使用命令行工具执行测序 本示例通过指导您创建CCI命名空间、绑定文件存储卷，使用命令行工具查询和设置环境、查询和设置SFS存储卷、创建execution执行测序及查看计算结果，帮助您学习如何使用命令行工具在云容器实例环境中执行测序。 操作步骤 使用命令行工具执行测序的操作步骤如下：

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批量执行NGS分析 对于测序得到的大量数据，批量并自动执行NGS分析是提高工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节

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欢迎使用基因容器服务 感谢您更深入的了解、学习并使用基因容器服务（GeneContainer Service，G CS ）。 基因容器服务GCS提供云端基因分析解决方案，支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因分析场景。基因容器基于轻量级容器技术，结合大数据、深度学习算法，优化官方

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S的网络协议。需要指定网络地址进行访问，也可以将网络地址映射为本地目录后进行访问。 使用场景 如大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序和智能视频监控等。 如高性能计算、企业核心集群应用、企业应用系统和开发测试等。 说明： 高性能计算：主要是高速率、高IOPS的需求，用于

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Browser+的图形化界面可以非常方便地让用户在本地对OBS进行管理。 适用于在中小型企业中上传、下载和分享个人数据等场景。推荐非IT行业，如医疗、交通、教育等行业用户使用，方便对数据执行操作。 obsutil obsutil是一款用于访问管理OBS的命令行工具，可以对OBS进行常用的配置

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步骤1：订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程，以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2：订阅数据 若您本地有需要分析的二代基因组数据，则您可以用本地的数据。数据上传方法请参见上传数据。

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，通过管理节点对计算任务进行分解，交给不同的计算节点进行计算，以此来解决大型计算问题。在科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。 针对日益增长的HPC计算能力需求，华为云在现有基础设施之上推出了HPC解决方案服务（HPC Solution

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HPC提供了超高浮点计算能力解决方案，可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求，如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等，缩短需要的大量计算时间，提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需租用，成本低，降低中小客户使用HPC的门槛。

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API（医疗智能体平台） 项目管理 系统管理 数据管理 数据库管理 应用管理 资产市场 notebook开发环境 Nextflow接口

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签，则说明是主账号。 图1 查看账号信息 购买服务 医疗智能体平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍，请参见计费说明。 登录华为云管理控制台，在左侧服务列表中选择“人工智能 > 医疗智能体 EIHealth ”。 请使用最新版本的Microsoft

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企微 图2 电商模板示例 医疗行业 iPaaS 集成模板，帮助医疗机构将不同的临床和业务系统（如电子病历、病人管理系统、实验室信息管理系统等）进行集成，提升数据共享效率。典型的医疗行业集成模板包括： 药品管理系统集成：将药品库存、供应链和分发系统与医疗管理平台集成，确保药品管理的实时性与精确性。

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创建分析应用时，您可以通过Docker Hub等镜像仓库，搜索引擎，自己制作等途径获取所需的镜像。 例如，可在Docker Hub获取bwa软件（用于将基因序列比对到参考基因组上）。 以下类型镜像，建议您通过Docker Hub获取，不建议自己制作。 基础操作系统类镜像，如Ubuntu、Suse、Centos等。

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病毒基因组分析平台入门 病毒基因组分析平台基于rampart实时读取分析病毒数据，并且提供web界面查看病毒分析的结果。 仅内测用户可以使用。 创建环境 单击“环境管理 > 创建环境”，根据界面提示填写参数。 环境类型 选择“病毒基因组分析平台”。 关联OBS存储 OBS存储用于

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WDL作业 通过WDL格式的模板创建WDL作业。广泛应用于基因测序、药物检测等领域。 创建WDL作业 登录BCE控制台，左侧导航栏中选择“作业管理”。 在“WDL”页签下，单击“创建作业”。 配置参数，具体如表1所示。 表1 创建作业 参数 说明 作业名称 输入作业名称。要求如下：

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共享存储，可提供高性能、高吞吐存储服务。 应用场景 适用各种高性能计算以及媒资归档场景，视频监控、在线视频点播、HPC、大数据分析。 大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序、智能视频监控、备份归档、企业云盘（网盘）等。 HPC高性能计算、媒体处理、内容管理和Web服务、大数据和分析应用程序等。 父主题： 配置云存储

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命令行工具修改。 配置文件中保存有用户的AK、SK信息，为了避免密钥泄露，会对文件中的SK进行加密以保护密钥安全。 父主题： 基于二代测序的基因组突变检测

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如高性能计算、媒体处理、文件共享和内容管理和Web服务等。 说明： 高性能计算：主要是高带宽的需求，用于共享文件存储，比如基因测序、图片渲染这些。 如大数据分析、静态网站托管、在线视频点播、基因测序和智能视频监控等。 如高性能计算、企业核心集群应用、企业应用系统和开发测试等。 说明： 高性能计算：主

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康信息平台，实现不同医疗机构间互联互通，区域内医疗卫生行政部门、医疗机构、公众之间的医疗卫生信息共享。以业务和管理需求为导向，建立实用、共享、安全的人口健康信息网络体系，为深化医药卫生体制改革，促进中医药事业发展，提高卫生计生服务管理水平，实现人人享有基本医疗卫生服务的目标，提供专业、全面的信息技术服务。

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作。 为了全面、系统地评估药物对新冠病毒所有靶点蛋白的结合情况，华为云EI医疗智能体团队与华中科技大学同济医学院基础医学院、华中科技大学同济医学院附属武汉儿童医院、西安交通大学第一附属医院、中科院北京基因组研究所迅速成立联合团队，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行

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不同实例类型以及不同计费模式的算力。极大程度降低投入成本，同时简化算力获取方式。 应用场景 智能购买组适用于图像渲染、无状态Web服务、基因测序、离线分析、函数计算、批量计算、样本分析、CI/CD与测试等场景。 使用须知 智能购买组可以跨可用区部署实例，但是不可以跨区域部署实例。

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中国金融业信息技术“十三五”发展规划（2017）指出：支持实力较强的机构独立或者联合建设金融业云服务平台，面向同业特别是中小金融机构提供云服务，提高行业资源使用效率。多家银行系金融科技公司成立，以行业云方式，对信息建设、业务流程、金融应用软件开发等能力做输出。服务从集团内部到中小银行、基金、保险、证券、信托等金融机构，再到其他非金融企业。

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