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亲和与反亲和调度

更新时间:2023-09-06 GMT+08:00
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守护进程集(DaemonSet)中讲到使用nodeSelector选择Pod要部署的节点,其实Kubernetes还支持更精细、更灵活的调度机制,那就是亲和(affinity)与反亲和(anti-affinity)调度。

Kubernetes支持节点和Pod两个层级的亲和与反亲和。通过配置亲和与反亲和规则,可以允许您指定硬性限制或者偏好,例如将前台Pod和后台Pod部署在一起、某类应用部署到某些特定的节点、不同应用部署到不同的节点等等。

Node Affinity(节点亲和)

您肯定也猜到了亲和性规则的基础肯定也是标签,先来看一下CCE集群中节点上有些什么标签。

$ kubectl describe node 192.168.0.212
Name:               192.168.0.212
Roles:              <none>
Labels:             beta.kubernetes.io/arch=amd64
                    beta.kubernetes.io/os=linux
                    failure-domain.beta.kubernetes.io/is-baremetal=false
                    failure-domain.beta.kubernetes.io/region=cn-east-3
                    failure-domain.beta.kubernetes.io/zone=cn-east-3a
                    kubernetes.io/arch=amd64
                    kubernetes.io/availablezone=cn-east-3a
                    kubernetes.io/eniquota=12
                    kubernetes.io/hostname=192.168.0.212
                    kubernetes.io/os=linux
                    node.kubernetes.io/subnetid=fd43acad-33e7-48b2-a85a-24833f362e0e
                    os.architecture=amd64
                    os.name=EulerOS_2.0_SP5
                    os.version=3.10.0-862.14.1.5.h328.eulerosv2r7.x86_64

这些标签都是在创建节点的时候CCE会自动添加上的,下面介绍几个在调度中会用到比较多的标签。

  • failure-domain.beta.kubernetes.io/region:表示节点所在的区域,如果上面这个节点标签值为cn-east-3,表示节点在上海一区域。
  • failure-domain.beta.kubernetes.io/zone:表示节点所在的可用区(availability zone)。
  • kubernetes.io/hostname:节点的hostname。

另外在Label:组织Pod的利器章节还介绍自定义标签,通常情况下,对于一个大型Kubernetes集群,肯定会根据业务需要定义很多标签。

守护进程集(DaemonSet)中介绍了nodeSelector,通过nodeSelector可以让Pod只部署在具有特定标签的节点上。如下所示,Pod只会部署在拥有gpu=true这个标签的节点上。

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: nginx
spec:
  nodeSelector:                 # 节点选择,当节点拥有gpu=true时才在节点上创建Pod
    gpu: true
...
通过节点亲和性规则配置,也可以做到同样的事情,如下所示。
apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name:  gpu
  labels:
    app:  gpu
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: gpu
  replicas: 3
  template:
    metadata:
      labels:
        app:  gpu
    spec:
      containers:
      - image:  nginx:alpine
        name:  gpu
        resources:
          requests:
            cpu: 100m
            memory: 200Mi
          limits:
            cpu: 100m
            memory: 200Mi
      imagePullSecrets:
      - name: default-secret
      affinity:
        nodeAffinity:
          requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
            nodeSelectorTerms:
            - matchExpressions:
              - key: gpu
                operator: In
                values:
                - "true"

看起来这要复杂很多,但这种方式可以得到更强的表达能力,后面会进一步介绍。

这里affinity表示亲和,nodeAffinity表示节点亲和,requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution非常长,不过可以将这个分作两段来看:

  • 前半段requiredDuringScheduling表示下面定义的规则必须强制满足(require)才会调度Pod到节点上。
  • 后半段IgnoredDuringExecution表示已经在节点上运行的Pod不需要满足下面定义的规则,即去除节点上的某个标签,那些需要节点包含该标签的Pod不会被重新调度。

另外操作符operator的值为In,表示标签值需要在values的列表中,其他operator取值如下。

  • NotIn:标签的值不在某个列表中
  • Exists:某个标签存在
  • DoesNotExist:某个标签不存在
  • Gt:标签的值大于某个值(字符串比较)
  • Lt:标签的值小于某个值(字符串比较)

