欢迎使用基因容器服务 感谢您更深入的了解、学习并使用基因容器服务（GeneContainer Service，G CS ）。 基因容器服务GCS提供云端基因分析解决方案，支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因分析场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大数据、深度学习算法，优化官方

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生效。访问GCS时，需要先切换至授权区域。 如表1所示，包括了GCS的所有系统角色。由于华为云各服务之间存在业务交互关系，存储容灾服务的角色依赖其他服务的角色实现功能。因此给用户授予存储容灾服务的角色时，需要同时授予依赖的角色，存储容灾服务的权限才能生效。 表1 GCS系统策略 策略名称

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您使用GCS服务的其它功能。 本章节为您介绍对用户授权的方法，操作流程如示例流程所示。 前提条件 给用户组授权之前，请您了解用户组可以添加的GCS系统策略，并结合实际需求进行选择，GCS支持的系统策略及策略间的对比，请参见：GCS系统策略。若您需要对除GCS之外的其它服务授权，IAM支持服务的所有策略请参见权限策略。

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终端节点即调用API的请求地址，不同服务不同区域的终端节点不同，您可以从地区和终端节点中查询所有服务的终端节点。 基因容器的终端节点如表1所示，请您根据业务需要选择就近区域的终端节点。 表1 基因容器的终端节点 区 域名 称 区域 终端节点（Endpoint） 华北-北京一 cn-north-1 gcs.cn-north-1

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产品功能 基于华为云整体产品规划，基因领域将统一由 EIHealth 为入口承接，后续GCS会考虑逐渐下线。详见最新动态。 基因容器（GeneContainer Service，GCS）提供云端基因解决方案，支持DNA、RNA等主流生物基因测序场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大

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我不懂容器技术，可以使用基因容器服务吗？ 基因容器已将容器技术实现做了封装，提供了简单易用的控制台界面，您可以基于基因容器提供的控制台快速开始基因测序分析，无需额外了解容器或是云计算等相关技术。 已有测序流程和工具迁移到基因容器服务上，方便吗？ 方便。基因容器提供了工具仓库，用于存

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入门 基于基因容器提供的原始数据演示如何使用基因容器创建并执行GATK4最佳实践流程。 快速入门 入门必读 基于CCI执行GATK4最佳实践流程 04 实践 介绍基因容器在不同场景下的具体实践应用。 基本使用流程 使用命令行工具执行测序 使用第三方数据执行测序 基于GCS构建基因测序平台

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语法说明 基因容器语法，是GCS引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。 流程描述文件的生成方式当前支持以下三种： 基于基因容器语法手动编写。 通过基因容器命令行自动生成。

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语法说明 基因容器语法，是GCS引以为傲的特性之一。使用基因容器语法编写的流程描述文件是基因容器服务流程控制的唯一方式。如已有其他流程语法文件，需要先转换为基因容器语法，然后才能由基因容器执行。流程描述文件的生成方式有多种，其一基于基因容器语法手动编写；其二是通过基因容器命令行自动

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需要的PVC名称，GCS支持云硬盘卷、文件存储卷、对象存储卷和极速文件存储卷，具体请参见图1和图2。 说明： 指定的PVC必须存在。 基因容器服务提供了3个内置的共享存储可供挂载，分别为： ${GCS_REF_PVC}，基因容器提供的参考组OBS桶。 ${GCS_DATA_PVC}

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需要的PVC名称，GCS支持云硬盘卷、文件存储卷、对象存储卷和极速文件存储卷，具体请参见图1和图2。 说明： 指定的PVC必须存在。 基因容器服务提供了3个内置的共享存储可供挂载，分别为： ${GCS_REF_PVC}，基因容器提供的参考组OBS桶。 ${GCS_DATA_PVC}

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GCS_SFS_PVC 变量GCS_SFS_PVC用于代表GCS环境的SFS文件存储卷，便于挂载常用的SFS文件存储卷。 GCS_SFS_PVC变量在workflow语法中，挂卷的volumes字段内可用。 语法 volumes: gensfs: mount_path:

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GCS_DATA_PVC 变量GCS_DATA_PVC用于代表每个环境关联的OBS桶，便于挂载常用的对象存储桶。 GCS_DATA_PVC变量在workflow语法中，挂卷的volumes字段内可用。 语法 volumes: genobs: mount_path: /obs

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详解 如SQL执行计划概述节中所说，EXPLAIN会显示执行计划，但并不会实际执行SQL语句。EXPLAIN ANALYZE和EXPLAIN PERFORMANCE两者都会实际执行SQL语句并返回执行信息。在这一节将详细解释执行计划及执行信息。 执行计划 以如下SQL语句为例： 1

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详解 如SQL执行计划概述节中所说，EXPLAIN会显示执行计划，但并不会实际执行SQL语句。EXPLAIN ANALYZE和EXPLAIN PERFORMANCE两者都会实际执行SQL语句并返回执行信息。在这一节将详细解释执行计划及执行信息。 执行计划 以如下SQL语句为例： 1

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详解 如SQL执行计划概述节中所说，EXPLAIN会显示执行计划，但并不会实际执行SQL语句。EXPLAIN ANALYZE和EXPLAIN PERFORMANCE两者都会实际执行SQL语句并返回执行信息。在这一节将详细解释执行计划及执行信息。 执行计划 以如下SQL语句为例： 1

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GCS_REF_PVC 变量GCS_REF_PVC用于代表GCS提供的共享存储PVC，便于挂载存储。 GCS_REF_PVC变量在workflow语法中，挂卷的volumes字段内可用。 语法 volumes: genref: mount_path: /ref #挂载到容器内的路径

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服务开发框架详解 整体结构介绍 单Module base/service DDD 父主题： AstroPro学堂

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排入流程串联使用，也可以独立使用。您可以基于基因容器为您提供业界主流的基因数据处理工具，当前已支持的公共工具请参见公共工具的范围。您可以直接使用公共工具来创建流程，如执行工具。此外，基因容器也支持添加自有工具并支持对接第三方数据处理服务，您可以添加私有工具来创建流程，这些工具都存放在“工具仓库”中。

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2019年12月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 GCS SDK/CLI支持WDL流程 基因容器服务软件开发工具包（GCS SDK）对GCS服务提供的REST API接口进行封装，GCS SDK支持WDL。 使用GCS命令行工具可以提交单个WDL流程到Cromwell引擎，

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初始化客户端 环境 流程 GCS流程执行 工具 监控

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