内置变量 流程语法示例 Cromwell引擎 什么是Cromwell引擎 管理Cromwell引擎 投递Cromwell任务 02 入门 基于基因容器提供的原始数据演示如何使用基因容器创建并执行GATK4最佳实践流程。 快速入门 入门必读 基于CCI执行GATK4最佳实践流程 04

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0255ac105709 创建Workflow 登录G CS 控制台，下载示例流程。 选择左侧导航栏的“基因测序”>“示例流程”。 找到gcs-grammar示例流程，单击下载文件，保存示例流程到本地。 上传示例流程gcs-grammar.yaml到执行curl命令的 服务器 的任一路径，例如/home/gcs-user。

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的同时，大幅地提高了测序速度，有力推动了相关研究。目前，NGS已广泛应用于全基因组测序、外显子测序、表观遗传学修饰等重要的生物学问题。 本示例中NGS流程基于 医疗智能体 （ EIHealth ）平台搭建，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进行评估，判断可靠程度，通过质控

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文档导读 阶段 相关链接 了解GCS接口组成及接口列表 API概览 接口调用方法及认证鉴权方法 如何调用API 接口调用示例，以GATK4为例 基于CCE的GATK4最佳实践流程 具体接口使用说明 API 状态码列表 状态码 错误码列表 错误码

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示例 常用功能示例代码 示例1： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31

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示例 常用功能示例代码 示例1： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31

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示例 PoWA可以采集、显示的性能指标非常丰富，在这里演示一个慢SQL的查看。 登录管理控制台。 单击管理控制台左上角的，选择区域。 单击页面左上角的，选择“数据库 > 云数据库 RDS”，进入RDS信息页面。 在“实例管理”页面，选择目标实例，单击操作列的“登录”，进入数据管理服务实例登录界面。

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示例 示例：Remote模式导出 规划数据服务器与集群处于同一内网，数据服务器IP为192.168.0.90，导出数据文件格式为CSV，所以规划的并行导出模式为Remote模式。 Remote模式并行导出数据操作示例如下所示： （可选）创建用户及其所属的用户组。此用户用于启动GD

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示例 定位任意实体 定位类 定位类中的方法 父主题： 通过代码搜索

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示例 常用功能示例代码 示例1： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31

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示例 常用功能示例代码 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43

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示例 单表导出操作步骤 通过创建外表，将数据库中的单表导出至OBS的两个桶中。 用户通过管理控制台登录到OBS数据服务器。在OBS数据服务器上，分别创建数据文件存放的两个桶“/input-data1”“/input-data2”，并创建每个桶下面的data目录“/input-da

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示例 常用功能示例代码 示例1： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31

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示例 常用功能示例代码 示例1： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31

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本节通过一个简单的示例说明Cromwell的使用方法。使用Cromwell首先编写WDL流程文件，定义任务如何工作。Cromwell引擎使用WDL文件描述任务执行流程，WDL的语法规则请参见1.0 specification。下面是一个简单示例WDL流程示例example.wdl。详细解释如下：这个流程一共有3个步骤stepa、stepb

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示例 常用功能示例代码 示例1： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31

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示例 示例1：Normal策略导入 示例2：Shared策略导入 示例3：Private策略导入 父主题： 通过外表并行导入

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示例 本节以查询服务列表为例，详细描述接口调用的流程。该示例中的实例是在已部署的SpringCloudDemo服务上，实现调用查询服务列表接口的过程。Spring Cloud是一个基于Spring Boot实现的微服务架构开发工具。它为微服务架构中涉及的配置管理、服务治理、断路器

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快速入门 基于CCE的GATK4最佳实践流程

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示例：逻辑复制代码示例 下面示例演示如何通过JDBC接口使用逻辑复制功能的过程。 针对逻辑复制的配置选项，除了在逻辑解码章节中的配置选项外，还有专门给JDBC等流式解码工具增加的配置项，如下所示。 解码线程并行度 通过配置选项parallel-decode-num，指定并行解码的

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示例：逻辑复制代码示例 下面示例演示如何通过JDBC接口使用逻辑复制功能的过程。执行示例前，需要加载驱动，驱动的获取和加载方法请参考JDBC包、驱动类和环境类。 针对逻辑复制的配置选项，除了在逻辑解码章节中的配置选项外，还有专门给JDBC等流式解码工具增加的配置项，如下所示。 解码线程并行度

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