基于CCE的GATK4最佳实践流程 本节通过示例流程调用G CS 的API启动示例流程的基因测序，介绍使用GCS API的基本流程。 启动完成的基因测序结果如下所示。 通过GCS执行基因测序流程的步骤如下： 参照3.1-构造请求中的调用方式获取用户Token，因为在后续的请求中需要将Token放到请求消息头中作为认证。

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快速入门 基于CCE的GATK4最佳实践流程

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本文档提供基因容器服务API的描述、语法、参数说明及样例等内容。您可以根据表2查找您需要的内容。 表2 文档导读 阶段 相关链接 了解GCS接口组成及接口列表 API概览 接口调用方法及认证鉴权方法 如何调用API 接口调用示例，以GATK4为例 基于CCE的GATK4最佳实践流程 具体接口使用说明

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管理Cromwell引擎 投递Cromwell任务 02 入门 基于基因容器提供的原始数据演示如何使用基因容器创建并执行GATK4最佳实践流程。 快速入门 入门必读 基于CCI执行GATK4最佳实践流程 04 实践 介绍基因容器在不同场景下的具体实践应用。 基本使用流程 使用命令行工具执行测序 使用第三方数据执行测序

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将Clean Reads比对到参考基因组上，同时输出比对率、深度、覆盖度的统计信息。 基因组变异检测 基于上述比对得到的bam文件，通过GATK4做Variant Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。

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回的相关参数，仅在意图匹配图元有效，如需后续使用，需值给流程变量传递给后续节点。 IVRREQUEST：IVR请求变量，当IVR流程调用智能化流程时，通过IVR流程通过OIAP的对话接口传入的变量。 手工在选择的前缀后输入点(.)，并将光标聚焦到点后，系统关联显示可用参数，直接选择。

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Server。 修改参数模板名称“name”不能与默认参数模板或已有参数模板的名称重复，默认参数模板不允许修改。 修改的参数必须在指定数据库版本的默认参数范围内，具体可配置范围请参见《云数据库 RDS用户指南》中“修改实例参数”的内容。 敏感参数，例如：“lower_case_tabl

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表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 租户在某一region下的project ID。获取方法请参见获取项目ID。 config_id 是 String 参数模板ID。 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述

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输入参数 在定义“分析任务”时，首先需要定义分析任务的输入参数，该输入参数是用于定义计算公式中的形式参数，它的实际参数是对应于某个属性、或某些属性的值（即可能是单值或数组），通过3种属性引用类型来约定输入参数如何引用属性的值，详细解释如下： 引用本资产属性 利用资产模型对资产进行

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公共参数 对象模型 状态码 获取项目ID

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相关参数 物化性质（Physicochemical Property） Molecular Weight (MW)： 分子量大小，包含氢原子，最佳分子量在100~600之间。 Molecular Refractivity (MR)： 总极化率，取决于分子的温度、折射率和压力。 Volume：

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参数管理 FlexusRDS实例参数调优建议 修改FlexusRDS实例参数 导出FlexusRDS实例参数列表 父主题： 管理Flexus云数据库RDS实例

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参数管理 修改 GaussDB (for MySQL)标准版实例参数 GaussDB(for MySQL)标准版参数调优建议 参数模板管理

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配置参数 执行样例代码前，必须在hbase-site.xml配置文件中，配置正确的ZooKeeper集群的地址。 配置项如下： <property> <name>hbase.zookeeper.quorum</name> <value>xxx-zk1.cloudtable.com

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公共参数 公共请求消息头参数 公共响应消息头参数 父主题： 云商店开放接口

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公共参数 公共请求消息头参数 公共响应消息头参数 父主题： 云商店开放接口描述

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公共参数 公共请求消息头参数 公共响应消息头参数 父主题： 云商店开放接口指南

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-----------+-------+ ​ 表1 参数说明 参数名 级别 参数描述 idle_readonly_transaction_timeout global、session 控制只读事务连接的超时时间，单位为秒。 参数设置为0时不生效，即表示只读事务连接的超时时间没有限制。

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参数类 控制台上修改long_query_time参数后未生效 GROUP_CONCAT结果不符合预期 RDS for MySQL创建索引失败报错[ERROR] 1071的解决方案 RDS for MySQL大小写参数敏感类问题 RDS MySQL timeout相关参数简介 命令行修改MySQL

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参数管理 更新任务的参数信息 查询任务参数配置列表 查询任务的参数配置修改历史 父主题： API v5（公测中）

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公共参数 通用请求返回值 错误码 获取项目ID

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