受体信息解析
功能介绍
受体信息解析,如果有多个受体蛋白则只处理第一个,如果一个受体蛋白里结合了多个配体,则最多只处理前10个。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|---|
project_id |
是 |
String |
参数解释: 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
eihealth_project_id |
是 |
String |
参数解释: 空间ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 仅支持字母、数字、中划线和下划线,长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
请求参数
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|---|
X-Auth-Token |
是 |
String |
参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 |
是否必选 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|---|
source |
是 |
String |
参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url |
否 |
String |
参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL需以pdb结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format |
否 |
String |
参数解释: 文件格式。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 仅支持PDB。 默认取值: 不涉及 |
data |
否 |
String |
参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
add_hydrogen |
否 |
Boolean |
参数解释: 是否增加氢原子。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
响应参数
状态码:200
参数 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|
residues |
Array of ResidueDto objects |
参数解释: 受体中的氨基酸残基列表。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
ligands |
Array of ReceptorLigandInfoDto objects |
参数解释: 受体中的配体列表。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|
chain |
String |
参数解释: 氨基酸残基或者配体链的名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
name |
String |
参数解释: 氨基酸残基或者配体名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-10]个字符。 默认取值: 不涉及 |
id |
Long |
参数解释: 氨基酸残基或者配体的序列ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-9999]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|
index |
Integer |
参数解释: 配体索引(从0起编号)。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-9 默认取值: 不涉及 |
name |
String |
参数解释: 配体名称,即配体所在的残基表示。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
success |
Boolean |
参数解释: 解析是否成功。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
smiles |
String |
参数解释: 分子SMILES表达式。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-512]个字符。 默认取值: 不涉及 |
formula |
String |
参数解释: 配体分子的化学式。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
structure |
LigandStructureDto object |
参数解释: 配体3D结构。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
bounding_box |
DrugBoundingBoxDto object |
参数解释: 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 |
参数类型 |
描述 |
---|---|---|
format |
String |
参数解释: 配体格式,即文件后缀名。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-5]个字符。 默认取值: 不涉及 |
compressed |
Boolean |
参数解释: 是否压缩。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: false |
data |
String |
参数解释: 结构数据。 约束限制: 如果压缩则需要解码、解压处理(ASCII Encode -> Base64 Decode -> GZip Inflate -> UTF-8 Decode),以得到原始字符串;如果未压缩则为原始字符串。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
请求示例
受体信息解析,如果有多个受体蛋白则只处理第一个,如果一个受体蛋白里结合了多个配体,则最多只处理前10个。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info { "source" : "RAW", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb", "format" : "PDB", "data" : "MODEL1.xxxxxxx.END" }
响应示例
状态码:200
受体信息解析响应。
{ "residues" : [ { "chain" : "", "name" : "BOX", "id" : 1 } ], "ligands" : [ ] }
状态码
状态码 |
描述 |
---|---|
200 |
受体信息解析响应。 |
错误码
请参见错误码。