华为云服务事件发送流程 本章节介绍华为云服务事件发送的整个流程。 华为云 对象存储服务 （Object Storage Service，简称OBS）作为云服务事件源将产生的云服务事件发送到事件网格，事件规则对云服务事件进行过滤和转换，通过转换后的事件触发事件目标（即 函数工作流 服务中的函数）。

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华为云服务工程师培训 培训简介 云时代的到来，对人才提出了新的要求，不仅是高科技创新公司，越来越多的传统产业公司也需要大量云服务人才。基于此，华为云推出了华为云服务工程师培训专业服务，覆盖云服务演进和价值，华为云服务架构和生态，华为公有云计算服务、存储服务、网络服务、安全服务、监

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华为云服务高级开发者培训 培训简介 云时代的到来，对人才提出了新的要求，不仅是高科技创新公司，越来越多的传统产业公司也需要大量云服务人才。掌握DevOps理念，集云上研发及运维能力的融合型工程师是当前市场最急需的人才类型之一，基于此，华为云推出了华为云高级开发者培训专业服务，覆盖

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Institute官方推荐流程，用于全基因组测序比对、去重、碱基校正以及突变检测，关于该流程的详细描述请参见Broad Institute官方文档。 本文旨在帮助您了解基因容器的基本知识，解答您在使用基因容器中可能遇到的问题，帮助您快速使用基因容器服务开始您的基因测序数据分析之旅。 文档导读 基因容器的计算环境可以使用云容器实例（Cloud

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华为云服务如何使用KMS加密数据？ 华为云服务（包含OBS、IMS、EVS、SFS和RDS）使用KMS提供的信封加密方式来保护用户的数据。 信封加密方式，是一种加密手段，将加密数据的数据密钥封入信封中存储、传递和使用，不再使用用户主密钥直接加解密数据。 用户通过华为云服务加密数据

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nature”，即环境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因，目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。宏基因组学(或元基因组学，metagenomics)是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象，以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段，以微生物多样性、种群结构、进化

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基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析

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使用前必读 概述 基因容器（GeneContainer Service，G CS ）提供云端基因测序解决方案，支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大数据、深度学习算法，优化官方标准算法，为您提供灵活可定制的测序流程、秒极可伸缩的高可靠资源。

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产品优势 基因容器基于Kubernetes智能化基因计算任务调度和Spark等加速服务，为您提供低成本高性能的基因测序解决方案。支持对接深度学习框架，方便您深度解读报告。 秒级并发 基因容器利用容器技术的秒级并发能力，可将WGS从30小时缩短至5小时以内，对比同类竞品，使用相同样本的情况下，资源利用率大幅提升。

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产品功能 基于华为云整体产品规划，基因领域将统一由 EIHealth 为入口承接，后续GCS会考虑逐渐下线。详见最新动态。 基因容器（GeneContainer Service，GCS）提供云端基因解决方案，支持DNA、RNA等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大数

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果的下载。 本章将介绍如何在使用基因容器服务时通过OBS的权限控制来实现资源隔离。 图1 基本原理图 基本概念 基因测序厂商 基因测序服务的提供商，即华为云基因容器服务的客户。 第三方 基因测序服务的使用者，即基因测序厂商的客户。 操作步骤 基因测序厂商进行桶配置、权限控制及第三方添加外部桶的操作步骤如下：

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语法说明 基因容器语法，是GCS引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。 流程描述文件的生成方式当前支持以下三种： 基于基因容器语法手动编写。 通过基因容器命令行自动生成。

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应用场景 通用场景 生物基因企业利用基因容器完成大规模基因组测序分析。 优势 极大提升计算速度，降低运算成本。 流程设计门槛低、方式多样，可以通过设计器、模板甚至可以直接从其他格式模板直接转换 不单独维护小资源池，可直接使用整个 华为云计算 资源作为基础。保证资源充足，无需排队 为生

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语法说明 基因容器语法，是GCS引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。流程描述文件的生成方式有多种，其一基于基因容器语法手动编写；其二是通过基因容器命令行自

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医疗智能体 （EIHealth）平台是基于华为云AI和大数据技术优势，为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源，是一站式的医疗研发平台。 医疗智能体提供以下子服务： 基因组分析 提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持，让科研过程标准化、可执行。

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Environment：运行基因计算所需要的设施环境，例如K8S集群； Workflow：基因计算流程的定义； Execution：某个基因计算流程的一次执行过程的结果； Tool：基因计算所依赖的软件工具。 表1 GCS API API 说明 部署environment 部署基因计算所需的环境

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配置流程 整理好需要上传的基因测序文件。 登录弹性文件服务控制台，创建一个文件系统用于存放基因测序文件。 登录作为头节点和计算节点的 云服务器 ，挂载文件系统。 通过头节点将需要上传的基因测序文件上传到挂载的文件系统。 登录计算节点，直接对挂载的文件系统中的基因测序文件进行编辑。 前提条件

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过滤低质量的测序Reads，得到Clean Reads。 基因组比对 将Clean Reads比对到参考基因组上，同时输出比对率、深度、覆盖度的统计信息。 基因组变异检测 基于上述比对得到的bam文件，通过GATK4做Variant Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过Varian

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ouputs 可选项，用于定义数据处理流程完成后，最终生成的结果文件列表。结果文件列表在基因容器服务的控制台界面展示，此外，为了让您更直观的查看结果文件，基因容器集成 IGV（IGV的详细描述请参见http://www.igv.org/）软件，您通过控制台即可查看到通过IGV软件转换后的可视化结果文件。

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Compute，简称HPC）、AI/大数据、基因等场景。 HPC 适用于超算、气象、科研教育、视频转码（视频格式转换、视频分辨率变化、添加水印/logo的）等领域。 AI/大数据 适用于 内容审核 、OCR、图像识别、图片处理、美颜、 语音识别 、推荐、搜索、智能客服、游戏AGI等领域。 基因 适用于基因测序、药物检测等领域。

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Cromwell 相关操作请参见Cromwell引擎使用指导。 病毒基因组分析平台 病毒基因组分析平台基于rampart实时读取分析病毒数据，并且提供web界面查看病毒分析的结果。 病毒基因组分析平台的相关操作请参见病毒基因组分析平台入门。 基本概念 弹性云服务器 弹性云 服务器 （Elastic

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