更新时间：2022-05-05 GMT+08:00
ouputs
可选项，用于定义数据处理流程完成后，最终生成的结果文件列表。结果文件列表在基因容器服务的控制台界面展示，此外，为了让您更直观的查看结果文件，基因容器集成 IGV（IGV的详细描述请参见http://www.igv.org/）软件，您通过控制台即可查看到通过IGV软件转换后的可视化结果文件。
ouputs中可以同时定义多种结果文件。
如果使用该字段，需要确保最终文件是在基因容器关联的OBS桶中。
outputs格式
<结果文件名称>:
paths: <结果文件列表>
paths_iter: <结果文件列表，变量迭代方式>
|
属性 |
是否必选 |
参数类型 |
取值约束 |
|---|---|---|---|
|
paths |
否 |
array[String] |
流程生成的文件在OBS桶中的路径列表。与paths_iter二选一
说明：
此参数与path_iter必须二选一，其中path_iter支持变量代入。 |
|
paths_iter |
否 |
流程生成的文件在OBS桶中的路径列表，支持变量代入。 |
|
属性 |
是否必选 |
参数类型 |
取值约束 |
|---|---|---|---|
|
path |
是 |
String |
在基因容器关联的OBS桶中，带变量的文件路径。 |
|
vars_iter |
是 |
array[array] |
二维数组，根据变量迭代，得到最终的文件列表，详见表4中的vars_iter参数。 |
outputs配置样例
outputs:
gene-report-vcf:
paths:
- ${sample}/merge.HaplotypeCaller.raw.vcf.gz
- ${sample}/merge.HaplotypeCaller.raw.g.vcf.gz
父主题： 流程语法说明
