blast序列比对 更多内容
  • 创建和管理序列

    SEQUENCE 除了为序列指定cache,方法二所实现的功能基本与方法一类似。但是一旦定义cache,序列将会产生空洞(序列值为不连贯的数值,如:1.4.5),并且不能保序。另外为某序列指定从属列后,该列删除,对应的sequence也会被删除。 虽然数据库并不限制序列只能为一列产生默认值,但建议不要多列共用同一个序列。

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  • 函数支持json序列化和反序列化

    函数支持json序列化和反序列化 使用NET Core CLI 使用Visual Studio 父主题: 开发事件函数

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  • 序列号生成函数

    序列号生成函数 generate_series()函数根据指定的开始值(start)、结束值(stop)和步长(step)返回一个基于系列的集合。 generate_series()函数的入参中,当step是正数且start大于stop,则返回零行。相反,当step是负数且sta

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  • 序列号生成函数

    序列号生成函数 generate_series()函数根据指定的开始值(start)、结束值(stop)和步长(step)返回一个基于系列的集合。 generate_series()函数的入参中,当step是正数且start大于stop,则返回零行。相反,当step是负数且sta

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  • 执行分析作业

    测序得到的fastq2文件。 ref-file file 参考基因组序列。 seq-platform string 测序平台,如MGI、Illumina。 sample-id string 文件前缀,如NA12878。 输出参数 sorted-bam file 比对和排序之后得到的bam文件。 flagstat-file

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  • 创建和使用GaussDB(DWS)序列

    创建和使用 GaussDB (DWS)序列 序列Sequence是用来产生唯一整数的数据库对象。序列的值是按照一定规则自增的整数。因为自增所以不重复,因此说Sequence具有唯一标识性。这也是Sequence常被用作主键的原因。 通过序列使某字段成为唯一标识符的方法有两种: 一种是声明字段的类型为序列整型,由

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  • Spark Core数据序列化

    Spark Core数据序列化 操作场景 Spark支持两种方式的序列化 : Java原生序列化JavaSerializer Kryo序列化KryoSerializer 序列化对于Spark应用的性能来说,具有很大的影响。在特定的数据格式的情况下,KryoSerializer的性

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  • 使用Variant Calling Based On NGS流程

    前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对,得到比对后的bam文件,及对fastq和bam文件的质控报告。 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、b

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  • Spark Core数据序列化

    Spark Core数据序列化 操作场景 Spark支持两种方式的序列化 : Java原生序列化JavaSerializer Kryo序列化KryoSerializer 序列化对于Spark应用的性能来说,具有很大的影响。在特定的数据格式的情况下,KryoSerializer的性

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  • 创建和使用GaussDB(DWS)序列

    创建和使用GaussDB(DWS)序列 序列Sequence是用来产生唯一整数的数据库对象。序列的值是按照一定规则自增的整数。因为自增所以不重复,因此说Sequence具有唯一标识性。这也是Sequence常被用作主键的原因。 通过序列使某字段成为唯一标识符的方法有两种: 一种是声明字段的类型为序列整型,由

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  • 域名核验新规-注册信息比对不一致

    域名 核验新规-注册信息比对不一致 2018年1月1日工信部启用域名核验新规,具体规则请参见域名核验规则。 如果未能通过备案域名核验,可能存在如下一项或多项情形,如表1所示。 表1 表1 未能通过备案域名核验解决方法 可能原因 解决方法 您注册的域名对应的顶级域名可能未通过国家批复。

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  • 使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程

    于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。 该流程以NGS得到的fastq作为输入,通过质控,比对等步骤,输出针对fastq的qc报告,输出STAR比对得到的bam文件。 RNA-Seq流程由fastqc、trimmomatic、star应用构成,各应用说明如表1所示。

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  • Apache Dubbo反序列化漏洞

    Apache Dubbo反序列化漏洞 2020年02月10日,华为 云安全 团队监测到Apache Dubbo官方发布了CVE-2019-17564漏洞通告,漏洞等级中危。当用户选择http协议进行通信时,攻击者可以通过发送POST请求的时候来执行一个反序列化的操作,由于没有任何安全

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  • 查询终端外设的序列号

    查询终端外设的序列号 接口名称 WEB_GetEquipmentSn(后续废弃) 功能描述 查询终端外设的序列号。 应用场景 SMC下发搜集序列号请求。 URL https://ip/action.cgi?ActionID=WEB_GetEquipmentSn 参数 无 返回值 表1

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  • 查询应用程序列表

    查询应用程序列表 功能介绍 查询应用程序列表(该功能目前仅支持华东-上海一、华北-北京四) 调用方法 请参见如何调用API。 URI GET /v2/{project_id}/fgs/applications 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是

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  • Apache Dubbo反序列化漏洞

    Apache Dubbo反序列化漏洞 2020年02月10日,华为云安全团队监测到Apache Dubbo官方发布了CVE-2019-17564漏洞通告,漏洞等级中危。当用户选择http协议进行通信时,攻击者可以通过发送POST请求的时候来执行一个反序列化的操作,由于没有任何安全

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  • 获取镜像

    创建分析应用时,您可以通过Docker Hub等镜像仓库,搜索引擎,自己制作等途径获取所需的镜像。 例如,可在Docker Hub获取bwa软件(用于将基因序列比对到参考基因组上)。 以下类型镜像,建议您通过Docker Hub获取,不建议自己制作。 基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。

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  • 获取可共享程序列表

    获取可共享程序列表 接口描述 获取当前操作系统可以被共享的程序窗口列表。 注意事项 前置条件:已经建立与OpenEye的WebSocket连接,且处于视频通话中。 方法定义 OpenEyeCall.prototype.getAppList = function(callbacks)

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  • nextval、currval在全局序列的使用

    nextval、currval在全局序列的使用 nextval返回下一个序列值,currval返回当前序列值。其中nextval可以通过nextval(n)返回n个唯一序列值。 nextval(n)只能单独用在select sequence.nextval(n)场景下并且不支持跨库操作。

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  • 创建CDL数据比较任务作业

    操作场景 数据比对即是对源端数据库中的数据和目标端Hive中的数据作数据一致性校验,如果数据不一致,CDL可以尝试修复不一致的数据。 当前数据对比任务支持手动全量任务比对。数据比对任务采用On Yarn的运行形态,比对结果会上传到HDFS目录。 数据比对目前仅支持基本数据类型比对, 不支

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  • NGS流程简介

    低质量Reads过滤 过滤低质量的测序Reads,得到Clean Reads。 基因组比对 将Clean Reads比对到参考基因组上,同时输出比对率、深度、覆盖度的统计信息。 基因组变异检测 基于上述比对得到的bam文件,通过GATK4做Variant Calling,输出变异检测结果。

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