MapReduce服务 MRS

 

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    mapreduce 划分子任务 更多内容
  • API(AI辅助药物设计)

    API(AI辅助药物设计) 分子生成(MG) 分子优化(MO) 靶点化合物结合预测(CPI) 分子属性预测(MPP) 分子搜索(MS) 分子合成路径规划任务(MSP) 自定义属性任务(MCP)

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  • 创建虚拟药物筛选任务

    图1 新建研究 填写任务的基本信息,包括选择任务所属项目,研究的名称和描述。 图2 基本信息 选择配体分子和受体蛋白。 作业名称:自定义名称 。 类型:选择小分子化合物。 流程:选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子:配体分子文件,支持SMILES、SD

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  • 药物虚拟筛选

    创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选支持使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。该流程可以实现以下功能。 整合分子对接结果,生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象,用于可视化展示。 对配体分子进行注释,包括Dru

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  • 拆分子资产给用户

    分子资产给用户 将可组合资产中的子资产拆分转移给指定用户。 调用方法 public String transferChild(String fromCollectionIndex, String fromTokenId, String to, String childCollectionIndex

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  • 拆分子资产给用户

    分子资产给用户 将可组合资产中的子资产拆分转移给指定用户。 调用方法 public function transferChild(string $fromCollectionIndex, string $fromTokenId, string $to, string $childCollectionIndex

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  • 靶点口袋分子设计

    支持SDF、MOL2、PDB格式文件,且只支持3D结构。 分子量:自适应和手动输入。自适应模式下平台根据药物分子分子量分布进行分子设计。手动输入模式下平台会将用户输入的分子量作为强约束对分子设计过程进行限制,不合适的分子量范围可能会导致没有结果输出。 片段优化方式:目前只支持侧链修饰和骨架跃迁。

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  • 查询分子对接作业详情

    查询分子对接作业详情 功能介绍 查询分子对接作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/docking/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型

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  • 查询分子生成作业详情

    strings 分子表达式列表。 最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000 molecule_file DrugFile object 分子文件,分子表达式列表和分子文件二选一,分子文件优先级最高。 num_trials Integer 生成分子数量。 最小值:0

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  • 查询分子搜索作业详情

    object 作业基本信息。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:1024 scaffold String 分子骨架表达式。 最小长度:1 最大长度:1024 top_n Integer 生成分子数量。 最小值:0 最大值:1000 databases

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  • 生成分子SVG图

    生成分子SVG图 功能介绍 生成分子SVG图。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/svg 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id

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  • 创建分子优化作业

    创建分子优化作业 功能介绍 创建分子优化作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/optimization 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id

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  • 分子优化作业管理

    分子优化作业管理 创建分子优化作业 查询分子优化作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)

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  • 如何在提交MapReduce任务时设置任务优先级

    如何在提交MapReduce任务时设置任务优先级 问题 如何在提交MapReduce任务时设置任务优先级? 回答 当您在客户端提交MapReduce任务时,可以在命令行中增加“-Dmapreduce.job.priority=<priority>”参数来设置任务优先级。格式如下:

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  • 如何在提交MapReduce任务时设置任务优先级

    如何在提交MapReduce任务时设置任务优先级 问题 如何在提交MapReduce任务时设置任务优先级? 回答 当您在客户端提交MapReduce任务时,可以在命令行中增加“-Dmapreduce.job.priority=<priority>”参数来设置任务优先级。格式如下:

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  • MapReduce

    MapReduce MapReduce基本原理 MapReduce与其他组件的关系 MapReduce开源增强特性 父主题: 组件介绍

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  • 基本概念

    分子生成、属性预测、生物活性预测和分子优化等20多个药物发现任务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为,进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上,通过基本原理,构筑起一套模型和算法,从而计算出合理的分子

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  • 关键概念

    分子生成、属性预测、生物活性预测和分子优化等20多个药物发现任务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为,进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上,通过基本原理,构筑起一套模型和算法,从而计算出合理的分子

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  • 配置MapReduce任务日志归档和清理机制

    配置MapReduce任务日志归档和清理机制 配置场景 执行一个MapReduce应用会产生两种类型日志文件:作业日志和任务日志。 作业日志由MRApplicationMaster产生,详细记录了作业启动时间、运行时间,每个任务启动时间、运行时间、Counter值等信息。此日志内

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  • 配置MapReduce任务日志归档和清理机制

    配置MapReduce任务日志归档和清理机制 配置场景 执行一个MapReduce应用会产生两种类型日志文件:作业日志和任务日志。 作业日志由MRApplicationMaster产生,详细记录了作业启动时间、运行时间,每个任务启动时间、运行时间、Counter值等信息。此日志内

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  • 创建靶点口袋分子设计作业

    创建靶点口袋分子设计作业 功能介绍 创建靶点口袋分子设计作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/pocket-mol-design 表1 路径参数 参数 是否必选

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  • 查询分子属性预测作业详情

    查询分子属性预测作业详情 功能介绍 查询分子属性预测作业详情。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/admet/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型

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