受体口袋检测 - RecognizeDrugReceptorPocket
功能介绍
检测受体口袋,检测类型基于配体,基于氨基酸残基,自动检测,自定义和全局对接。
授权信息
账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/pocket
请求参数
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token | 是 | String | 参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
mode | 是 | String | 参数解释: 口袋识别的模式。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
receptor_file | 是 | ReceptorDrugFileReq object | 参数解释: 受体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
ligand_file | 否 | DrugFile object | 参数解释: 配体文件。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
residues | 否 | Array of strings | 参数解释: 残基列表。 约束限制: 当识别模式为残基时提供,残基数量范围为[1-32],残基长度为[4-16]个字符。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
source | 是 | String | 参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | 否 | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL需以pdb结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format | 否 | String | 参数解释: 文件格式。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 仅支持PDB。 默认取值: 不涉及 |
data | 否 | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
add_hydrogen | 否 | Boolean | 参数解释: 是否增加氢原子。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
source | 是 | String | 参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | 否 | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址 取值范围: 文件仅URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format | 否 | String | 参数解释: 文件格式。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
data | 否 | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
响应参数
状态码:200
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
mode | String | 参数解释: 口袋识别的模式。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
pockets | Array of DrugBoundingBoxDto objects | 参数解释: 口袋列表。 约束限制: 口袋数量范围为[1-10]。 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
请求示例
受体口袋识别,识别模式为AUTO,受体文件为test.pdb。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/pocket
{
"mode" : "AUTO",
"receptor_file" : {
"source" : "PRIVATE",
"url" : "project:/test.pdb"
}
} 响应示例
状态码:200
受体口袋检测成功响应。
{
"mode" : "AUTO",
"pockets" : [ {
"center" : [ 39.067, 26.472, 51.635 ],
"size" : [ 6.668, 8.465, 6.582 ]
}, {
"center" : [ 29.013, 37.992, 54.6 ],
"size" : [ 3.468, 2.754, 5.233 ]
}, {
"center" : [ 34.946, 18.73, 45.517 ],
"size" : [ 5.178, 6.133, 5.156 ]
}, {
"center" : [ 32.901, 33.444, 61.459 ],
"size" : [ 3.664, 4.93, 3.59 ]
}, {
"center" : [ 53.883, 17.701, 48.675 ],
"size" : [ 3.281, 2, 10.053 ]
}, {
"center" : [ 47.861, 17.39, 37.703 ],
"size" : [ 5.231, 2, 3.53 ]
} ]
} 状态码
状态码 | 描述 |
|---|---|
200 | 受体口袋检测成功响应。 |
错误码
请参见错误码。

