欢迎使用基因容器服务 感谢您更深入的了解、学习并使用基因容器服务（GeneContainer Service，G CS ）。 基因容器服务GCS提供云端基因分析解决方案，支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因分析场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大数据、深度学习算法，优化官方

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批量执行NGS分析 对于测序得到的大量数据，批量并自动执行NGS分析是提高工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节

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Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20.1 docker pull biocontainers/fastp:v0.20.1_cv1 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 bwa-mem:0

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竞价计费型实例存在中断机制，实例生命周期不可控，请勿使用竞价计费型实例运行需长时间作业、或稳定性要求极高的服务。 适用场景：图像渲染、无状态Web服务、基因测序、离线分析、函数计算、批量计算、样本分析、CI/CD与测试等。 父主题： 竞价计费

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病毒基因组分析平台入门 病毒基因组分析平台基于rampart实时读取分析病毒数据，并且提供web界面查看病毒分析的结果。 仅内测用户可以使用。 创建环境 单击“环境管理 > 创建环境”，根据界面提示填写参数。 环境类型 选择“病毒基因组分析平台”。 关联OBS存储 OBS存储用于

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医疗智能体 （ EIHealth ）基于华为云AI和大数据技术优势，为基因组分析、药物研发、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。 产品介绍 用户指南 仅两个按钮时选用 立即使用 成长地图 由浅入深，带您玩转EIHealth 01 了解 医疗智能体（EIHealth）面向基因组分析、药物研发、临床研究三个领域，提

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专属计算集群（Dedicated Computing Cluster）为用户提供资源物理隔离的云上专属资源池。适用于金融安全、 数据仓库 、基因测序、生物制药等对数据安全要求高的场景。用户可申请独占物理设备，独享计算、存储和网络资源专属区，从而保证数据安全隔离、业务稳定运行。 计费项

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的各种工作负载（Deployment/StatefulSet）和普通任务（Job）使用，主要面向大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序、智能视频监控、备份归档、企业云盘（网盘）等场景。 对象存储规格 对象存储提供了多种存储类别，从而满足客户业务对存储性能、成本的不同诉求。

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的各种工作负载（Deployment/StatefulSet）和普通任务（Job）使用，主要面向大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序、智能视频监控、备份归档、企业云盘（网盘）等场景。 对象存储规格 对象存储提供了多种存储类别，从而满足客户业务对存储性能、成本的不同诉求。

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最匹配的硬件电路，满足机器学习中海量计算和极低时延的要求。因此，FPGA在满足机器学习的硬件需求上提供极具吸引力的替代方案。 基因组学研究：通过基因测序和分析、生物和医疗信息等海量数据的快速分析，可实现精准医疗；同时在药物研发、分子育种等领域都有海量数据的处理，该领域需要硬件加速

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专属计算集群（Dedicated Computing Cluster）为用户提供物理隔离的云上专属计算资源池。适用于金融安全、数据仓库、基因测序、生物制药等对资源独享，性能要求高的场景。用户可申请独占物理设备，独享计算，从而保证业务稳定运行。 产品介绍 图说ECS 立即申请 立即使用

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搭建好的流程如下图所示。单击流程设计器上方保存按钮，保存流程。创建好的NGS将显示在“项目管理 > 工具”页签中。 图8 NGS流程 父主题： 基于二代测序的基因组突变检测

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析应用程序等。 说明： 高性能计算：主要是高带宽的需求，用于共享文件存储，比如基因测序、图片渲染等。 高性能网站、日志存储、DevOps、企业办公等。 大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序、智能视频监控、备份归档、企业云盘（网盘）等。 混合负载，专属分布式存储可同时支

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公网NAT网关 云解析服务 DNS 内网 域名 反向解析 公网域名 云容器引擎服务 CCE 集群 Autopilot集群 云容器实例 CCI 命名空间 基因测序服务 GCS 环境 DDoS高防服务 AAD 实例 Web应用防火墙 WAF Web应用防火墙独享实例 Web应用防火墙 Web应用防火墙域名扩展包

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JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图5 Terminal 例如，您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题： 开发环境（Notebook）

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Linux服务器 迁移上云 该方案能帮助您快速将Linux 服务器 迁移到华为云 弹性云服务器 上。 ECS、VPC、EIP、 SMS 快速构建基因测序环境 基于开源软件Slurm快速部署基因测序HPC云端环境。 ECS、VPC、VIP、EIP、SFS 快速构建FTP站点 基于开源VSFTPD软件快速构建FTP站点。

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语法说明 基因容器语法，是GCS引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。 流程描述文件的生成方式当前支持以下三种： 基于基因容器语法手动编写。 通过基因容器命令行自动生成。

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语法说明 基因容器语法，是GCS引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。流程描述文件的生成方式有多种，其一基于基因容器语法手动编写；其二是通过基因容器命令行自

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与其它云服务的关系 基因容器服务与华为云其它服务的关系如图1所示。 图1 基因容器与华为云服务的关系 云容器引擎（CCE） 基因容器使用的底层资源均由CCE服务创建。云容器引擎（Cloud Container Engine）提供高可靠高性能的企业级容器应用管理服务，支持Kuber

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Cromwell 相关操作请参见Cromwell引擎使用指导。 病毒基因组分析平台 病毒基因组分析平台基于rampart实时读取分析病毒数据，并且提供web界面查看病毒分析的结果。 病毒基因组分析平台的相关操作请参见病毒基因组分析平台入门。 基本概念 弹性 云服务器 弹性云服务器（Elastic

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动删除弹性云服务器。 图1 竞价计费型实例生命周期 应用场景 适用场景 如下业务适合使用竞价计费型实例策略：图像渲染、无状态Web服务、基因测序、离线分析、函数计算、批量计算、样本分析、CI/CD与测试等。 当市场价格高于您的报价或者库存资源不足时，竞价计费型实例会被中断回收，请务必做好数据备份工作。

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