DPDK(Data Plane Development Kit)快速报文处理机制，以高速稳定的网络性能保障应用运行。 适用场景 基因工程、游戏动画、生物制药的计算和存储系统。 渲染农场、动漫影视基地等公共渲染平台，以及影视等渲染平台。 高性能前端集群、Web 服务器 、高性能科学和工

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Volcano调度概述 Volcano是一个基于Kubernetes的批处理平台，提供了机器学习、深度学习、生物信息学、基因组学及其他大数据应用所需要而Kubernetes当前缺失的一系列特性，提供了高性能任务调度引擎、高性能异构芯片管理、高性能任务运行管理等通用计算能力。 Volcano

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地磁盘、48个vCPU和384GiB内存。 更多信息，请参见磁盘增强型。 高性能计算 高计算能力、高吞吐量的场景。例如科学计算、基因工程、游戏动画、生物制药计算和存储系统。 推荐使用高性能计算型 弹性云服务器 ，主要使用在受计算限制的高性能处理器的应用程序上，适合要求提供海量并行计算

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基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析

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果的下载。 本章将介绍如何在使用基因容器服务时通过OBS的权限控制来实现资源隔离。 图1 基本原理图 基本概念 基因测序厂商 基因测序服务的提供商，即华为云基因容器服务的客户。 第三方 基因测序服务的使用者，即基因测序厂商的客户。 操作步骤 基因测序厂商进行桶配置、权限控制及第三方添加外部桶的操作步骤如下：

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00 每次 生物医药企业诊断-大型 一次性计费，按购买的套数计费。 960,000.00 每次 生物医药企业诊断-中型 一次性计费，按购买的套数计费。 450,000.00 每次 生物医药企业诊断-小型 一次性计费，按购买的套数计费。 150,000.00 每次 生物医药企业诊断-批量

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相关接口 衍生物-查看 【API】衍生物-查看：对数据衍生物的查看权限。 查看衍生物详情列表接口 查看衍生物详情接口 衍生物-操作 【API】衍生物-操作：对数据衍生物的可操作权限。 衍生物采集接口 申请下载衍生物接口 衍生物下载接口 衍生物-审批 【API】衍生物-审批：对数据衍生物的审批权限。

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computing，简称HPC）是一个计算机集群系统，通过管理节点对计算任务进行分解，交给不同的计算节点进行计算，以此来解决大型计算问题。在科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。 针对日益增长的HPC计算能力需求，华为云在现有基础设施之上推出了HPC解决方案服务（HPC Solution

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语法说明 基因容器语法，是G CS 引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。流程描述文件的生成方式有多种，其一基于基因容器语法手动编写；其二是通过基因容器命令行自

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语法说明 基因容器语法，是GCS引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。 流程描述文件的生成方式当前支持以下三种： 基于基因容器语法手动编写。 通过基因容器命令行自动生成。

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如何将生物信息学软件封装为镜像并上传？ 本章节提供了在 EIHealth 平台创建FastQC应用的样例，帮助您快速熟悉平台的使用方法。 FastQC是一款高通量序列数据的质量检查工具，此样例基于开源的FastQC软件，将软件制作成镜像，上传至平台，并基于此镜像创建应用。应用创建完成

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的访问权限。 用户PC端设备拥有安全密钥 (USB或蓝牙) 或生物识别身份验证器 (WindowsHello、Touch ID等)。 PC端开启FIDO2认证 在用户PC端设备上开启安全密钥 (USB或蓝牙) 或生物识别身份验证器 (WindowsHello、Touch ID等)

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Environment：运行基因计算所需要的设施环境，例如K8S集群； Workflow：基因计算流程的定义； Execution：某个基因计算流程的一次执行过程的结果； Tool：基因计算所依赖的软件工具。 表1 GCS API API 说明 部署environment 部署基因计算所需的环境

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与其它云服务的关系 基因容器服务与华为云其它服务的关系如图1所示。 图1 基因容器与华为云服务的关系 云容器引擎（CCE） 基因容器使用的底层资源均由CCE服务创建。云容器引擎（Cloud Container Engine）提供高可靠高性能的企业级容器应用管理服务，支持Kuber

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Cromwell 相关操作请参见Cromwell引擎使用指导。 病毒基因组分析平台 病毒基因组分析平台基于rampart实时读取分析病毒数据，并且提供web界面查看病毒分析的结果。 病毒基因组分析平台的相关操作请参见病毒基因组分析平台入门。 基本概念 弹性 云服务器 弹性云服务器（Elastic

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【API】数据合约-操作 【API】数据市场-操作 【API】数据源管理-操作 【API】数据目录-操作 【API】衍生物-查看 【API】衍生物-操作 合约审批人 审批合约、查看审批的合约和审批数据衍生物权限 无其他权限 工作台、数据合约 【MENU】工作台 【MENU】数据合约 【API】工作台-只读

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Compute，简称HPC）、AI/大数据、基因等场景。 HPC 适用于超算、气象、科研教育、视频转码（视频格式转换、视频分辨率变化、添加水印/logo的）等领域。 AI/大数据 适用于 内容审核 、OCR、图像识别、图片处理、美颜、 语音识别 、推荐、搜索、智能客服、游戏AGI等领域。 基因 适用于基因测序、药物检测等领域。

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ouputs 可选项，用于定义数据处理流程完成后，最终生成的结果文件列表。结果文件列表在基因容器服务的控制台界面展示，此外，为了让您更直观的查看结果文件，基因容器集成 IGV（IGV的详细描述请参见http://www.igv.org/）软件，您通过控制台即可查看到通过IGV软件转换后的可视化结果文件。

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镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台

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创建三台弹性云服务器，自动部署HPC开源调度软件Slurm，提供基因测序HPC环境。 创建弹性服务共享文件，为基因测序HPC环境提供共享文件存储服务。 安全组可以保护弹性云服务器的网络安全，通过配置安全组规则，限定云服务器的访问端口。 弹性云服务器管理节点绑定弹性公网IP，用于用户访问基因测序HPC环境。 在调度节点

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outputs 可选项，用于定义数据处理流程完成后，最终生成的结果文件列表。结果文件列表在基因容器服务的控制台界面展示，此外，为了让您更直观的查看结果文件，基因容器集成 IGV（IGV的详细描述请参见http://www.igv.org/）软件，您通过控制台即可查看到通过IGV软件转换后的可视化结果文件。

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