂载的文件系统中的基因测序文件进行编辑。 前提条件

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  • 高性能计算

    配置流程 整理好需要上传的基因测序文件。 登录弹性文件服务控制台,创建一个文件系统用于存放基因测序文件。 登录作为头节点和计算节点的云 服务器 ,挂载文件系统。 通过头节点将需要上传的基因测序文件上传到挂载的文件系统。 登录计算节点,直接对挂载的文件系统中的基因测序文件进行编辑。 前提条件

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  • 高性能计算

    高性能计算 生物医药(基因测序) 场景概述 生物医药包含基因测序,DNA变异检测等技术,随着人们对于健康关注度不断提高,基因测序等现代健康检测和预测手段正快速推广普及。基因测序是通过测序仪将不可视的生物信息转换为可视的文本信息,并依托计算、存储和大数据等资源,结合生物信息算法对文本信息进行分析和研究。

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  • 产品功能

    Service,GCS)提供云端基因解决方案,支持DNA、RNA等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术,结合大数据、深度学习算法,优化官方标准算法,为您提供灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源。 基因容器作为基因测序端到端完整解决方案,为您提供数据管理、测序工具平台、流程定义能力、运行流程以及查看

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  • 入门必读

    Service,简称GCS)提供云端基因测序解决方案,支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。 基因容器服务对GATK 4.0官方所推荐的最佳实践流程进行封装,让您能快速基于GATK最佳实践流程完成原数据分析。该流程为Broad Institute官方推荐流程,用于全基因组测序比对、去重、碱基

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  • 应用场景

    生物基因企业利用基因容器完成大规模基因组测序分析。 优势 极大提升计算速度,降低运算成本。 流程设计门槛低、方式多样,可以通过设计器、模板甚至可以直接从其他格式模板直接转换 不单独维护小资源池,可直接使用整个 华为云计算 资源作为基础。保证资源充足,无需排队 为生物测序行业量身定做的业务流程,更贴近用户场景。

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  • 旗舰版套餐

    aHub支架 落地支架白色(二代通用)、IdeaHub支架 落地支架灰色(二代通用)、华为CloudLink Mic 500、IdeaHub 挂架、投屏器 IdeaShare Key、插拔式计算机 OPS i5(二代)、插拔式计算机 OPS i7(二代)、遥控精灵。 专业服务 可选择包年/包月或一次性计费模式。

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  • 计费项

    IdeaHub支架 落地支架白色(二代通用) 推荐配套B2/S2系列。 一次性 IdeaHub支架 落地支架白色(二代通用)单价 * 购买数量 IdeaHub支架 落地支架白色(二代通用)单价请参见华为云会议价格详情中的“配件”。 IdeaHub支架 落地支架灰色(二代通用) 推荐配套ES2系列。

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  • 使用限制

    则无法一键创建按量付费的“集群”和“ 弹性云服务器 (下文中简称为ECS节点)”等资源。 区域限制 当前仅支持在华北区进行测序计算。 配额限制 使用基因容器执行测序时,需注意以下配额限制: 每个用户默认最多创建5个环境; 每个用户默认最多创建100个自定义流程,每个用户执行流程次数不能超过500次;

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  • 使用前必读

    基因容器(GeneContainer Service,GCS)提供云端基因测序解决方案,支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术,结合大数据、深度学习算法,优化官方标准算法,为您提供灵活可定制的测序流程、秒极可伸缩的高可靠资源。 基因容器提供了REST(Representational

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  • 产品优势

    产品优势 基因容器基于Kubernetes智能化基因计算任务调度和Spark等加速服务,为您提供低成本高性能的基因测序解决方案。支持对接深度学习框架,方便您深度解读报告。 秒级并发 基因容器利用容器技术的秒级并发能力,可将WGS从30小时缩短至5小时以内,对比同类竞品,使用相同样本的情况下,资源利用率大幅提升。

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  • 基于CCI执行gcs-grammar流程

    待环境创建完成,可以单击环境名称查看环境信息。 执行测序流程 基因容器提供了gcs-grammar示例流程,通过该流程您可以了解到GCS的编排语法及能力。 该流程的执行顺序以及包含工具,可以通过单击”基因测序 > 示例流程 > gcs-grammar”查看流程详细信息。 执行测序流程请按如下步骤操作。 单

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  • HPC简介

    连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题,所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业都涉及高性能计算集群来解决大型计算问题,管理节点对计算任务进行分解,交给不同的计算节点完成计算。 各种业务场景下,因数据处

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  • 费用说明

    IdeaHub支架 落地支架白色(二代通用) IdeaHub支架 落地支架灰色(二代通用) 华为CloudLink Mic 500 IdeaHub 挂架 投屏器 IdeaShare Key 插拔式计算机 OPS i5(二代) 插拔式计算机 OPS i7(二代) 遥控精灵 IdeaHub

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  • IdeaHub的大屏界面设置

    Pro/EDU、Board2、IdeaHub S2/S2 Pro/ES2/ES2 Pro 长按大屏首页背景,或点击首页右下角设置 > 壁纸 > 设置壁纸,弹出壁纸替换功能。 二代屏点击选择壁纸按钮,弹出壁纸加载选项,如图1所示,选择需要导入的壁纸,如图2所示。一代屏自定义的壁纸由WEB界面导入。 图1 打开设置 图2

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  • 如何使用Notebook的Terminal功能?

    JupyterLab”,然后选择“Terminal”,进入Terminal界面。 图1 Terminal 例如,您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图2 执行命令 父主题: Notebook

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  • 应用场景

    域。 AI/大数据 适用于 内容审核 、OCR、图像识别、图片处理、美颜、 语音识别 、推荐、搜索、智能客服、游戏AGI等领域。 基因 适用于基因测序、药物检测等领域。

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  • 最新动态

    商用 - 2 新增EVS存储类型的第二代规格,用户可进行存储类型和存储容量的自定义选择。 用户在创建集群时,可根据需要选择“第二代”规格,该规格为针对使用EVS盘的规格,支持用户在可选范围内自定义集群使用的存储类型与存储容量;话单计费上,第二代EVS盘规格采用存储资源独立计费的方式。

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  • (停止维护)Kubernetes 1.9及之前版本说明

    主要特性: ELB负载均衡 支持源IP跟后端服务会话保持 v1.9.10-r1 主要特性: 支持对接SFS存储 支持Service自动创建二代ELB 支持公网二代ELB透传源IP 支持设置节点最大实例数maxPods v1.9.10-r0 主要特性: kubernetes对接ELB/Ingress,新增流控机制

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