基因查询优化器 介绍基因查询优化器相关的参数。基因查询优化器（GEQO）是一种启发式的查询规划算法。这个算法减少了对复杂查询规划的时间，而且生成规划的开销有时也小于正常的详尽的查询算法。 geqo 参数说明：控制基因查询优化的使用。 该参数属于USERSET类型参数，请参考表1中对应设置方法进行设置。

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基因查询优化器 介绍基因查询优化器相关的参数。基因查询优化器（GEQO）是一种启发式的查询规划算法。这个算法减少了对复杂查询规划的时间，而且生成规划的开销有时也小于正常的详尽的查询算法。 geqo 参数说明：控制基因查询优化的使用。 该参数属于USERSET类型参数，请参考表1中对应设置方法进行设置。

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基因查询优化器 介绍基因查询优化器相关的参数。基因查询优化器（GEQO）是一种启发式的查询规划算法。这个算法减少了对复杂查询规划的时间，而且生成规划的开销有时也小于正常的详尽的查询算法。 geqo 参数说明：控制基因查询优化的使用。 该参数属于USERSET类型参数，请参考表1中对应设置方法进行设置。

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基因查询优化器 介绍基因查询优化器相关的参数。基因查询优化器（GEQO）是一种启发式的查询规划算法。这个算法减少了对复杂查询规划的时间，而且生成规划的开销有时也小于正常的详尽的查询算法。 geqo 参数说明：控制基因查询优化的使用。 该参数属于USERSET类型参数，请参考表1中对应设置方法进行设置。

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基因查询优化器 介绍基因查询优化器相关的参数。基因查询优化器（GEQO）是一种启发式的查询规划算法。这个算法减少了对复杂查询规划的时间，而且生成规划的开销有时也小于正常的详尽的查询算法。 geqo 参数说明：控制基因查询优化的使用。 参数类型：USERSET 取值范围：布尔型 on表示使用。

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如高性能计算、媒体处理、文件共享和内容管理和Web服务等。 说明： 高性能计算：主要是高带宽的需求，用于共享文件存储，比如基因测序、图片渲染这些。 如大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序和智能视频监控等。 如高性能计算、企业核心集群应用、企业应用系统和开发测试等。 说明： 高性能计算：主

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如高性能计算、媒体处理、文件共享和内容管理和Web服务等。 说明： 高性能计算：主要是高带宽的需求，用于共享文件存储，比如基因测序、图片渲染这些。 如大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序和智能视频监控等。 如高性能计算、企业核心集群应用、企业应用系统和开发测试等。 说明： 高性能计算：主

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删除environment 功能介绍 清理基因测序的环境。如果您不再使用此环境，建议您清理环境，避免资源及费用的浪费。如默认环境被清理，则最新创建的环境会自动变成默认环境。 如果您使用的环境是云容器实例，环境清理后，基因容器将不再使用该命名空间，但是命名空间并未删除。如果需要删除命名空间，请前往CCI控制台删除。

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专属计算集群（Dedicated Computing Cluster）为用户提供资源物理隔离的云上专属资源池。适用于金融安全、 数据仓库 、基因测序、生物制药等对数据安全要求高的场景。用户可申请独占物理设备，独享计算、存储和网络资源专属区，从而保证数据安全隔离、业务稳定运行。 计费项 计费项分为包含服务和关联服务两类。

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互联网弹性业务负载。相比虚拟机，裸金属容器提供更高的部署密度、更低的资源开销、更加敏捷的部署效率。基于云原生技术帮助客户实现降低云化成本目标。 高性能计算/AI场景 超算、基因测序、人工智能等高性能计算场景，处理的数据量大， 裸金属服务器 满足业务对 服务器 的高计算性能、高稳定性、高实时性的诉求。

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AI基因组研究 父主题： 图解 医疗智能体

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1 支持Rampart环境 病毒基因组分析平台基于rampart实时读取分析病毒数据，并且提供web界面查看病毒分析的结果。 内测 环境选择 2019年12月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 G CS SDK/CLI支持WDL流程 基因容器服务软件开发工具包（GCS SDK）对GCS服务提供的REST

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CDN，媒体处理 MPC， 内容审核 Moderation 图3 视频点播 基因测序 场景描述 OBS提供高并发、高可靠、低时延、低成本的海量存储系统，结合计算服务可快速搭建高扩展性、低成本、高可用的基因测序平台。 客户数据中心测序仪上的数据通过云专线自动快速上传到华为云，通过由ECS、CCE

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基于CCE的GATK4最佳实践流程 本节通过示例流程调用GCS的API启动示例流程的基因测序，介绍使用GCS API的基本流程。 启动完成的基因测序结果如下所示。 通过GCS执行基因测序流程的步骤如下： 参照3.1-构造请求中的调用方式获取用户Token，因为在后续的请求中需要将Token放到请求消息头中作为认证。

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使用命令行工具执行测序 本示例通过指导您创建CCI命名空间、绑定文件存储卷，使用命令行工具查询和设置环境、查询和设置SFS存储卷、创建execution执行测序及查看计算结果，帮助您学习如何使用命令行工具在云容器实例环境中执行测序。 操作步骤 使用命令行工具执行测序的操作步骤如下：

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批量执行NGS分析 对于测序得到的大量数据，批量并自动执行NGS分析是提高工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节

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S的网络协议。需要指定网络地址进行访问，也可以将网络地址映射为本地目录后进行访问。 使用场景 如大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序和智能视频监控等。 如高性能计算、企业核心集群应用、企业应用系统和开发测试等。 说明： 高性能计算：主要是高速率、高IOPS的需求，用于

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专属计算集群（Dedicated Computing Cluster）为用户提供物理隔离的云上专属计算资源池。适用于金融安全、数据仓库、基因测序、生物制药等对资源独享，性能要求高的场景。用户可申请独占物理设备，独享计算，从而保证业务稳定运行。 产品介绍 图说ECS 立即申请 立即使用 成长地图

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步骤1：订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程，以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2：订阅数据 若您本地有需要分析的二代基因组数据，则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。

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Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20.1 docker pull biocontainers/fastp:v0.20.1_cv1 Mapping and Sort and index 将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 bwa-mem:0

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PDK(Data Plane Development Kit)快速报文处理机制，以高速稳定的网络性能保障应用运行。 适用场景 基因工程、游戏动画、生物制药的计算和存储系统。 渲染农场、动漫影视基地等公共渲染平台，以及影视等渲染平台。 高性能前端集群、Web服务器、高性能科学和工程应用、广告服务、视频编码和分布式分析。

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