python分子分母 更多内容
  • 分子生成

    参数设置页面 单击“提交”,提交任务。 分子生成结果支持以列表视图的形式进行查看 可以以列表的形式查看分子生成的作业,单击左上角“下载”,下载分子生成的结果或者分子3D构象。如果分子设置了靶点,可以下载小分子或复合物,若分子未设置靶点,只能下载小分子。小分子支持SDF和PDB格式,复合物只支持PDB格式。

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  • 分子对接

    查看详情:单击查看详情,跳转至分子列表页进行查看。 查看3D:查看分子的3D视图。 下游分析:分子优化对应的下游分析为分子搜索、分子属性预测、分子优化、自由能微扰和合成路径,单击“确定”即可创建。 下载3D:如果分子设置了靶点,可以单击“下载3D”下载优化后的小分子或者复合物,如果分子未设置靶点,

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  • 分子搜索

    分子搜索 可自定义数据库,以用户输入的参考化合物结构为起点,可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片,进入分子搜索页面。 在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面

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  • 分子优化

    可以以列表的形式查看分子优化的作业,单击左上角“下载”,下载分子优化的结果或者分子3D构象。如果分子设置了靶点,可以下载小分子或复合物,若分子未设置靶点,只能下载小分子。小分子支持SDF和PDB格式,复合物只支持PDB格式。 单击可以收藏结果,收藏后可直接在收藏夹页查看。 分子优化对应的下

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  • 分子搜索(MS)

    分子搜索(MS) 新建分子搜索任务接口 查询分子搜索任务 父主题: API(AI辅助药物设计)

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  • 分子生成(MG)

    分子生成(MG) 新建分子生成任务接口 查询分子生成任务 父主题: API(AI辅助药物设计)

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  • 分子属性预测

    查看详情:单击查看详情,跳转至分子列表页进行查看。 下游分析:分子优化对应的下游分析为分子优化、分子搜索和合成路径规划,单击“确定”即可创建。 每个分子卡片上会展示相应分子序号与对应的参数QED、SaScore QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。

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  • 分子优化(MO)

    分子优化(MO) 新建分子优化任务接口 查询分子优化任务 父主题: API(AI辅助药物设计)

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  • 生产作业-SMT上料上机业务

    工单号确定后,显示工单信息,单击该工单信息即能编辑飞达上料信息。 图5 工单信息 选择站位表,扫描需绑定飞达车条码或输入飞达车编码并确定后,上料进度分母随SMT站号个数改变。 图6 站位表及飞达车编码 单击站号栏信息,在弹出的“上料详情”中可查看SMT站号上料信息和上料状态;可选择任意未上料的站号进行上料。

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  • 创建分子对接作业

    创建分子对接作业 功能介绍 创建分子对接作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/docking 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id

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  • 单分子预对接

    分子预对接 功能介绍 单分子预对接。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/mol-docking 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id

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  • 查询分子生成任务

    smiles String 分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分 表7 MoleculeConstraint

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  • 分子属性预测(MPP)

    分子属性预测(MPP) ADMET属性预测接口 ADMET属性预测接口(默认+自定义属性) 父主题: API(AI辅助药物设计)

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  • 创建分子或分子复合物批量下载任务

    创建分子分子复合物批量下载任务 功能介绍 创建分子分子复合物批量下载任务。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/batch-download

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  • 创建分子生成作业

    smiles_list 否 Array of strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000 molecule_file 否 DrugFile object 分子文件,分子表达式列表和分子文件二选一,分子文件优先级最高。 binding_sites

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  • 创建分子聚类作业

    创建分子聚类作业 功能介绍 创建分子聚类作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/{job_id}/cluster 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述

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  • 创建分子搜索作业

    limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建分子搜索作业,作业名称为demo-job,分子SMILES表达式为string,从数据库中找到最相似top100的分子。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihe

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  • 查询分子优化任务

    Array of objects 分子ADMET属性值列表 similarity Number 分子与初始分子的相似度 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分 表8 MoleculeConstraint

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  • 查询分子搜索任务

    smiles String 分子SMILES表达式 source String 分子所属的数据库来源 score Float 分子与查询分子的相似度 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 分子搜索任务查询成功响应

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  • 查询分子或分子复合物批量下载任务详情

    查询分子分子复合物批量下载任务详情 功能介绍 查询分子分子复合物批量下载任务详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/batch-download/{task_id}

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  • Python

    2018.3.5或以上版本,可至IntelliJ IDEA官方网站下载。 获取并安装Python安装包(可使用2.7.9+或3.X,包含2.7.9),可至Python官方下载页面下载。 Python安装完成后,在命令行中使用pip安装“requests”库。 pip install

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