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Spectrum MPI

Spectrum MPI

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更新时间:2020/04/07 GMT+08:00

操作场景

本节指导用户安装和使用IBM Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。

其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下:

  • IBM Spectrum MPI 10.1.0.1 Eval for x86_64 Linux
    • Red Hat Enterprise Linux version 6.6及其之后的版本
    • Red Hat Enterprise Linux version 7.1及其之后的版本
    • SUSE Linux Enterprise Server version 11 SP4
    • SUSE Linux Enterprise Server version 12及其之后的版本
  • IBM Spectrum MPI 10.1.0.2 Eval for Power 8 Linux
    • Red Hat Enterprise Linux version 7.3及其之后的版本

前提条件

已配置弹性云服务器免密登录。

操作步骤

  1. 获取软件包。

    1. 获取IBM Spectrum MPI软件包。

      下载地址:https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3

      获取的软件包一般为两个,包括license和软件两部分,例如,获取的IBM Spectrum MPI软件包为:

      smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Sep15.x86_64.rpm

      ibm_smpi-10.1.0.3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm

    2. 下载需要的HPC-X工具套件。

      IBM MPI在EDR SR-IOV场景下的运行需要HPC-X提供的MXM库的支持,HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本,例如,下载的HPC-X版本为:hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-redhat7.3-x86_64.tbz。

      下载地址:http://www.mellanox.com/page/products_dyn?product_family=189&mtag=hpc-x

  2. 安装HPC-X工具套件。

    1. 1中下载的HPC-X压缩包上传至运行MPI的弹性云服务器内。
    2. 执行以下命令,解压HPC-X工具套件。

      $ tar xvf hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-redhat7.3-x86_64.tbz

    3. 执行以下命令,设置HPC-X环境变量。

      $ cd hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-redhat7.3-x86_64

      $ export HPCX_HOME=$PWD

  3. 安装IBM Spectrum MPI。

    1. 1中下载的MPI软件包上传至运行MPI的弹性云服务器内。
    2. 执行以下命令,切换至root用户。

      $ sudo su -

    3. 执行以下命令,设置环境变量。
      • 如果选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令:

        # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=yes

      • 如果选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令:

        # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=no

    4. 安装License部分。
      • 选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议的,执行以下命令:

        # rpm -ivh smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Sep15.x86_64.rpm

      • 选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议的,执行以下命令:

        # rpm -ivh ibm_smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Sep15.x86_64.rpm

        图1 手动接受IBM Spectrum MPI安装协议

        并根据界面提示,执行以下命令,运行脚本:

        # sh /opt/ibm/spectrum_mpi/lap_se/bin/accept_spectrum_mpi_license.sh

    5. 执行以下命令,安装软件部分。

      # rpm -ivh ibm_smpi-10.1.0.3eval_170901-rh7_Apr11.x86_64.rpm

      图2 安装软件

  4. 配置MPI环境变量。

    1. 默认情况下,Spectrum MPI会安装至“/opt/ibm/spectrum_mpi”目录。该场景下需要设置如下环境变量:

      export MPI_ROOT=/opt/ibm/spectrum_mpi

      export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib:$LD_LIBRARY_PATH

      export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH

      export MANPATH=$MPI_ROOT/share/man:$MANPATH

      unset MPI_REMSH

    2. 执行以下命令,查看环境变量导入是否成功。

      # which mpirun

      图3 查看环境变量

  5. 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。

    1. 执行以下命令,编辑文件。

      # cd

      # vi hello.c

      编辑内容如下:

      #include<mpi.h>
      #include<stdio.h>
      int main(intargc, char**argv){
      //Initialize the MPI environment
      MPI_Init(NULL, NULL);
      //Get the number of processes
      int world_size;
      MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);
      //Get the rank of the process
      int world_rank;
      MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);
      //Get the name of the processor
      char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
      int name_len;
      MPI_Get_processor_name(processor_name, &name_len);     
      //Print off a hello world message
      printf("Hello world from processor %s, rank %d"" out of %d processors\n",      processor_name, world_rank, world_size);
      //FinalizetheMPIenvironment.
      MPI_Finalize();
      }
    2. 执行以下命令,生成可执行文件,假设在/home/linux目录下生成。

      # mpicc hello.c -o spe_hello

      不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,因此,如果更换了MPI版本,需要重新执行命令# mpicc hello.c -o spe_hello进行编译,生成新的可执行文件。

    3. 执行以下命令,在单个ECS上运行Spectrum MPI。

      # mpirun --allow-run-as-root -np 2 /root/spe_hello

      系统回显如图4所示。

      图4 运行结果

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