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更新时间：2025-07-08 GMT+08:00
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受体口袋检测

功能介绍

检测受体口袋，检测类型基于配体，基于氨基酸残基，自动检测，自定义和全局对接。

URI

POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/pocket

表1 路径参数

参数

是否必选

参数类型

描述

project_id

是

String

参数解释：

项目ID，您可以从获取项目ID中获取。

约束限制：

不涉及

取值范围：

仅支持字母、数字、中划线和下划线，长度为[1-128]个字符。

默认取值：

不涉及

eihealth_project_id

是

String

参数解释：

空间ID。

约束限制：

不涉及

取值范围：

仅支持字母、数字、中划线和下划线，长度为[1-128]个字符。

默认取值：

不涉及

请求参数

表2 请求Header参数

参数

是否必选

参数类型

描述

X-Auth-Token

是

String

参数解释：

用户Token。

Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。

约束限制：

不涉及

取值范围：

长度为[1-32768]个字符。

默认取值：

不涉及
表3 请求Body参数

参数

是否必选

参数类型

描述

mode

是

String

参数解释：

口袋识别的模式。

约束限制：

不涉及

取值范围：

  • AUTO：自动

  • GLOBAL：全局

  • LIGAND：配体

  • RESIDUES：残基

默认取值：

不涉及

receptor_file

是

ReceptorDrugFileReq object

参数解释：

受体文件。

约束限制：

不涉及

取值范围：

不涉及

默认取值：

不涉及

ligand_file

否

DrugFile object

参数解释：

配体文件。

约束限制：

不涉及

取值范围：

不涉及

默认取值：

不涉及

residues

否

Array of strings

参数解释：

残基列表。

约束限制：

当识别模式为残基时提供，残基数量范围为[1-32]，残基长度为[4-16]个字符。

取值范围：

不涉及

默认取值：

不涉及
表4 ReceptorDrugFileReq

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

参数解释：

受体数据源。

约束限制：

不涉及

取值范围：

  • EXTRANET：外部网络数据

  • PRIVATE：私有数据

  • PUBLIC：公共数据

  • RAW：源数据

默认取值：

不涉及

url

否

String

参数解释：

文件URL。

约束限制：

当数据源source为外部网络数据时为https地址，为用户私有数据中心时为空间路径，为公共数据场景时为obs地址。

取值范围：

文件URL需以pdb结尾，长度为[1-2000]个字符。

默认取值：

不涉及

format

否

String

参数解释：

文件格式。

约束限制：

当数据源source为RAW时提供。

取值范围：

仅支持PDB。

默认取值：

不涉及

data

否

String

参数解释：

文件原始数据。

约束限制：

当数据源source为RAW时提供。

取值范围：

长度为[0-10000000]个字符。

默认取值：

不涉及

add_hydrogen

否

Boolean

参数解释：

是否增加氢原子。

约束限制：

不涉及

取值范围：

  • true：增加氢原子

  • false：不增加氢原子

默认取值：

true
表5 DrugFile

参数

是否必选

参数类型

描述

source

是

String

参数解释：

受体数据源。

约束限制：

不涉及

取值范围：

  • EXTRANET：外部网络数据

  • PRIVATE：私有数据

  • PUBLIC：公共数据

  • RAW：源数据

默认取值：

不涉及

url

否

String

参数解释：

文件URL。

约束限制：

当数据源source为外部网络数据时为https地址，为用户私有数据中心时为空间路径，为公共数据场景时为obs地址

取值范围：

文件仅URL仅支持以.pdb、.mol2、.sdf、.smi为结尾，长度为[1-2000]个字符。

默认取值：

不涉及

format

否

String

参数解释：

文件格式。

约束限制：

当数据源source为RAW时提供。

取值范围：

  • PDB：PDB文件

  • SDF：SDF文件

  • MOL2：MOL2文件

  • SMI：SMI文件

默认取值：

不涉及

data

否

String

参数解释：

文件原始数据。

约束限制：

当数据源source为RAW时提供。

取值范围：

长度为[0-10000000]个字符。

默认取值：

不涉及

响应参数

状态码：200

表6 响应Body参数

参数

参数类型

描述

mode

String

参数解释：

口袋识别的模式。

约束限制：

不涉及

取值范围：

  • AUTO：自动

  • GLOBAL：全局

  • LIGAND：配体

  • RESIDUES：残基

默认取值：

不涉及

pockets

Array of DrugBoundingBoxDto objects

参数解释：

口袋列表。

约束限制：

口袋数量范围为[1-10]。

取值范围：

不涉及

默认取值：

不涉及
表7 DrugBoundingBoxDto

参数

参数类型

描述

center

Array of doubles

参数解释：

口袋中心坐标，x、y、z轴的坐标。

约束限制：

数组长度固定为3，数组元素大小取值范围为[-9999999-99999999]。

取值范围：

不涉及

默认取值：

不涉及

size

Array of floats

参数解释：

口袋尺寸大小，x、y、z轴的大小。

约束限制：

数组长度固定为3，数组元素大小取值范围为[2-500]。

取值范围：

不涉及

默认取值：

不涉及

请求示例

受体口袋识别，识别模式为AUTO，受体文件为test.pdb。

https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/pocket

{
  "mode" : "AUTO",
  "receptor_file" : {
    "source" : "PRIVATE",
    "url" : "project:/test.pdb"
  }
}

响应示例

状态码：200

受体口袋检测成功响应。

{
  "mode" : "AUTO",
  "pockets" : [ {
    "center" : [ 39.067, 26.472, 51.635 ],
    "size" : [ 6.668, 8.465, 6.582 ]
  }, {
    "center" : [ 29.013, 37.992, 54.6 ],
    "size" : [ 3.468, 2.754, 5.233 ]
  }, {
    "center" : [ 34.946, 18.73, 45.517 ],
    "size" : [ 5.178, 6.133, 5.156 ]
  }, {
    "center" : [ 32.901, 33.444, 61.459 ],
    "size" : [ 3.664, 4.93, 3.59 ]
  }, {
    "center" : [ 53.883, 17.701, 48.675 ],
    "size" : [ 3.281, 2, 10.053 ]
  }, {
    "center" : [ 47.861, 17.39, 37.703 ],
    "size" : [ 5.231, 2, 3.53 ]
  } ]
}

状态码

状态码

描述

200

受体口袋检测成功响应。

错误码

请参见错误码。

父主题： 药物通用接口

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