数据管理 基因容器使用 对象存储服务 OBS和弹性文件服务SFS存储分析前后产生的数据，其中包括原始基因数据、流程执行中间数据及执行结果数据。CCE环境支持对象存储服务OBS和弹性文件服务SFS存储数据，而由于目前CCI环境不支持OBS挂载，CCI环境只能使用SFS存储数据。 基因容器的

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镜像 如何搭建Docker环境？ 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传？

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指定的PVC必须存在。 基因容器服务提供了3个内置的共享存储可供挂载，分别为： ${G CS _REF_PVC}，基因容器提供的参考组OBS桶。 ${GCS_DATA_PVC} ，关联OBS桶，表示基因容器环境关联的OBS桶。 ${GCS_SFS_PVC}，加速SFS卷，表示基因容器环境关联的SFS卷。

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作业模板 基因分析流程包含分析过程所需工具的执行先后信息以及数据输入输出等定义。流程由至少一个工具组成。流程中的各个工具由其前后顺序关系形成数据流，前序工具为后序工具提供输入。 基因容器流程可以通过“自定义流程”页面来创建，然后用自定义流程进行分析。 创建作业模板 通过模板创建作业

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专属计算集群（Dedicated Computing Cluster）为用户提供资源物理隔离的云上专属资源池。适用于金融安全、 数据仓库 、基因测序、生物制药等对数据安全要求高的场景。用户可申请独占物理设备，独享计算、存储和网络资源专属区，从而保证数据安全隔离、业务稳定运行。 计费项 计费项分为包含服务和关联服务两类。

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指定的PVC必须存在。 基因容器服务提供了3个内置的共享存储可供挂载，分别为： ${GCS_REF_PVC}，基因容器提供的参考组OBS桶。 ${GCS_DATA_PVC} ，关联OBS桶，表示基因容器环境关联的OBS桶。 ${GCS_SFS_PVC}，加速SFS卷，表示基因容器环境关联的SFS卷。

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平台计费方式 基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需

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色，存储容灾服务的权限才能生效。 表1 GCS系统策略 策略名称 描述 策略类型 依赖关系 GCS FullAccess 基因容器服务的管理员权限。拥有基因容器服务所有操作权限。 系统策略 依赖如下策略，请同时授予如下权限。 OBS OperateAccess：全局级策略，请在“全局区域

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bqsr-bam file 经过gatk-applybqsr处理之后得到的bam文件。 ref-file file 参考基因组序列。 contig-file file 与参考基因组对应的contigs文件，包含contigs清单。 输出参数 out-dir directory 输出的Variant

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删除environment 功能介绍 清理基因测序的环境。如果您不再使用此环境，建议您清理环境，避免资源及费用的浪费。如默认环境被清理，则最新创建的环境会自动变成默认环境。 如果您使用的环境是云容器实例，环境清理后，基因容器将不再使用该命名空间，但是命名空间并未删除。如果需要删除命名空间，请前往CCI控制台删除。

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创建tool 功能介绍 如果您需要使用的工具超出基因容器提供的业务主流基因数据处理工具范围，您可以通过本接口，添加自定义工具。基因容器支持的公共工具请参见公共工具范围。 如果使用自有工具镜像，请在调用本接口前，通过华为云提供的 容器镜像服务 （SWR）上传工具镜像。 URI POST

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供NPU资源。 NPU调度 Volcano调度 Volcano是一个基于Kubernetes的批处理平台，提供了机器学习、深度学习、生物信息学、基因组学及其他大数据应用所需要而Kubernetes当前缺失的一系列特性，提供了高性能任务调度引擎、高性能异构芯片管理、高性能任务运行管理等通用计算能力。

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企业数据变现的核心诉求。DWR提供的高效、开放、易用的近数据处理能力，让视频处理、图片审核、文档压缩、灾难防治、数据搜索和推荐、办公协同、基因测序等场景的海量数据快速产生价值。 DWR的应用场景包括但不限于以下典型场景。 表1 DWR典型应用场景 应用场景 场景下支持的能力 视频

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应用的参数和镜像启动命令如何设置？ 创建应用时，需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如，设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时，首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照F

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用户管理 用户管理介绍 创建子用户 导入用户 登录平台方式 管理用户 父主题： 用户指南（基因平台）

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查询规划 优化器方法配置 优化器开销常量 基因查询优化器 其他优化器选项 父主题： GUC参数

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准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题： 用户指南（基因平台）

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项目管理 项目简介 创建项目 项目成员和权限 项目管理常用操作 父主题： 用户指南（基因平台）

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上传数据 NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到 EIHealth 平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。

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Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）

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图解 医疗智能体 AI药物研究 AI基因组研究

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