ouputs
可选项,用于定义数据处理流程完成后,最终生成的结果文件列表。结果文件列表在基因容器服务的控制台界面展示,此外,为了让您更直观的查看结果文件,基因容器集成 IGV(IGV的详细描述请参见http://www.igv.org/)软件,您通过控制台即可查看到通过IGV软件转换后的可视化结果文件。
ouputs中可以同时定义多种结果文件。

如果使用该字段,需要确保最终文件是在基因容器关联的OBS桶中。
outputs格式
<结果文件名称>:
paths: <结果文件列表>
paths_iter: <结果文件列表,变量迭代方式> 属性 | 是否必选 | 参数类型 | 取值约束 |
|---|---|---|---|
paths | 否 | array[String] | 流程生成的文件在OBS桶中的路径列表。与paths_iter二选一 说明: 此参数与path_iter必须二选一,其中path_iter支持变量代入。 |
paths_iter | 否 | 流程生成的文件在OBS桶中的路径列表,支持变量代入。 |
属性 | 是否必选 | 参数类型 | 取值约束 |
|---|---|---|---|
path | 是 | String | 在基因容器关联的OBS桶中,带变量的文件路径。 |
vars_iter | 是 | array[array] | 二维数组,根据变量迭代,得到最终的文件列表,详见表4中的vars_iter参数。 |
outputs配置样例
outputs:
gene-report-vcf:
paths:
- ${sample}/merge.HaplotypeCaller.raw.vcf.gz
- ${sample}/merge.HaplotypeCaller.raw.g.vcf.gz 
