基因容器 GCS
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接口列表
GCS接口
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分类 |
接口 |
接口说明 |
|---|---|---|
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初始化客户端 |
向GCS发送任一请求之前，必须先创建一个GCSClient实例 |
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用户名/密码方式初始化基础参数，与AK/SK方式二选一即可 |
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AK/SK方式初始化基础参数，与username/password方式二选一即可 |
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环境 |
查询环境列表 |
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查看特定环境详细信息 |
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流程 |
创建自定义流程，方便后续测序使用 |
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删除已上传的自定义流程 |
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更新自定义流程 |
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下载流程文件 |
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查询流程列表 |
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查询流程详情 |
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查询流程输入 |
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查询该流程里包含的工具列表 |
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GCS执行结果 |
开始执行测序流程 |
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删除执行结果 |
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查询特定execution执行结果 |
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查询执行结果列表 |
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查询该次执行时的输入 |
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查询执行的输出 |
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查询执行结果的流程事件 |
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取消正在执行的execution或是重新启动已取消或是失败的execution |
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工具 |
查询特定工具详情 |
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查询工具列表 |
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|
监控 |
查询已经完成的execution各Job监控数据 |
|
|
查询正在运行的execution各Job监控数据 |
Cromwell接口
|
分类 |
接口 |
接口说明 |
|---|---|---|
|
初始化客户端 |
向Cromwell引擎发送任一请求之前，必须先创建一个CromwellClient实例 |
|
|
用户名/密码方式初始化基础参数，与AK/SK方式二选一即可 |
||
|
AK/SK方式初始化基础参数，与username/password方式二选一即可 |
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|
Cromwell执行结果 |
开始执行测序流程 |
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删除执行结果 |
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查询特定执行结果 |
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查询执行结果列表 |
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批量删除执行结果。 |
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停止正在运行的测序流程。 |
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监控 |
查询已完成execution各Job监控数据 |
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|
查询正在运行execution各Job监控数据 |