需要说明的是并没有nodeAntiAffinity(节点反亲和),因为NotIn和DoesNotExist可以提供相同的功能。

下面来验证这段规则是否生效,首先给192.168.0.212这个节点打上gpu=true的标签。

$ kubectl label node 192.168.0.212 gpu=true
node/192.168.0.212 labeled

$ kubectl get node -L gpu
NAME            STATUS   ROLES    AGE   VERSION                            GPU
192.168.0.212   Ready    <none>   13m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   true
192.168.0.94    Ready    <none>   13m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   
192.168.0.97    Ready    <none>   13m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   

创建这个Deployment,可以发现所有的Pod都部署在了192.168.0.212这个节点上。

$ kubectl create -f affinity.yaml 
deployment.apps/gpu created

$ kubectl get pod -o wide
NAME                     READY   STATUS    RESTARTS   AGE   IP            NODE         
gpu-6df65c44cf-42xw4     1/1     Running   0          15s   172.16.0.37   192.168.0.212
gpu-6df65c44cf-jzjvs     1/1     Running   0          15s   172.16.0.36   192.168.0.212
gpu-6df65c44cf-zv5cl     1/1     Running   0          15s   172.16.0.38   192.168.0.212

节点优先选择规则

上面讲的requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution是一种强制选择的规则,节点亲和还有一种优先选择规则,即preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution,表示会根据规则优先选择哪些节点。

为演示这个效果,先为上面的集群添加一个节点,且这个节点跟另外三个节点不在同一个可用区,创建完之后查询节点的可用区标签,如下所示,新添加的节点在cn-east-3c这个可用区。

$ kubectl get node -L failure-domain.beta.kubernetes.io/zone,gpu
NAME            STATUS   ROLES    AGE     VERSION                            ZONE         GPU
192.168.0.100   Ready    <none>   7h23m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   cn-east-3c   
192.168.0.212   Ready    <none>   8h      v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   cn-east-3a   true
192.168.0.94    Ready    <none>   8h      v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   cn-east-3a   
192.168.0.97    Ready    <none>   8h      v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   cn-east-3a  

下面定义一个Deployment,要求Pod优先部署在可用区cn-east-3a的节点上,可以像下面这样定义,使用preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution规则,给cn-east-3a设置权重(weight)为80,而gpu=true权重为20,这样Pod就优先部署在cn-east-3a的节点上。

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name:  gpu
  labels:
    app:  gpu
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: gpu
  replicas: 10
  template:
    metadata:
      labels:
        app:  gpu
    spec:
      containers:
      - image:  nginx:alpine
        name:  gpu
        resources:
          requests:
            cpu:  100m
            memory:  200Mi
          limits:
            cpu:  100m
            memory:  200Mi
      imagePullSecrets:
      - name: default-secret
      affinity:
        nodeAffinity:
          preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
          - weight: 80 
            preference: 
              matchExpressions: 
              - key: failure-domain.beta.kubernetes.io/zone
                operator: In 
                values: 
                - cn-east-3a
          - weight: 20 
            preference: 
              matchExpressions: 
              - key: gpu
                operator: In 
                values: 
                - "true"

来看实际部署后的情况,可以看到部署到192.168.0.212这个节点上的Pod有5个,而192.168.0.100上只有2个。

$ kubectl create -f affinity2.yaml 
deployment.apps/gpu created

$ kubectl get po -o wide
NAME                   READY   STATUS    RESTARTS   AGE     IP            NODE         
gpu-585455d466-5bmcz   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.44   192.168.0.212
gpu-585455d466-cg2l6   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.63   192.168.0.97 
gpu-585455d466-f2bt2   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.79   192.168.0.100
gpu-585455d466-hdb5n   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.42   192.168.0.212
gpu-585455d466-hkgvz   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.43   192.168.0.212
gpu-585455d466-mngvn   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.48   192.168.0.97 
gpu-585455d466-s26qs   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.62   192.168.0.97 
gpu-585455d466-sxtzm   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.45   192.168.0.212
gpu-585455d466-t56cm   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.64   192.168.0.100
gpu-585455d466-t5w5x   1/1     Running   0          2m29s   172.16.0.41   192.168.0.212

