HaplotypeCaller 基于比对和矫正之后的bam文件进行Variant Calling的工作。 gatk MergeVcfs 合并分bin变异检测的VCF文件。 Variant QC 针对输出的VCF文件进行质控。 图1 NGS执行步骤 图2 搭建步骤 父主题： 基于二代测序的基因组突变检测

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nature”，即环境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因，目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。宏基因组学(或元基因组学，metagenomics)是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象，以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段，以微生物多样性、种群

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探成本增加，高度复杂的计算建模方式取代了传统的经验+实验方法，成为能源勘探和开发的重要工具。 客户瓶颈 能源公司非常依赖于地震数据，以及从数据中获得的模型，从而为勘探过程提供洞察和指导。地震数据的高质量和快速处理，分析对一个成功的勘探和项目开发起到至关重要的作用。一项地震调查可能

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乘员舒适性检测关注的是自动驾驶车辆行驶过程中，驾驶员感受到的舒适程度。 舒适程度通常可以利用整个行驶过程中的速度方差来进行客观反映，而变异系数是可以对不同速度区间舒适程度进行比较。 变异系数的公式如下所示。 表示变异系数，表示标准差，表示均值。 本设计当主车速度的变异系数大于0.15时，判定乘员舒适性检测不通过。

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全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能，实现了对样本中可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病毒的快速检测，并在线分析各种病毒的相对载量。 抗病毒药物研发 计算机辅助药物筛选根据病毒靶点和小分子药物的3D结构，计算病毒蛋白与药物之间的结合能量，实现从成千上万的小分子库中筛选出与病

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初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 快速入门 关键概念 使用流程 初始化数据盘 什么是E CS 创建容器应用基本流程 05 实践 基于 EIHealth 平台，搭建NGS流程，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进

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优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行（该特性规划中，暂未上线）。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。

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rings，分子环的数量，最佳在0~6之间。 MaxRing： Number of atoms in the biggest ring，最大环的原子数，最佳在0~18之间。 nHet： Number of heteroatoms，杂原子的数量，即非碳原子和氢原子的原子数，最佳在1~15之间。

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用于注册操作。默认值为不指定。 允许相同的身份认证器注册 允许重新注册同类型身份验证器。默认值为 “是” 。 连接认证器超时 用于绑定和认证操作时连接身份认证器的超时设置，默认为 180秒。 可信任的认证器AAGUID 可添加信任的认证器的 AAGUID。应用于绑定认证器操作。如果此操作未添加，则可注册任何认证器。

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一次性计费，按购买的套数计费。 760,000.00 每次 生物医药企业诊断-大型 一次性计费，按购买的套数计费。 960,000.00 每次 生物医药企业诊断-中型 一次性计费，按购买的套数计费。 450,000.00 每次 生物医药企业诊断-小型 一次性计费，按购买的套数计费。 150

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导入应用”的方法，导入至自己的项目中使用。 流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。

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镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理

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可以直接使用FastQC应用，或将其编排至流程，和其他应用一起使用。 创建FastQC应用时，需要您熟悉该软件的使用，并具备一定的开发经验。FastQC的详细介绍请参考FastQC介绍。使用EIHealth平台创建FastQC应用的详细步骤如下所示： 步骤1：搭建Docker环境

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易于扩展。 对生物基因数据进行测序、拼接、比对等处理，提供基因组信息以及相关数据系统的生物信息学领域。 进行大规模分子动力学模拟来分析和验证蛋白质在分子和原子水平上的变化的分子动力学模拟领域。 快速地完成高通量药物虚拟筛选从而大量缩短研发周期和减少投入资金的新药研发等领域。 能源

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登录作为头节点和计算节点的 云服务器 ，挂载文件系统。 通过头节点将需要上传的基因测序文件上传到挂载的文件系统。 登录计算节点，直接对挂载的文件系统中的基因测序文件进行编辑。 前提条件 已完成VPC创建。 已完成作为头节点和计算节点的云 服务器 创建并将其归属在已创建的VPC下。如果需要将云下基因测序文件上传至SFS

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为生物测序行业量身定做的业务流程，更贴近用户场景。

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医疗智能体 （EIHealth）平台是基于华为云AI和大数据技术优势，为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。 平台为您提供高性能、高可靠性、高性价比的计算、存储、分析和AI能力支持，让科研过程标准化、可执行，提升医疗健康的服务能力和普惠水平。同时通过丰富的加速技术，实现算法工具的数倍加速，加速生物医疗大数据的分析。

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应用的参数和镜像启动命令如何设置 创建应用时，需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如，设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时，首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照Fa

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高效地完成药物研发，节约研发成本。 产品优势 提供开放的、易于扩展的平台架构。 提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产，提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程，并结合华为特有的高性能云计算，多样性算力，大数据等技术加速计算过程。

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在一起，利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题，所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业都涉及高性能计算集群来解决大型计算问题，管理节点对计算任务进行分解，交给不同的计算节点完成计算。 各种业

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若您本地有需要分析的二代基因组数据，则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。 若没有，可以先订阅资产市场里的示例数据进行分析，这里先用资产市场中的“人类基因组数据”和“NGS小数据集”进行分析。 图3 订阅数据 可以在“数据”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图4 查看订阅的数据 步骤3：启动作业

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