作业模板 基因分析流程包含分析过程所需工具的执行先后信息以及数据输入输出等定义。流程由至少一个工具组成。流程中的各个工具由其前后顺序关系形成数据流，前序工具为后序工具提供输入。 基因容器流程可以通过“自定义流程”页面来创建，然后用自定义流程进行分析。 创建作业模板 通过模板创建作业

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指定的PVC必须存在。 基因容器服务提供了3个内置的共享存储可供挂载，分别为： ${G CS _REF_PVC}，基因容器提供的参考组OBS桶。 ${GCS_DATA_PVC} ，关联OBS桶，表示基因容器环境关联的OBS桶。 ${GCS_SFS_PVC}，加速SFS卷，表示基因容器环境关联的SFS卷。

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指定的PVC必须存在。 基因容器服务提供了3个内置的共享存储可供挂载，分别为： ${GCS_REF_PVC}，基因容器提供的参考组OBS桶。 ${GCS_DATA_PVC} ，关联OBS桶，表示基因容器环境关联的OBS桶。 ${GCS_SFS_PVC}，加速SFS卷，表示基因容器环境关联的SFS卷。

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的yaml文件，使用作业模板可以创建作业实例。当前支持GCS和WDL两种类型的作业模板。 集群 集群是容器运行所需云资源的集合，包含了若干台 服务器 节点、虚拟私有云等云资源。 容器镜像 容器镜像是一个应用的快照。例如，一个容器镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安

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bqsr-bam file 经过gatk-applybqsr处理之后得到的bam文件。 ref-file file 参考基因组序列。 contig-file file 与参考基因组对应的contigs文件，包含contigs清单。 输出参数 out-dir directory 输出的Variant

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平台计费方式 基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需

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概述 欢迎使用 医疗智能体 （ EIHealth ）平台，该服务基于华为云AI和大数据技术优势，为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源，是一站式的医疗研发平台。EIHealth以开放API的方式提供给用户，您可以根据本文档提供

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EVS 磁盘 云备份服务 CBR 存储库 内容分发网络 CDN 域名 弹性文件服务 SFS 文件系统 sfs-turbo 虚拟私有云 VPC 虚拟私有云 安全组 IP地址组 网络ACL 公网带宽 Bandwidth 共享带宽 弹性公网IP EIP 弹性公网IP 弹性负载均衡 ELB

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删除environment 功能介绍 清理基因测序的环境。如果您不再使用此环境，建议您清理环境，避免资源及费用的浪费。如默认环境被清理，则最新创建的环境会自动变成默认环境。 如果您使用的环境是云容器实例，环境清理后，基因容器将不再使用该命名空间，但是命名空间并未删除。如果需要删除命名空间，请前往CCI控制台删除。

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数据库部署 数据库初始化及参数调整 安装数据库 安装数据库，初始化数据库服务时，字符集需要选择UTF-8。 调整参数 数据库服务安装后，需调整以下参数提升性能： 表1 数据库参数表 参数名称 参数说明 取值样例 区域 必选参数。 不同区域的云服务产品之间内网互不相通，请就近选择靠

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数据库代理 开启数据库代理 关闭数据库代理 查询数据库代理信息列表 查询数据库代理规格信息 扩容数据库代理节点的数量 减少数据库代理节点的数量 数据库代理规格变更 设置读写分离权重 设置读写分离路由模式 设置数据库代理事务拆分 开启或关闭新增节点自动加入该Proxy 修改代理会话一致性

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访问数据库 访问 DataBase 当已经有一个初始化好的MongoClient实例后，通过如下方式来访问一个database，示例如下： db:= client.Database("test") 访问集合 当获取一个MongoDatabase实例后，可以通过如下命令来得到要获取的集合：

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访问数据库 具体访问数据库前，引入如下相关类。 import com.mongodb.client.MongoClients; import com.mongodb.client.MongoClient; import com.mongodb.client.MongoCollection;

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访问数据库 具体访问数据库前，引入如下相关类。 import com.mongodb.client.MongoClients; import com.mongodb.client.MongoClient; import com.mongodb.client.MongoCollection;

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管理数据库 管理数据库 数据库创建完成后，您可以对数据库内的数据执行编辑、删除、新增行操作。预制数据库和引用数据库不支持编辑、删除、新增行操作。 编辑 数据库创建完成后，单击数据库名称进入数据库详情页，在页面左上角单击“编辑”按钮。 在需要修改的数据行的操作列单击“编辑”，修改数据。

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导出数据库 GaussDB (DWS)支持使用gs_dump工具导出某个数据库级的内容，包含数据库的数据和所有对象定义。可根据需要自定义导出如下信息： 导出数据库全量信息，包含数据和所有对象定义。 使用导出的全量信息可以创建一个与当前库相同的数据库，且库中数据也与当前库相同。 仅导

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同步数据库 本章节介绍创建DRS实例，将本地Oracle上的test_info数据库同步到GaussDB实例中test_database_info数据库中。 同步前检查 在创建任务前，需要针对同步条件进行手工自检，以确保您的同步任务更加顺畅。 在同步前，您需要参考入云使用须知获取同步相关说明。

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数据库管理 创建数据库 删除数据库

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图2 新建数据库 单击“SQL操作 > SQL查询”，打开SQL窗口，选择目标数据库，在SQL执行窗口输入如下命令创建数据库账号。 create database 数据库名; 相关API 创建数据库 查询数据库列表 查询数据库可用字符集 修改数据库备注 父主题： 数据库管理

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数据库使用 插入或更新数据时报错，提示分布键不能被更新 执行SQL语句时提示“Connection reset by peer” VARCHAR(n)存储中文字符，提示value too long for type character varying？ SQL语句中字段名大小写敏感问题

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数据库参数 DDS支持修改时区吗 用户需要关注实例的哪些参数 MapReduce提示不支持JavaScript DDS是否支持设置majority级别的readConcern

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