获取默认环境下对应的sfs pvc name列表。gcs get sfs无无返回值：

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提交一组并行的 shell 脚本，作为多个 job 在后台执行。gcs sub repjob FILENAME [params]rejob可以简写为rjb，即：gcs sub rjb FILENAME [params]提交多个并行 shell 脚本具体格式如下：首先准备需要并行的单一脚本 bwa_mem.sh，对 fastq 原始文件

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下载kubetcl命令行工具，并进行相关配置。gcs get kubectlkubectl可以简写为kube，即：gcs get kube无执行本命令前请先删除当前目录下当前目录下 kubectl* 相关文件及目录。命令执行完成后，根据使用场景，按需切换kubectl的访问模式。VPC网络内接入访问请执行此命令。kubectl confi

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查看命令行工具的软件版本以及编译平台。gcs versionversion可以简写为ver，即：gcs ver查看软件版本：示例执行结果：

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查看任务信息。gcs get executionEXECUTIONID [params]execution可以简写为exec，即：gcs get execEXECUTIONID [params]可以直接执行 gcs get execution，显示所有任务情况。也可以 gcs get execution executionID 指定显示单

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终止指定的WDL流程。gcs set wdl ID[flags]终止指定流程。返回内容如下。

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利用FILENAME参数提供的流程文件直接创建execution。提示：该命令行不会新建workflow模板。如果已经有workflow模板，推荐直接使用gcs create exection。gcs sub workflow FILENAME [params]workflow可以简写为wf，即：gcs sub wf FILENAME

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查看模板信息。gcs del workflowWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]workflow可以简写为wf，即：gcs del wfWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]删除workflow 之前，需要删除所有引用该workflow 的 executi

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G CS 流程语法参考 流程语法说明 内置函数 内置变量 流程语法示例

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4 提供gcs-grammar公共流程，展示GCS当前支持的流程语法 基因容器提供了gcs-grammar示例流程，通过该流程您可以了解到GCS的编排语法及能力。 商用 基于CCI执行gcs-grammar流程 5 支持通过命令行获取CCI当前资源包使用情况 支持通过命令行获取CCI套餐包使用情况。

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查看workflow信息。gcs get workflow WORKFLOWID [params]workflow可以简写为wf，即：gcs get wf WORKFLOWID [params]获取所有模板信息。gcs get workflow workflow_id name

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创建execution。gcs create execution WORKFLOWID [params]execution可以简写为exec，即：gcs create exec WORKFLOWID [params]该命令的输入参数是 workflowID，可以通过 gcs get worflowID 查询后，根据name/versi

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华为云帮助中心，为用户提供产品简介、价格说明、购买指南、用户指南、API参考、最佳实践、常见问题、视频帮助等技术文档，帮助您快速上手使用华为云服务。

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更新流程的相关信息。目前命令行只支持更改描述信息以及流程文件（已经使用中的流程不能更改流程文件）gcs update workflowworkflow-id [params]workflow可以简写为wf，即：gcs update wfworkflow-id [params]更新某个流程的描述信息

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kflow文件。如果执行curl命令时，未进入到模板文件所在路径，可以在此处加上路径，例如模板文件gcs-grammar.yaml在/home/gcs-user路径下，则命令为archive_content=@/home/gcs-user/gcs-grammar.yaml 创建成

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API使用方法请参见API参考。 命令行使用方法请参见命令参考。 使用建议 如果您需要对华为云上的资源进行权限的精细管理，建议您在使用GCS前，使用IAM服务创建IAM用户及用户组，并授权，以使得IAM用户获得GCS的操作权限。IAM操作请参见创建用户并授权使用GCS。

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下载并配置GCS命令行工具，方法请参见安装命令行工具。 使用命令行工具查询环境。 执行./gcs get environment 查看当前账号下可用的环境列表： 设置环境。 执行./gcs set env设置后续测序使用的环境： ./gcs set env gcs-env-cc

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指定需要创建的模板名称，上传新的模板。同名模板上传两次会报错。gcs create workflowFILENAME [params]workflow可以简写为wf，即：gcs create wf WORKFLOWID [params]创建 workflow。这里以 GATK 流程为例，首先，依据 流程语法说明，编写 YAML 文件。

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"Action": [ "gcs:workflows:create", "gcs:workflows:list", "gcs:executions:create" ]

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单一步骤（一个并发） 命令示例 首先以执行单一命令为例。以 gcs sub job 为例，我们使用： gcs sub job --cpu 0.5 --memory 1g --tool bwa:0.7.12 --shell sh bwa_help.sh 生成GCS流程示例 该命令将会生成以下模板，并提交基因容器语法解析器：

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470.103.01 8.2.4 驱动安装脚本支持区域及获取方式 您可以通过执行以下命令，获取驱动安装脚本。 华北-北京一 wget -t 10 --timeout=10 https://hgcs-drivers-cn-north-1.obs.cn-north-1.myhuaweicloud

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