受体信息解析 - ParseDrugReceptorInfo
功能介绍
受体信息解析,如果有多个受体蛋白则只处理第一个,如果一个受体蛋白里结合了多个配体,则最多只处理前10个。
授权信息
账号具备所有API的调用权限,如果使用账号下的IAM用户调用当前API,该IAM用户需具备调用API所需的权限,具体权限要求请参见权限和授权项。
URI
POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info
请求参数
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
X-Auth-Token | 是 | String | 参数解释: 用户Token。 Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-32768]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 | 是否必选 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
source | 是 | String | 参数解释: 受体数据源。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
url | 否 | String | 参数解释: 文件URL。 约束限制: 当数据源source为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为空间路径,为公共数据场景时为obs地址。 取值范围: 文件URL需以pdb结尾,长度为[1-2000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
format | 否 | String | 参数解释: 文件格式。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 仅支持PDB。 默认取值: 不涉及 |
data | 否 | String | 参数解释: 文件原始数据。 约束限制: 当数据源source为RAW时提供。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
add_hydrogen | 否 | Boolean | 参数解释: 是否增加氢原子。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: true |
响应参数
状态码:200
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
residues | Array of ResidueDto objects | 参数解释: 受体中的氨基酸残基列表。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
ligands | Array of ReceptorLigandInfoDto objects | 参数解释: 受体中的配体列表。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
chain | String | 参数解释: 氨基酸残基或者配体链的名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
name | String | 参数解释: 氨基酸残基或者配体名称。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-10]个字符。 默认取值: 不涉及 |
id | Long | 参数解释: 氨基酸残基或者配体的序列ID。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-9999]个字符。 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
index | Integer | 参数解释: 配体索引(从0起编号)。 约束限制: 不涉及 取值范围: 0-9 默认取值: 不涉及 |
name | String | 参数解释: 配体名称,即配体所在的残基表示。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
success | Boolean | 参数解释: 解析是否成功。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: 不涉及 |
smiles | String | 参数解释: 分子SMILES表达式。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-512]个字符。 默认取值: 不涉及 |
formula | String | 参数解释: 配体分子的化学式。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-128]个字符。 默认取值: 不涉及 |
structure | LigandStructureDto object | 参数解释: 配体3D结构。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
bounding_box | DrugBoundingBoxDto object | 参数解释: 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 约束限制: 不涉及 取值范围: 不涉及 默认取值: 不涉及 |
参数 | 参数类型 | 描述 |
|---|---|---|
format | String | 参数解释: 配体格式,即文件后缀名。 约束限制: 不涉及 取值范围: 长度为[1-5]个字符。 默认取值: 不涉及 |
compressed | Boolean | 参数解释: 是否压缩。 约束限制: 不涉及 取值范围:
默认取值: false |
data | String | 参数解释: 结构数据。 约束限制: 如果压缩则需要解码、解压处理(ASCII Encode -> Base64 Decode -> GZip Inflate -> UTF-8 Decode),以得到原始字符串;如果未压缩则为原始字符串。 取值范围: 长度为[0-10000000]个字符。 默认取值: 不涉及 |
请求示例
受体信息解析,如果有多个受体蛋白则只处理第一个,如果一个受体蛋白里结合了多个配体,则最多只处理前10个。
https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info
{
"source" : "RAW",
"url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb",
"format" : "PDB",
"data" : "MODEL1.xxxxxxx.END"
} 响应示例
状态码:200
受体信息解析响应。
{
"residues" : [ {
"chain" : "",
"name" : "BOX",
"id" : 1
} ],
"ligands" : [ ]
} 状态码
状态码 | 描述 |
|---|---|
200 | 受体信息解析响应。 |
错误码
请参见错误码。