上面这个例子中,对于节点排序优先级如下所示,有个两个标签的节点排序最高,只有cn-east-3a标签的节点排序第二(权重为80),只有gpu=true的节点排序第三,没有的节点排序最低。

图1 优先级排序顺序

这里您看到Pod并没有调度到192.168.0.94这个节点上,这是因为这个节点上部署了很多其他Pod,资源使用较多,所以并没有往这个节点上调度,这也侧面说明preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution是优先规则,而不是强制规则。

工作负载亲和(podAffinity)

节点亲和的规则只能影响Pod和节点之间的亲和,Kubernetes还支持Pod和Pod之间的亲和,例如将应用的前端和后端部署在一起,从而减少访问延迟。Pod亲和同样有requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution和preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution两种规则。

说明:

对于工作负载亲和来说,使用requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution和preferredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution规则时, topologyKey字段不允许为空。

来看下面这个例子,假设有个应用的后端已经创建,且带有app=backend的标签。

$ kubectl get po -o wide
NAME                       READY   STATUS    RESTARTS   AGE     IP            NODE         
backend-658f6cb858-dlrz8   1/1     Running   0          2m36s   172.16.0.67   192.168.0.100

将前端frontend的pod部署在backend一起时,可以做如下Pod亲和规则配置。

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name:   frontend
  labels:
    app:  frontend
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: frontend
  replicas: 3
  template:
    metadata:
      labels:
        app:  frontend
    spec:
      containers:
      - image:  nginx:alpine
        name:  frontend
        resources:
          requests:
            cpu:  100m
            memory:  200Mi
          limits:
            cpu:  100m
            memory:  200Mi
      imagePullSecrets:
      - name: default-secret
      affinity:
        podAffinity:
          requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
          - topologyKey: kubernetes.io/hostname
            labelSelector:
              matchExpressions: 
              - key: app
                operator: In 
                values: 
                - backend

创建frontend然后查看,可以看到frontend都创建到跟backend一样的节点上了。

$ kubectl create -f affinity3.yaml 
deployment.apps/frontend created

$ kubectl get po -o wide
NAME                        READY   STATUS    RESTARTS   AGE     IP            NODE         
backend-658f6cb858-dlrz8    1/1     Running   0          5m38s   172.16.0.67   192.168.0.100
frontend-67ff9b7b97-dsqzn   1/1     Running   0          6s      172.16.0.70   192.168.0.100
frontend-67ff9b7b97-hxm5t   1/1     Running   0          6s      172.16.0.71   192.168.0.100
frontend-67ff9b7b97-z8pdb   1/1     Running   0          6s      172.16.0.72   192.168.0.100

这里有个topologyKey字段(用于划分拓扑域),意思是先圈定topologyKey指定的范围,当节点上的标签键、值均相同时会被认为同一拓扑域,然后再选择下面规则定义的内容。这里每个节点上都有kubernetes.io/hostname,所以看不出topologyKey起到的作用。

如果backend有两个Pod,分别在不同的节点上。

$ kubectl get po -o wide
NAME                       READY   STATUS    RESTARTS   AGE     IP            NODE         
backend-658f6cb858-5bpd6   1/1     Running   0          23m     172.16.0.40   192.168.0.97
backend-658f6cb858-dlrz8   1/1     Running   0          2m36s   172.16.0.67   192.168.0.100

给192.168.0.97和192.168.0.94打上prefer=true的标签。

$ kubectl label node 192.168.0.97 prefer=true
node/192.168.0.97 labeled
$ kubectl label node 192.168.0.94 prefer=true
node/192.168.0.94 labeled

$ kubectl get node -L prefer
NAME            STATUS   ROLES    AGE   VERSION                            PREFER
192.168.0.100   Ready    <none>   44m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   
192.168.0.212   Ready    <none>   91m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   
192.168.0.94    Ready    <none>   91m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   true
192.168.0.97    Ready    <none>   91m   v1.15.6-r1-20.3.0.2.B001-15.30.2   true

