什么是HPC-S² HPC解决方案服务 高性能计算（High-performance computing，简称HPC）是一个计算机集群系统，通过管理节点对计算任务进行分解，交给不同的计算节点进行计算，以此来解决大型计算问题。在科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。

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HPC简介 什么是HPC 高性能计算（High-performance computing，HPC）是一个计算机集群系统，它通过各种互联技术将多个计算机系统连接在一起，利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题，所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究

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创建HPC私有镜像 前提条件 创建镜像需选择E CS 系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像，需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1，选择启动方式为UEFI图2，否则系统无法启动。

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HPC场景下使用的弹性云 服务器 ，均绑定了云硬盘。 裸金属服务器（BMS） 为用户提供专属的物理服务器，提供卓越的计算性能，满足核心应用对高性能及稳定性的需求，结合了传统托管服务器的稳定性与云中资源高度弹性的优势。 对象存储服务 （OBS） 是一种基于对象的海量存储服务，为用户提供海量、低成本、高可靠、高安全的数据存储能力。

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描述 name 是 String nas 配置名 type 是 String nas 配置协议类型 url 是 String nas 配置 ip 表7 ConfigObsTarget 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String obs 配置名 type 是 String

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HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的，例如LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。

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基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题： 弹性云服务器场景最佳实践

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图解HPC解决方案 父主题： 简介

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HPC-S²与其他服务的关系 服务名称 HPC-S²与其他服务的关系 主要交互功能 弹性云服务器（ECS） 购买弹性云服务器创建HPC集群或使用已有弹性云服务器部署HPC集群。 创建弹性云服务器 虚拟私有云（VPC） 同一个HPC场景的云服务器，都位于同一个VPC中，并且需要使用

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MPI Intel MPI 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 2018-03-23 第四次正式发布。 增加 裸金属服务器场景典型应用 2017-12-15

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什么是代理服务器 代理服务器是网络信息的中转站。以云服务场景为例，源端服务器直接连接云服务并取得网络信息时，需发送请求信号给云服务，云服务收到请求后会把信息传送回源端服务器。代理服务器是介于源端和云服务之间的一台服务器，有了代理服务器之后，源端服务器不是直接访问云服务，而是向代理

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云弹性云服务器上完成基因测序HPC环境的部署。Slurm是一个开源、容错和高度可扩展的集群管理和作业调度系统，适用于大型和小型Linux 集群。 方案架构 该解决方案部署架构如下图所示： 图1 方案架构图 该解决方案将会部署如下资源： 创建三台弹性云服务器，自动部署HPC开源调度

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已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”，采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令，防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令，验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP

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在HPC集群上运行Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群（以CentOS7.3为例）上运行Intel MPI应用（l_mpi_2018.0.128版本）。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器，并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。

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在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题： 弹性云服务器场景典型应用

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STAR-CCM+运行需要提供一个集群中所有节点均可读取的算例输入文件，通常做法是将算例文件放到NAS存储中，华为云SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储，并针对HPC有优化，建议直接使用华为云SFS Turbo存放算例文件。 HPC仿真软件STAR-CCM+需要每个节点都安装，比较麻烦，可以

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在HPC集群上运行Platform MPI 操作场景 该任务指导用户在ECS集群（以CentOS7.3为例）上运行Platform MPI应用（以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例）。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器，并绑定了弹性IP进行登录。

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云服务竞争力 灵活弹性的高性能云服务器：部署HPC头节点和工作节点，提供H1、H2计算增强型、M2内存优化型的ECS计算实例，该计算实例类型是H系列和M系列针对HPC业务的增强型实例，承载该实例的物理服务器提供最为强劲的计算能力。H2类型云服务器会挂载本地NVMe PCIe SSD，最大提供3

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执行以下命令，生成可执行文件，假设在/home/linux目录下生成。 # mpicc hello.c -o spe_hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的，因此，如果更换了MPI版本，需要重新执行命令# mpicc hello.c -o spe_hello进行编译，生成新的可执行文件。

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已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时，需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件，HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本，例如，下载的HPC-X版本为：hpcx-v2

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