通过DC和ER构建IPv6双栈混合云网络 您可以通过DC和ER构建IPv6双栈混合云网络，网络架构如图1所示，详细网络构建说明请参见表1。 图1 IPv6双栈混合云网络架构图(DC/ER) 表1 IPv6双栈混合云网络构建说明(DC/ER) 步骤 说明 1 云专线DC支持通过IP

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分子生成、属性预测、生物活性预测和分子优化等20多个药物发现任务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为，进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上，通过基本原理，构筑起一套模型和算法，从而计算出合理的分子

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分子生成、属性预测、生物活性预测和分子优化等20多个药物发现任务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为，进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上，通过基本原理，构筑起一套模型和算法，从而计算出合理的分子

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第四次正式发布。 新增： 支持分子搜索。 支持自定义数据库。 修改： 分子优化。 靶点口袋发现。 靶点口袋分子设计。 自由能微扰。 分子属性预测。 合成路径规划。 03 2023-12-30 第三次正式发布。 新增： 支持小分子聚类。 支持卡片视图，同时查看多个小分子。 修改： 导入应用的数量限制。

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获取最终租户 CSS 集群列表 创建分子或分子复合物批量下载任务详情 查询分子或分子复合物批量下载任务详情 创建数据库 删除数据库 更新药物数据库 数据库追加文件 获取数据库列表 查询分子搜索作业详情 更新药物作业 创建分子搜索作业 修改 下载文件 获取跨域归档配置 生成分子SVG图 获取分子优化作业详情

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苗头化合物发现 分子对接 分子属性预测 分子搜索 CPI预测 分子生成 父主题： 功能模块

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CS S集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 药物模型管理

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API（AI辅助药物设计） 分子生成（MG） 分子优化（MO） 靶点化合物结合预测（CPI） 分子属性预测（MPP） 分子搜索（MS） 分子合成路径规划任务（MSP） 自定义属性任务（MCP）

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根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情 父主题： API（盘古辅助制药平台）

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各账号VP CDM A网络络的连通性矩阵 日志账号是集中存放审计日志和运行日志的地方，主要使用了华为云的LTS服务和OBS服务，该两个服务没有租户面IP地址，所以不需要考虑与其他账号的VPC进行互通。沙箱账号是一个允许客户任意测试华为云上资源的地方，包括VPC的功能测试以及与其他账号之间连通性测试，所以也不

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Microsoft SQL Server、Oracle RAC、MySQL、华为云RDS。具体请参见跨云容灾的支持矩阵和使用限制和云上容灾的支持矩阵和使用限制的说明。

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基于公网NAT网关和云专线的混合云Internet加速 操作场景 用户本地数据中心（IDC）通过云专线接入虚拟私有云（VPC），若有大量的 服务器 需要安全、可靠，高速的访问互联网，或者为互联网提供服务，可通过公网NAT网关服务的SNAT功能或DNAT功能来实现。例如各类互联网、游戏、电商、金融等企业的跨云场景。

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配置 私网NAT网关 ，将业务VPC中的ECS私网地址转换成中转VPC中的中转IP（用户IDC信任的私网地址）。 图1 组网图 方案优势 混合云场景中，云上VPC与线下IDC互通时，需要将VPC内云主机实例的私网地址映射为受IDC信任的私网地址，以此来满足安全合规等要求。 约束与限制 IDC网段与中转VPC、业务VP

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口袋发现功能。 苗头化合物发现 在苗头化合物发现阶段，我们提供分子对接、口袋分子设计，分子属性预测功能，在分子对接中，我们预置了大量的分子库可供选择。 先导化合物优化 在先导化合物优化阶段，提供分子优化、靶点口袋分子设计（骨架跃迁、片段优化、片段连接、片段生成）、自由能微扰、合成路径规划功能。

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Summary流程 分子对接（molecular docking ）是分子模拟的重要方法之一，其本质是两个或多个分子之间的识别过程，其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。 在药物分子产生药效反应的过程中，药物分子与靶酶相互结合，首

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填写任务的基本信息，包括选择任务所属项目，研究的名称和描述。 图2 基本信息 选择配体分子和受体蛋白。 作业名称：自定义名称 。 类型：选择小分子化合物。 流程：选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子：配体分子文件，支持SMILES、SD SDF、PDBQT格式。 受体蛋

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Viewer工具支持查看蛋白质和小分子的3D结构。单击“立即使用”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。

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Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。该流程可以实现以下功能。 整合分子对接结果，生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象，用于可视化展示。 对配体分子进行注释，包括DrugBank编号、分类、化学式、X LOG P3、TPSA、靶点、Csp3比例、分子量、可旋转键数目。

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图3 靶点配置输入PDB ID 在配置页面输入分子信息，及配置相关参数。 输入方式：支持绘制分子、选择文件、手动输入。 绘制分子：只能绘制一个分子，能够输入分子的SMILES。 选择文件：选择分子文件，最多支持100万个小分子，且分子文件大小不超过2GB。支持SDF、MOL2、P

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MOL Editor Mol Editor工具可以查看小分子的2D结构，以及编辑分子结构。 单击“立即使用”，进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”，将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题： 通用工具

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合成路径规划基于盘古药物分子大模型，根据给定的目标分子，可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，可以在左侧绘制分子，也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。

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