将podAffinity的topologyKey定义为prefer,则节点拓扑域的划分如图2所示。

      affinity:
        podAffinity:
          requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
          - topologyKey: prefer
            labelSelector:
              matchExpressions: 
              - key: app
                operator: In 
                values: 
                - backend
图2 拓扑域示意图

调度时,会根据prefer标签划分节点拓扑域,本示例中192.168.0.97和192.168.0.94被划作同一拓扑域。如果当拓扑域中运行着app=backend的Pod,即使该拓扑域中并非所有节点均运行了app=backend的Pod(本例该拓扑域中仅192.168.0.97节点上存在app=backend的Pod),frontend同样会部署在此拓扑域中(这里的192.168.0.97或192.168.0.94)。

$ kubectl create -f affinity3.yaml 
deployment.apps/frontend created

$ kubectl get po -o wide
NAME                        READY   STATUS    RESTARTS   AGE     IP            NODE         
backend-658f6cb858-5bpd6    1/1     Running   0          26m     172.16.0.40   192.168.0.97
backend-658f6cb858-dlrz8    1/1     Running   0          5m38s   172.16.0.67   192.168.0.100
frontend-67ff9b7b97-dsqzn   1/1     Running   0          6s      172.16.0.70   192.168.0.97
frontend-67ff9b7b97-hxm5t   1/1     Running   0          6s      172.16.0.71   192.168.0.97
frontend-67ff9b7b97-z8pdb   1/1     Running   0          6s      172.16.0.72   192.168.0.97

工作负载反亲和(podAntiAffinity)

前面讲了Pod的亲和,通过亲和将Pod部署在一起,有时候需求却恰恰相反,需要将Pod分开部署,例如Pod之间部署在一起会影响性能的情况。

说明:

对于工作负载反亲和来说,使用requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution规则时, Kubernetes默认的准入控制器 LimitPodHardAntiAffinityTopology要求topologyKey字段只能是kubernetes.io/hostname。如果您希望使用其他定制拓扑逻辑,可以更改或者禁用该准入控制器。

下面例子中定义了反亲和规则,这个规则表示根据kubernetes.io/hostname标签划分节点拓扑域,且如果该拓扑域中的某个节点上已经存在带有app=frontend标签的Pod,那么拥有相同标签的Pod将不能被调度到该拓扑域内的其他节点上。

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name:   frontend
  labels:
    app:  frontend
spec:
  selector:
    matchLabels:
      app: frontend
  replicas: 5
  template:
    metadata:
      labels:
        app:  frontend
    spec:
      containers:
      - image:  nginx:alpine
        name:  frontend
        resources:
          requests:
            cpu:  100m
            memory:  200Mi
          limits:
            cpu:  100m
            memory:  200Mi
      imagePullSecrets:
      - name: default-secret
      affinity:
        podAntiAffinity:
          requiredDuringSchedulingIgnoredDuringExecution:
          - topologyKey: kubernetes.io/hostname    #节点拓扑域
            labelSelector:    #Pod标签匹配规则
              matchExpressions: 
              - key: app
                operator: In 
                values: 
                - frontend

创建并查看部署效果,示例中根据kubernetes.io/hostname标签划分节点拓扑域,在拥有kubernetes.io/hostname标签的节点中,每个节点的标签值均不同,因此一个拓扑域中只有一个节点。当一个拓扑域中(此处为一个节点)已经存在frontend标签的Pod时,该拓扑域不会被继续调度具有相同标签的Pod。本例中只有4个节点,因此还有一个Pod处于Pending状态无法调度。

$ kubectl create -f affinity4.yaml 
deployment.apps/frontend created

$ kubectl get po -o wide
NAME                        READY   STATUS    RESTARTS   AGE   IP            NODE         
frontend-6f686d8d87-8dlsc   1/1     Running   0          18s   172.16.0.76   192.168.0.100
frontend-6f686d8d87-d6l8p   0/1     Pending   0          18s   <none>        <none>
frontend-6f686d8d87-hgcq2   1/1     Running   0          18s   172.16.0.54   192.168.0.97 
frontend-6f686d8d87-q7cfq   1/1     Running   0          18s   172.16.0.47   192.168.0.212
frontend-6f686d8d87-xl8hx   1/1     Running   0          18s   172.16.0.23   192.168.0.94 
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